Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032545.4
Sequence Length
1672 nt
GC Content
0.5604
AGUCCCCACCCCCCAGCCAGGUCUCAUAGAGGGAAUUGUUCUUCAGGCUCGGAGGGGCCUGCCUGUCACUGCGCCCCCGACCCUAGCUCAGGGACUGCAGAACUCAAGAUACCAUCCCGUUUCUCCUGGCUGAGGAAGGGAAGGGAACAUCCACAUCUUCUGUACUCGUCCAUUCUGUGUCCCCGGGGCCUGGAGUAAAGACACCUUCAAAUGCAGAGACUCUUCAGAUUCAGCUUUCCUGGAAACUGAUCUUCAAUGCACUAAGAGAAGGAGACUCUCAAACCAAAAAUGACCUGGAGGCACCAUGUCAGGCUUCUGUUUACGGUCAGUUUGGCAUUACAGAUCAUCAAUUUGGGAAACAGCUAUCAAAGAGAGAAACAUAACGGCGGUAGAGAGGAAGUCACCAAGGUUGCCACUCAGAAGCACCGACAGUCACCGCUCAACUGGACCUCCAGUCAUUUCGGAGAGGUGACUGGGAGCGCCGAGGGCUGGGGGCCGGAGGAGCCGCUCCCCUACUCCCGGGCUUUCGGAGAGGGUGCGUCCGCGCGGCCGCGCUGCUGCAGGAACGGCGGUACCUGCGUGCUGGGCAGCUUCUGCGUGUGCCCGGCCCACUUCACCGGCCGCUACUGCGAGCAUGACCAGAGGCGCAGUGAAUGCGGCGCCCUGGAGCACGGAGCCUGGACCCUCCGCGCCUGCCACCUCUGCAGGUGCAUCUUCGGGGCCCUGCACUGCCUCCCCCUCCAGACGCCUGACCGCUGUGACCCGAAAGACUUCCUGGCCUCCCACGCUCACGGGCCGAGCGCCGGGGGCGCGCCCAGCCUGCUACUCUUGCUGCCCUGCGCACUCCUGCACCGCCUCCUGCGCCCGGAUGCGCCCGCGCACCCUCGGUCCCUGGUCCCUUCCGUCCUCCAGCGGGAGCGGCGCCCCUGCGGAAGGCCGGGACUUGGGCAUCGCCUUUAAUUUUCUAUGUUGUAAAUAAUAGAUGUGUUUAGUUUACCGUAAGCUGAAGCACUGGGUGAAUAUUUUUAUUGGGUAAUAAAUAUUUUCAUGAAAGCGCCUUUGGCUCCAGAUCCUUGGGAGAGGGACACGUGUGUCCCCAGCACCACUGUGACCGGUAGGUAGAGACAGCAGAACAACAGCGAGAAGGAGCCAAAGCUGGAGCCAGAAAGCCUGGCACCGCCACCUUCCCCUGACAGUUAGCACCUUCCUUUCACAACAUCUCCCUUAAGGGGGAAGCGUCUGCUGUGGAACCCACCGCAAGGCAACGCAGGCAGAGUUCAGCCUGAAGAGCGCCAGGCCAGCCUCCUCUGUCUUCCGAGCACCGCUUCUCAGGUCGCUUCCCAAUCUGAGGAGGCUGUCGUGUCCACAACCAGUCCAGGGGGAUGUGCGCCACUAGCUGAGGACGCCAGGCCCGGCGACACCACAAAGGCUUGGCCAUGCGGAAUGUGCCCUCAAGAGCACACACUUCGGGUAGAGGGCACUUGCAUUGAGCUCUUCAGCUUUUUAAAUCCACUGUAGUUCAUGAGCCUGUGUGACAUAAUUACUUUUACAUUUUAUAUUGUCAAUUAGUUUAUUGGCAUUUUCAAUCUUUUCAACUAUUGGCUAUGAAAAUAUGAAUUUAACGUAACAUUCAAAUGAGUAUUAAAGAAAAAUAAAGUAGAACUUCAUUAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-609.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -641.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 444.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((..(((((((((((((......((.((((.....(((((((((((....))))))).......(((((..(((............)))..))))).....)))).....)))).))...)))))))).))..)))..)))).........((((..((((((((.......(((((.(((((.(((((.((.......(((((...(((.....(((((..(((..((((((((((((...((((((..(((((.....((((.(....)))))....((((..((((((((((((..........))))))).....))))).)))))))))..))))))....))))))))..))))))).)))))(((((..(((.((((((...(((...((.((....)).))..)))....((.((..((((((((.(((.(((((....))))).......))).)))))))))).)).((((((((((((((..((.((((...))))))..))))).))))))))).((((((((((..(((((.(((.((....((((((..((((((.(..(.((((.(((((((....((((((.((((((...((....(((((((....))((((.((....(((((.(((.((((((((.(((((((((...((((........))))