Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_024415.3
Sequence Length
2847 nt
GC Content
0.3983
GUGGGCGCCUGCGAGGGCUUGGGAGAGCAAGCCGCGGAGAGAACUUGAAGCCACCAUGGGAGAUGAAGAUUGGGAAGCAGAAAUCAACCCUCAUAUGUCUUCCUAUGUUCCCAUAUUUGAGAAGGAUAGGUAUUCUGGAGAAAAUGGAGACAAUUUUAACAGGACUCCAGCUUCAUCAUCAGAAAUGGAUGAUGGACCUUCUCGAAGAGAUCAUUUCAUGAAAAGUGGAUUUGCCUCUGGGCGGAAUUUUGGAAACAGAGAUGCUGGUGAGUGUAAUAAGCGAGAUAAUACAUCCACAAUGGGUGGUUUUGGAGUUGGAAAGAGUUUUGGAAACAGAGGUUUUUCAAACAGCAGGUUUGAAGAUGGUGAUAGCUCUGGUUUCUGGAGAGAGUCUAGUAAUGACUGCGAAGAUAAUCCAACACGGAACAGAGGGUUUUCCAAGAGAGGCGGCUAUCGAGAUGGAAAUAAUUCAGAAGCUUCAGGGCCAUACAGAAGAGGUGGAAGAGGUAGUUUCCGAGGUUGCCGUGGAGGAUUUGGUCUAGGAAGUCCAAAUAAUGACUUAGACCCAGACGAAUGUAUGCAGCGCACUGGUGGCCUUUUUGGUUCUAGAAGACCAGUAUUAAGUGGCACAGGUAAUGGUGAUACUUCUCAAAGCAGAAGUGGCAGUGGAAGUGAACGAGGUGGUUACAAAGGUUUAAAUGAAGAAGUAAUAACAGGCUCUGGAAAGAAUUCUUGGAAGUCAGAAGCAGAAGGAGGAGAAAGUAGUGAUACUCAAGGACCAAAAGUGACCUACAUACCCCCUCCUCCACCUGAGGAUGAGGACUCCAUCUUUGCACAUUAUCAGACAGGCAUAAACUUCGACAAAUACGACACUAUUCUUGUGGAAGUGUCUGGACAUGAUGCACCACCAGCAAUUCUGACUUUUGAAGAAGCUAAUCUCUGUCAGACACUGAAUAACAACAUUGCUAAAGCUGGUUAUACUAAGCUUACUCCUGUGCAAAAAUACAGUAUUCCUAUCAUACUUGCAGGACGAGAUUUGAUGGCUUGCGCUCAAACAGGGUCUGGGAAGACUGCGGCUUUUCUCCUACCAAUUUUGGCUCAUAUGAUGCAUGAUGGAAUAACUGCCAGUCGUUUUAAAGAGUUGCAGGAACCAGAGUGUAUUAUUGUAGCACCAACUCGAGAAUUGGUCAACCAGAUUUAUUUGGAAGCCAGAAAAUUUUCUUUUGGGACUUGUGUAAGAGCUGUUGUUAUAUAUGGGGGAACCCAGCUGGGACAUUCAAUUCGACAAAUAGUACAAGGCUGUAAUAUAUUAUGUGCUACUCCUGGAAGACUGAUGGAUAUCAUAGGCAAAGAAAAGAUUGGUCUCAAACAGAUCAAAUACUUAGUUUUGGAUGAAGCUGAUCGCAUGUUGGAUAUGGGUUUUGGUCCAGAAAUGAAGAAGUUAAUUUCUUGCCCAGGAAUGCCAUCAAAGGAACAGCGCCAAACCCUUAUGUUCAGUGCAACUUUUCCAGAGGAAAUUCAAAGGUUGGCUGCAGAGUUUUUAAAGUCAAAUUAUCUGUUUGUUGCUGUUGGACAAGUGGGUGGAGCAUGUAGAGAUGUUCAGCAGACCGUUCUCCAAGUUGGCCAGUUCUCAAAAAGAGAAAAGCUCGUUGAAAUUCUGCGAAACAUAGGGGAUGAAAGAACUAUGGUCUUUGUUGAAACUAAGAAAAAAGCAGAUUUUAUUGCAACUUUUCUUUGUCAAGAAAAAAUAUCAACUACAAGUAUUCAUGGUGAUCGGGAACAGAGAGAGCGGGAGCAAGCUCUUGGAGAUUUUCGCUUUGGAAAGUGCCCAGUUCUUGUUGCUACUUCAGUAGCUGCCAGAGGGCUGGAUAUUGAAAAUGUGCAACAUGUUAUCAAUUUUGAUCUUCCUUCUACCAUUGAUGAAUAUGUUCAUCGAAUUGGGCGUACUGGUCGUUGUGGGAAUACUGGCAGAGCAAUUUCCUUUUUUGAUCUUGAAUCGGAUAACCAUUUAGCACAGCCUCUAGUAAAAGUAUUGACAGAUGCUCAACAGGAUGUUCCUGCAUGGUUGGAAGAAAUUGCCUUUAGUACAUACAUUCCUGGCUUCAGUGGUAGUACAAGAGGAAACGUGUUUGCAUCAGUUGAUACCAGAAAGGGCAAGAGCACUUUGAACACAGCUGGGUUUUCUUCUUCACAAGCUCCCAAUCCAGUAGAUGAUGAGUCAUGGGAUUAAAGCCAAAACAUCCUUCAAGUCUGUGGUUUUGAUGCAGAGAAGAAAAUAGUUUUGAUUUUUGAGUUUUUAACAGAAGUAUAAAACUUAACAUUCUCAUAGCUCCUGUCCUUGUAUUCUCACUCCUACACUUAAAAAAAAAAUCCUUACUGACUAGUUAUGUGAGAUGCUAAAACUUACAACAUUGCAGUUACUGAUACAAAUGGUGUUAACUGGGAAUAUUAAAGCAUUCUAAAUGUCUUUCUUAUUUCUGGUAUAUUCUUUAGGGGGCUUAGACAUGUUUAAUGUUUAAAUGCCAAGUCUUACUAUAGUGUUUAUUGAUCUUAUAAAACAAGCAAAUAGGAUAUGAUACACUUUUGGUUAAAAAUUACUGGGUCUCAUUUUUACUUGAGUCUUUAAAACAGUAGUGUGUCACUAUAAUGUGAUAAUCUUUAAGAGAAAGUAGAAUACUUAAGCCUUUCAAAGUGAUUUUGAUUUUUAGAUCAUCAGAUGUAUGAUGAAAAUGGUUAAAUGUUUGUGAUGGGAGCUCUGUACUCAAUGGCAUAACAAUGUUUAUUUUUAUAAUAUACAAUCUUUCCUUGAAAUAAAGGAUGAAACACUUUUCCCUUAAGUUUUCCAUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-769.