Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032571.5
Sequence Length
2349 nt
GC Content
0.4717
AGGAAAGGUGGUUGGCUUACGGCACAGUAGAGAGCUUCCAGGGCUGGCUGGCGUGGGAUACCCGUACCACAGAAAUGCAGGGACCAUUGCUUCUUCCAGGCCUCUGCUUUCUGCUGAGCCUCUUUGGAGCUGUGACUCAGAAAACCAAAACUUCCUGUGCUAAGUGCCCCCCAAAUGCUUCCUGUGUCAAUAACACUCACUGCACCUGCAACCAUGGAUAUACUUCUGGAUCUGGGCAGAAACUAUUCACAUUCCCCUUGGAGACAUGUAACGACAUUAAUGAAUGUACACCACCCUAUAGUGUAUAUUGUGGAUUUAACGCUGUGUGUUACAAUGUCGAAGGAAGUUUCUACUGUCAAUGUGUCCCAGGAUAUAGACUGCAUUCUGGGAAUGAACAAUUCAGUAAUUCCAAUGAGAACACCUGUCAGGACACCACCUCCUCAAAGACAACCGAGGGCAGGAAAGAGCUGCAAAAGAUUGUGGACAAAUUUGAGUCACUUCUCACCAAUCAGACUUUAUGGAGAACAGAAGGGAGACAAGAAAUCUCAUCCACAGCUACCACUAUUCUCCGGGAUGUGGAAUCGAAAGUUCUAGAAACUGCCUUGAAAGAUCCAGAACAAAAAGUCCUGAAAAUCCAAAACGAUAGUGUAGCUAUUGAAACUCAAGCGAUUACAGACAAUUGCUCUGAAGAAAGAAAGACAUUCAACUUGAACGUCCAAAUGAACUCAAUGGACAUCCGUUGCAGUGACAUCAUCCAGGGAGACACACAAGGUCCCAGUGCCAUUGCCUUUAUCUCAUAUUCUUCUCUUGGAAACAUCAUAAAUGCAACUUUUUUUGAAGAGAUGGAUAAGAAAGAUCAAGUGUAUCUGAACUCUCAGGUUGUGAGUGCUGCUAUUGGACCCAAAAGGAACGUGUCUCUCUCCAAGUCUGUGACGCUGACUUUCCAGCACGUGAAGAUGACCCCCAGUACCAAAAAGGUCUUCUGUGUCUACUGGAAGAGCACAGGGCAGGGCAGCCAGUGGUCCAGGGAUGGCUGCUUCCUGAUACACGUGAACAAGAGUCACACCAUGUGUAAUUGCAGUCACCUGUCCAGCUUCGCUGUCCUGAUGGCCCUGACCAGCCAGGAGGAGGAUCCCGUGCUGACUGUCAUCACCUACGUGGGGCUGAGCGUCUCUCUGCUGUGCCUCCUCCUGGCGGCCCUCACUUUUCUCCUGUGUAAAGCCAUCCGGAACACCAGCACCUCACUGCAUCUGCAGCUCUCGCUCUGCCUCUUCCUGGCCCACCUCCUCUUCCUCGUGGGGAUUGAUCGAACUGAACCCAAGGUGCUGUGCUCCAUCAUCGCCGGUGCUUUGCACUAUCUCUACCUGGCCGCCUUCACCUGGAUGCUGCUGGAGGGUGUGCACCUCUUCCUCACUGCACGGAACCUGACAGUGGUCAACUACUCAAGCAUCAAUAGACUCAUGAAGUGGAUCAUGUUCCCAGUCGGCUAUGGCGUUCCCGCUGUGACUGUGGCCAUUUCUGCAGCCUCCUGGCCUCACCUUUAUGGAACUGCUGAUCGAUGCUGGCUCCACCUGGACCAGGGAUUCAUGUGGAGUUUCCUUGGCCCAGUCUGUGCCAUUUUCUCUGCGAAUUUAGUAUUGUUUAUCUUGGUCUUUUGGAUUUUGAAAAGAAAACUUUCCUCCCUCAAUAGUGAAGUGUCAACCAUCCAGAACACAAGGAUGCUGGCUUUCAAAGCAACAGCUCAGCUCUUCAUCCUGGGCUGCACAUGGUGUCUGGGCUUGCUACAGGUGGGUCCAGCUGCCCAGGUCAUGGCCUACCUCUUCACCAUCAUCAACAGCCUCCAAGGCUUCUUCAUCUUCUUGGUCUACUGCCUCCUCAGCCAGCAGGUCCAGAAACAAUAUCAAAAGUGGUUUAGAGAGAUCGUAAAAUCAAAAUCUGAGUCUGAGACAUACACACUUUCCAGCAAGAUGGGUCCUGACUCAAAACCCAGUGAGGGGGAUGUUUUUCCAGGACAAGUGAAGAGAAAAUAUUAAAACUAGAAUAUUCAACUCCAUAUGGAAAAUCAUAUCCAUGGAUCUCUUUGGCAUUAUGAAGAAUGAAGCUAAGGAAAAGGGAAUUCAUUAAACAUAUCAUCCUUGGAGAGGAAGUAAUCAACCUUUACUUCCCAAGCUGUUUGUUCUCCACAAUAGGCUCUCAACAAAUGUGUGGUAAAUUGCAUUUCUCUUCACUAUGGUGUAUUCAGUCAAUGCUUGUCCCUGGAAACCCAAAGCAUGACCACUGCAAAUAUUUCCUUGACUUUUUGUAAAUGAAGAGGUCCUUUUCCUCAAGUUCUUAGUCCCACUCAUCCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-709.