Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_024850.3
Sequence Length
2147 nt
GC Content
0.5147
AGAACAGCGCAGUUUGCCCUCCGCUCACGCAGAGCCUCUCCGUGGCUUCCGCACCUUGAGCAUUAGGCCAGUUCUCCUCUUCUCUCUAAUCCAUCCGUCACCUCUCCUGUCAUCCGUUUCCAUGCCGUGAGGUCCAUUCACAGAACACAUCCAUGGCUCUCAUGCUCAGUUUGGUUCUGAGUCUCCUCAAGCUGGGAUCAGGGCAGUGGCAGGUGUUUGGGCCAGACAAGCCUGUCCAGGCCUUGGUGGGGGAGGACGCAGCAUUCUCCUGUUUCCUGUCUCCUAAGACCAAUGCAGAGGCCAUGGAAGUGCGGUUCUUCAGGGGCCAGUUCUCUAGCGUGGUCCACCUCUACAGGGACGGGAAGGACCAGCCAUUUAUGCAGAUGCCACAGUAUCAAGGCAGGACAAAACUGGUGAAGGAUUCUAUUGCGGAGGGGCGCAUCUCUCUGAGGCUGGAAAACAUUACUGUGUUGGAUGCUGGCCUCUAUGGGUGCAGGAUUAGUUCCCAGUCUUACUACCAGAAGGCCAUCUGGGAGCUACAGGUGUCAGCACUGGGCUCAGUUCCUCUCAUUUCCAUCACGGGAUAUGUUGAUAGAGACAUCCAGCUACUCUGUCAGUCCUCGGGCUGGUUCCCCCGGCCCACAGCGAAGUGGAAAGGUCCACAAGGACAGGAUUUGUCCACAGACUCCAGGACAAACAGAGACAUGCAUGGCCUGUUUGAUGUGGAGAUCUCUCUGACCGUCCAAGAGAACGCCGGGAGCAUAUCCUGUUCCAUGCGGCAUGCUCAUCUGAGCCGAGAGGUGGAAUCCAGGGUACAGAUAGGAGAUACCUUUUUCGAGCCUAUAUCGUGGCACCUGGCUACCAAAGUACUGGGAAUACUCUGCUGUGGCCUAUUUUUUGGCAUUGUUGGACUGAAGAUUUUCUUCUCCAAAUUCCAGUGUAAGCGAGAGAGAGAAGCAUGGGCCGGUGCCUUAUUCAUGGUUCCAGCAGGGACAGGAUCAGAGAUGCUCCCACAUCCAGCUGCUUCUCUUCUUCUAGUCCUAGCCUCCAGGGGCCCAGGCCCAAAAAAGGAAAAUCCAGGCGGAACUGGACUGGAGAAGAAAGCACGGACAGGCAGAAUUGAGAGACGCCCGGAAACACGCAGUGGAGGUGACUCUGGAUCCAGAGACGGCUCACCCGAAGCUCUGCGUUUCUGAUCUGAAAACUGUAACCCAUAGAAAAGCUCCCCAGGAGGUGCCUCACUCUGAGAAGAGAUUUACAAGGAAGAGUGUGGUGGCUUCUCAGAGUUUCCAAGCAGGGAAACAUUACUGGGAGGUGGACGGAGGACACAAUAAAAGGUGGCGCGUGGGAGUGUGCCGGGAUGAUGUGGACAGGAGGAAGGAGUACGUGACUUUGUCUCCCGAUCAUGGGUACUGGGUCCUCAGACUGAAUGGAGAACAUUUGUAUUUCACAUUAAAUCCCCGUUUUAUCAGCGUCUUCCCCAGGACCCCACCUACAAAAAUAGGGGUCUUCCUGGACUAUGAGUGUGGGACCAUCUCCUUCUUCAACAUAAAUGACCAGUCCCUUAUUUAUACCCUGACAUGUCGGUUUGAAGGCUUAUUGAGGCCCUACAUUGAGUAUCCGUCCUAUAAUGAGCAAAAUGGAACUCCCAUAGUCAUCUGCCCAGUCACCCAGGAAUCAGAGAAAGAGGCCUCUUGGCAAAGGGCCUCUGCAAUCCCAGAGACAAGCAACAGUGAGUCCUCCUCACAGGCAACCACGCCCUUCCUCCCCAGGGGUGAAAUGUAGGAUGAAUCACAUCCCACAUUCUUCUUUAGGGAUAUUAAGGUCUCUCUCCCAGAUCCAAAGUCCCGCAGCAGCCGGCCAAGGUGGCUUCCAGAUGAAGGGGGACUGGCCUGUCCACAUGGGAGUCAGGUGUCAUGGCUGCCCUGAGCUGGGAGGGAAGAAGGCUGACAUUACAUUUAGUUUGCUCUCACUCCAUCUGGCUAAGUGAUCUUGAAAUACCACCUCUCAGGUGAAGAACCGUCAGGAAUUCCCAUCUCACAGGCUGUGGUGUAGAUUAAGUAGACAAGGAAUGUGAAUAAUGCUUAGAUCUUAUUGAUGACAGAGUGUAUCCUAAUGGUUUGUUCAUUAUAUUACACUUUCAGUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-769.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -809.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 585.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((....(((.(((((((((((.(((..(((...((.(((((((((.....((.....((((((((((((((((.(((.......((((.((((((((....((((.(((((..((((((.(((((.....)))))....(((.((((((((.(((.((((((((((((............))))))))).((((((((..(((((((((((((...)))))..))))).))).))))))))(((((((((.((((.......)))).)))).)))))..........)))))))))))))).))).((((((...)))))).........)))))).((((((((.(((((((((...(((((..((((((.(((.(((((....)))))....(((.......)))((((.(((......((.((((((((((((((....((((((((..(((((....))))).....))))))))...)))))).(((.....)))...........(((((......)))))(((((.(((((....)).)))))))).))))))))))..))).))))(((((....((((((((...........))))))))))))).(((((((.....)))))))...)))))))))...)))))....(((((.....))))).(((((((((.(.(((((((.(.((....)).)))))))).).))))).....)))).))))))..(((((.(((((((((((((((((((((.(((.....((((....)))).((((((((...(((............)))..))))))))..(((((........((((((.((((.(((......))).....((((.((.(.((.(((...((((.....(((((..(((((...))))))))))