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -827.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 780.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((...((((((......)))))))))).((((((((((.......(((((((........(((((((((................)).)))))))..))))))).((((((((((...((..(((((..((((.((....)).))))..)))))..))...(((((((((.......)))))))))))))))))))((((...))))..((((((((..((((((....))))))..((((....)))).((((((.((((((((...............((((((...))))))(((((.(((((((...((.(((((....))))).))((((((((.....))))))))((((((((((((((((((((((.(...(.(((...((((((((.(.((.((.((((.((.......(((...((((((...((........))....))))))...)))....((.(((((((((........(((.(((((((((((((((((.((...)).))))..((((((.((....)).))))))...........(((((((...(((.((.((((((((((.((((.....)))))))).......(((((.....(((((((..........((((((......))))))(((((((....(((((....((....))...)))))................(((..(((((..(((.((((((((((((((((.(((..(((((((...((((((.((((...........))))...))).)))...)))))))..)))((((((.......))))))(((((((..((((((........(((((.((((..............)))).)))))))))))..))).))))..........))))))))))).))))).......))).)))))..)))........))))))).((((((((...))).)))))...)))))))...))))).......((((((..((((.....))))...))))))..)))))))).)))..)))))))..))))))..))))))))))........))))))...))).)).)).)))).)).)).)))))))))....))).)).))))))))))))).)))))))))....))))))).))))).(((...(((((....)))))..)))((((....)))).((((((((((((.((((................(((((((((((((((..((.....(((.....(((((.....))))).........(((((((....(((.....((((((...((...(((((.((((...(((((((.....)))))))....(((.((((((((.((...((((.(((((...))))))))))).)))))))).))).........)))))))))...))...))))))((((((..((((((..(((..(((.(((((((.(((((.((((((((((.((.....((((((.............))))))....(((((((....((((((((((..((.(((...))).))....)))))))))).(((.((.(((((((((....((((.....(((((((((.(((.((((((.((((....(((((............))))).((((.((....)).)))).....)))))))))).)).).)))))))))....))))......))))))...........))).)).))))))))))((((((........))))))...)).)))).)))))))))))(((((((((..((.(((((....))))).)).((((((..(((((((((.((((((...)))))).)))))....)))).))))))......((((((....)))))))))))))))))))))).)))...))).....))))...))...)))))).((((((.....))))))...)))..)))))))(((.((.......((((((((.(((((..((((.(.(.((((.((...)).)))).).....(((((.((((.(((....(((....)))..))))))).)))))...).)))).))))).)))))))).....)))))..))).....))..).)))))))))))))))))))))))).))))))........((((....)))).(.((((((((((..((.........))...)))))))))).).(((((......((((((((((((((.........))))))).))))))).....)))))..((((((((((...(((((((.(((......((((((........(((((.(((((.((..((((((.........)))))).....))))))).((((((.....))))))((((((((((..((((((((...)))).))))..))))))))))........)))))(((((((((((.....))))))))..))).......((((.(((((......(((((((...........))))))).....)))))..)))).....(((((((((.((((........)))).))......))))))).((((((......))))))...))))))....))))))))))...(((((((((..(((..((((((.........))))))..)))..)))))..))))..........)))))))))).)))))))).)))))).....