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -754.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 606.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((((..((((...(((.(((((((((((....(((.((((..((((..((...((((((.........))).))).))..))))....)))).)))..))))))))))).)))..(((((..(((.....)))....))))).((((..((((((((.......((..(((.....((((.....)))).....)))..))...((((((((((...((..(((((((((((................((((...((((((((((.((((.....(((((((((.........)))))))))(((.......))).))))))))).))))).)))).(((....)))....((((((((((((((..(((((((((((...)))))......((((((.(((((..(((......((((((((.......))))....))))...((((.(((((..(.((((((...(((((.(((((....(((.(((((((..................((((.((((.((((((((.......(((((((..((((((.((((((.....((((..(((.......(((((.((..((........)).)).)))))......))).....)))).....))))))))))))...((((.(((.(((.((((((((......(((......)))..(((.((((...)))).)))...(((.(((((((((....)))))).)))..))).....((((((((((....((((((((((((((.(((((.(((((.(((((.((((((.((((..................)))).)))))).))))).))..))).))).))((((((....)))))).))).)))))).....)))))..........))))))))))....)))))))))))))).))))...((((((..((((((...((((((......((((((((.......((((.......((((((((((((((.(((((..((((..(((((((.......((((((((..............))))))))...))))))))))).))).))..))))))))....)))))).....))))..))))))))..))))))...))))))...))))))))).)))).)))))))).))))..))))....(((((((..............(((((((((...((((..(((.(((((((..((((....))))...(((.((.(((.......))).....(((((........)))))..)).)))..........))))))))))...........)))).)))))))))...........)))))))........((((((((((..(((((((((............)))))...))))..)))).............))))))...........))))))).)))))))).)))))((((((((((....))))......)))))).....)))))))))))).))))..)))..))))).)))))).((((((((((.(...((((.(((((((..(.......)..))))))).))))...).)))...(((.....)))...)))))))...(((((.((.((((((((.((((.......(((.............)))......))))..)))))))).)).)))))((((((((...))))..)))).))).)))..))))))))..)))))).....(((((((((((...))))))))))))))))))))))..)).....((((((((..........(((((...))))).........((((((...((..((((((((...((((((((((............(((((((((((((.((((............))))...))))).....)).)))))).........)))).)))).))..........))))))))..))....))))))...))))))))..((((((........))))))....(((....))).....)))))))))).....))))))))...))))...(((....((((((((((..((((((....(((((((...(((((((((((((((..(((..(((......((((..((((.....))))..))))..........))).)))..))))).))))))))))..))))))).....((((.(((((.....(((....))))))))))))