((((((((.......))))))))..))))))))).)))))...........(((((.((......))))).))..........))))))))))).)).))))...))))))).)))))).))))))................))))))).)))).)....).)))))))))))))).))).)))))..)))))))))).((((..((((((....(((.(((.(((((.((...)).)))))))).))).)))))).)))))))))).)))..))))).((((((..........(((.((((.(((((((..(((((((((.((..(((((.((.((((((....)))))).)).)))))...)).).))))))))((((....))))....((((((....))))))...(((....)))..))))))))))).))).....))))))))).)))))..((..((((((.(((((.....)))))...(((((.((((((((((.....((.(((((...........((((((....)))))).((((.((((((((......))))..))))))))((((........)))))))).).))((.(.((((((((((........(((((((........))).))))........)))))))))).).))..........)).)))))))).))).))..))))))..)))).)))))))))).)))))((((.((((((....((((((...((((((((....................))))))))))))))((((((...(((.............))).)))))).)))))).)))).........................(((((((......)))))))..((((...((((((...........))))))..)))).................))))))))..))))........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((((..(((((((((((((......{{.((((...,,((({(((((((....)))))))...,...(((((.,(({{{.......}}.)))..))))).....)))).,...)))).}}...)))))))).))..)))..)))}.,.......((((..((((((((.......(((((,(((((({((((.((...,.,.{{(((...,{,.,...(((((..(((..((((((((((((...((((((..(((((.....((({,(....)))))....((((..((((((((((((.,.......,))))))).....))))).)))))))))..))))))....))))))))..})))))).}})))||,,,..{{{.((((((.(((,((,,{{{,,...|||,|}|.}}}....((.((..((((((((.(((.(((((....))))).......))).)))))))))).)).((((((((((((((..((.((((...))))))..))))),))))))))).((((((((((..(((({.(((.({.,,.((((((..((((((....(,({((,(((({((.,{,((({((,({((((,,.,.....,,(((((....|}|.||.||..{{(.(((((|({,...}}|))||||||((({..((((((.(({...,..((((((((.......)))))))).,{{{{(((||.,.||.,.||.{{....,,{{|,,|}..,..,))}).}.})}}}},},..))).))}})))...))))..))))}),),)))))),)))))),,}},..,,.......)}})}}}.)))),}....).)))))))))))))).))).}))))..)))))))))),({(((.((((((..{{{(({{{(.(((((.((...)).)))))))).))}.)))))).)))})})))).},,..,,|||{(,,{,...,..}}}}}.(({(((((((((...})))))}}}|)}|{.,{((((.{{.((((({....})}))).)).))))),,,}}.},||||||||{(|,.,||}|||}.,.((((((....)))))),..|,||,{{||,,,|}},.))),.,.}}}||..,,,.,|||,|.|,,}}||||,,||||((.(((((.....))))).))(((((.((((((((((.{{,.{{,{||,|,..........((((((....)))))).((((.((({((((...,,,)})),.}))}}})|((((........)))}},,,.|,}}|||||((((((((((.,......(((((((........))).))))......,.)))))))))).}}))}....,,}..)),}))))))).))).))..,,|||||||||},|}}||||}}}.}}}}){{{{.{{|||{|},,{(((((...((((((((..{{{.......,,,.....))))))))}))))}||{|{|,,,|||}}...........))),}}}}}||}})))).})))............,,,..,,{{,,,.,((((((.,,,,.}}}||}|....,|,,,,..,.},}}}}}))},}))))},,.{({{{.,.....,,.}}}}}.))))))))..))))..,,,.{{{{...}}}}.,,,...
Back