(((.((((.....)))).))).((..(((((......))))).))..))))))))..))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{{....(({({..((((((......))))))}))},|{((((((((.,.....(((((((,.,,,,,,(((({{({{..........,.....}),)))))}}..))))))).((((((((((...((..(((((..((((.((....)).))))..)))))..))...(((((((((.......))))))))))))))))))){{({...,}))..((((((((..((((((....)))))}.,((((....)))),(((((,.(((((({,.....,,,,,.....((((({...}))))){((((.(((((((.,{((.(((((....))))).))||((((((.....))))))},((((((((((((((((((((((.{...{.(((...((((((((.{.{(.((.((((.({.,.,...{{{,..{{(({{...{({....|,.}}....}}}}}}...)))....((.{({((((((........(((.(((((((((((((((((.((...)).)))),.((((((.((....)).))}}}}...........(((((((...(((.((.((((((((((.((((.....)))}}}}}...,}},(((({.....(((((((....({{,..((((((......)))))}(((((((...,({{,,..{{((.,,{||.,,|||,..........{{.....{{{,,{||{,..{{,.((((({(((((((((({(((..(((((((...((({,{.||||...,,......,))).}})}).,,,..,|||}||}..}}}{|||{|.|,.,,})}))))|||{{{{.,((({,(({{{....{((((.((((,,{......,}},.)))).)))))))))),..})),))},......,,..))))))))))).))))).,,.,))),},)})},}}))}....,}..))))))).{(((((({...})),}))))}}})))))))...}}))).......((((((.,((((.....)))).,.))))))..)))))))).)))..)))))))..))))))..))))))})))........))))))...))}.}).}).)))).)).)).}))))))))....))).)).))))))))))))).)))))))))....))))))).)))}}((((...(((((....}))))..)))}{,,..,,})),.{(((((((((((.(((({{....,,.......,((((((((((((((,,....,,...,,.,...,{{,{,,.,{{{|||..........(((((..((((,......((((((.,.((...(((({{((((...(((((((.....)))))))...{((,.((((((((,(((((.(((.{......}}}}},)))))).)))))))).}.},,.......)))))))))...)).,.)))))).))))..))))),...((({{{(((((((({({(((((({(,{{||||,,||,,}}}||||||{(((({{{{{...||||||{{..{{{}||||,,,({{{(((({{,,(({{({{{{{|{.,,...}))))),})}|,|||||{|||||,,||||..,(((((.....))}}}..})},,,,|}}}}})}))},,}}}}})))).........||}}}|}}||||||||.,|.{{{{{{,..((({......,)))...))))))}.,},,,,},....,,||||||....},,,}}}}}}}||||||||,||||{{||{{{{{{|...|||||}|,,|{{||||,|,,|||}}|||(((((((((,.((.(((((....))))).}}.{||||||,((,((((((.,{{(((,,,||||||.|||}}....)}||,||}}||,,{{,,((((({....})))))))}})))}},||||{{,}|{,|||||||}.||,,,}},})...))))}},||||.|,|||,||}||....}}}}.}},})))))}}}}}}}}..,(((((,,,.|||||}.,{(({(,..,|||}}..}}),.))))}}..,,.(((((.((((.(((....(((....))).,))))))).))))).,})})))},))))}.})))))))},..,{||||....)).)}}))},}.)))))))))))))))))))))))).)))))),{{|...{{(,,...})),}}|,((((((((({..,{,..,.....},.},)))))))))).}.(((((......((((((((((((((.........))))))).))))))).....)))))..{((((((((({..(((((((.(((..,.,.{{{{,,........,,,,({((.{,,((..((((((.{.......))))))..,},}))))...((((((.....))))))((((((((((..((((((({...}))).))))..))))))))))....,,,,|||||(((((((((((.....))))))))..))).......((((.(((((,{{{..(((((((...........))))))),,}}.)))))..)))).....(((((((((.((((........)))).))......))))))).((((((......))))))..|}}}}})}),.}))))))))),,.{{{{{{{((,,(({,,(({{{{.....,,||}|||}}..}}),,)))}|,.}})}........}.)))))))))).,})))))).}))))).....{((.((({.....)))).))}.|{..(((((......))))).}}..))))))))..))))))))))},,.
Back