...((((((..............))))))))))))....))))))))))....)))..)))))))))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,,(({((,.((((...(((.(((((((((((....(((,((((.,(((({{({...{({{{{.,,.,,,,.}|},|||.||,.|||}.,,,||||.}}|,,|}}}}}}))}),))|,..(((({{{{(,,,,,|||,...,,.|{{((((((({({...{{||........,((.....((((.....))))....,||,,..},,.,{,.(((,....|||||}....}}})}},..,},,,}},..(((....))}((((((((((,((({.....(((((((((.........)))))))))(((.......))).)))))))))},))))..)))))))}}.(((((....{{{.(((((((((.........)))))))))....}}}...)))))..||,..,{{|,,,,,,{(((((((.......))))....)))}...||||{((({..{{{{(((({...{,{{||||,.....,||||}},,..)}},}}}},,,}.|||,,{|||||,,||.|||({{{.......,})}.,,,,.(((((,,((((((.....((((..(((.......(((((.((..((........)).)).)))))......))).....)))).....))))))))))))..,|{,,.((,{(((.((((((((......(((......)))..(((.((({...}))).)))...(((.(((((((((....)))))).)))..}}),....((((((((((....((((((((((((((.(((({.{((({.(((((.((((((.((((.,................)))).)))))).))))).)}.|}}}.}}}.}}|{{|{{....)))))).))).)))))).....)))))......,...))))))))))....)))))))))))))).||||{{(((((.({(((,,,,,..............})))}))))))}...)))))))}}},((((((((((((((.(((((..((((..(((((((......,((((((((..............))))))))...))))))))))).))).))..))))))))....)))))).{{.((((((((((((..{.,{,,..(((..(((,{.((,....))}}.)))..))).....},.)..))))))))))))))}))),,}}.))}},}.||)}}}}}|,,,}}||..,.}}|{{{,,....|||...})))))))),,),})))).,.,,,,||},.||,,|||,|||}|.{({((|{((((,,({,,,{..,,{{{((((||{.({.,,......}}}})|)}},,)}}}}.......,,||{{,.({,,{|,,|||..,}((((((((((((((....(({,.,{(({{(({,{{...,}}.}}}}}|,.....,,,,.,{{{{{..,{({{{({.(((((((.{{{,{.{({((({({{..{{{{{{...,)))))}))})),))))))})),{,,(({....)))..,.,,.....)),.,.||}},,.}}}))|(((.,...((((.(((((((,,(.....,,)..))))))).))))..,).))),.{((((((({.,.(((.(((((((({{((((.((.((((((((.((((.......((({{.{{........)),}}}}}.))))..)))))))).)).))))}((((((({...})))..)))).((((((........))))))(((...))){(((((((((((..(((((((.((({{{,,...}))..))))))))))................(((((...)))))............}|||...{{{......,})..))))))))))))))))))))..,)},).}}.,)))))))................))))}},)))}....)))))))))))))}...|||||..||},})),..})))}})))))))|.|,...,)))))|,.(((((((((((({((((........}}}}}}...,((({,{((((........))))))}}..((((((((.((((.....)))).))))))))..{((({.................)))))}|||.((((((((.......))))))))..((((..((((.....))))..))))..,.....,|||||},.....,})}))))))))))))..}}}|},|}},(((,{(((((.....(((....))))))))))))...|||{{{....,,...,|,,.}}})},...,,,((((.......)))).,})))}}))))))))}..}}},.
Back