...)))).))).)).).)))))).......))))))))))........)))))..))))))))))))).....))))))))...(((.(.(((((.((((((.(((((((...((.((..((((....))))......(((...))).)).))....))))))))))))))))))))))(((((((((.((((((.(...(((...(((...)))(((.((.(((((....))))).)).)))..)))..))))).)).))))).))))....((((.....))))...(.((((...)))).)(((.((((((...................)))))).)))))))))))...((((((......))))))....)))))))))))))))).)))).......)))))))).))))(..(((..(((((((((.(((...(((((((((.(..((((...(((((((..((((.((((((((((((.....((..((((((.((.....(((.....))).....)).))))))..))...((((.....((((((((.............))))))))...)))).((((.(((((((((((......((((((......((((..(((...............)))..))))..))))))(((((((((((.(.(((.....)))...).))).))))))))...))))...))))))).))))..))))))).))))).).))).((...(((((((.(((....))))))))))....))...)))))))((....(((((.....)))))..))...))))))))))))))..(((((...(((((.(((((.....))))).))))))))))..((((((......))))))...))).)))....))))))..)))..)(((((...)))))...))).).)))))))))))))))....))))))))))).).)....))))))..)))))..)))))).)))..))))...((((((((.(((((((.((((.((((..((((..((((((((((.....(((((...)))))........)))))).........)))).)))))))).)).))...)))))))...))))))))...............((((((.....(((((((...((((((.....))))))...))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((.,..(((.(((((((((((.((,.{(((...((.(((((((((.....{(.|,..(((((((((((((((({(((,{....(((.(((((((((((,({,((,{{,.((((((.((({(((((,,.,.|||}|.,..(((.((((((((.(((.(((,{{({((((,,,{,{,....,,}},}}))))((((((((..{((((((((((((...))))),.})))),))}.))))))))(((({((((.((((.......)))).)))).))))),..,,,,,,.)))))))))))))).))).(((|(({{.,((((((((..{{{{||.||||||.(((((....))).))},,))))),{{,.....,||.(((((....)))))..,))}|,.....,},|||||,|,,{{{{{,,.((((((({.,..|}}}}}}}.{|,|||}},,|,|,,,,)))))}}}.}))))))|((((((((((((...{{((((((((((({.,,.,,{{|,}....,))))}|||},{{(((((({...,((((({{.{{.{((((({.{(({.....{|||,.,,,((((((((...........))))))))}||||.(((((((.....)))))))........(((((....}))))..(((((|...})))))...{{(((((.{.(((((((.{.(,....}).}))))))).}.))))).}}{(((({......|.})))}..((((((((((,,,,,||||||.,,|}}}..((((....)))).|{{{||{{,..,{{,,||,,,.....|||,.}})))}})}}}||||},.....})))}||}||||.{,.,}}.}})))}},}.(((({(({,{((({{{,,,{{((((({{(((((..(((((...})))))))))...|}}}|}}..,},},}}}},,..,,,}}))))}|}|||........)))}})}))))))}}|||||{{{{{||||}}||...{((.,.(((((.((((({{(((((((..,((.((..((((....))))......(((...))).)).))....)))))))))))))))))),))),.))}.}}}.}}||||,|}}}|{|...,{{{,,|}|{,(|((,(((((....))))).||.})),,)}}..,)}))))))))))))))),....)))),})))))))}....{{{{.},))))}})))}}{((((((((((..,,(((((........))))),..))))))))))},,,,..}}}.)))))).,.}).)))))))}})))))))),,........,}}|(({{{{{{{{.{,{{{,((((,((,.,(({,.(((((((((.{,.{(((..,(((((((..((((.((((((((((((....,((({((((((.((.....(((.....))).....)).))))},..})}}.|,,,...((((((((((...,.........)))),..})))))...((((.(((((((((((......((((((..,..,((({..{{{...,,,,,,,.....)}}..})))},))))))(((((((((((,,.(((.....)))...).))).))))))))...))))...))))))).))))..))))))).))))).),,)).{{...(((((((.(((....))))))))))....}}...)))))))|,....(((((.....))))).,}}...)))))))))))))){,{((((.({(((((.(((((.....))))).)))))).))))},|||{{......)))))),}))),,,,},,.,,)))))).)).||}{{({,...)))))...))).))))))))))))))))),.,...})))))))),).)....))))))..)))))..)))))).}},.,))))...((((((((.(((((((.((((.((({..((((..((((((((((.....(((((...)))))........)))))).........)))).)))))))).)),)}...}))))))...)))))))}....,,,,....,,|((((((.....(((((((...((((((.....))))))...))))))))))))).
Back