Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_032989.3

Sequence Length

929 nt

GC Content

0.6577

AGGCCCGGGUCAGGGGCCUCGAGAUCGGGCUUGGGCCCAGAGCAUGUUCCAGAUCCCAGAGUUUGAGCCGAGUGAGCAGGAAGACUCCAGCUCUGCAGAGAGGGGCCUGGGCCCCAGCCCCGCAGGGGACGGGCCCUCAGGCUCCGGCAAGCAUCAUCGCCAGGCCCCAGGCCUCCUGUGGGACGCCAGUCACCAGCAGGAGCAGCCAACCAGCAGCAGCCAUCAUGGAGGCGCUGGGGCUGUGGAGAUCCGGAGUCGCCACAGCUCCUACCCCGCGGGGACGGAGGACGACGAAGGGAUGGGGGAGGAGCCCAGCCCCUUUCGGGGCCGCUCGCGCUCGGCGCCCCCCAACCUCUGGGCAGCACAGCGCUAUGGCCGCGAGCUCCGGAGGAUGAGUGACGAGUUUGUGGACUCCUUUAAGAAGGGACUUCCUCGCCCGAAGAGCGCGGGCACAGCAACGCAGAUGCGGCAAAGCUCCAGCUGGACGCGAGUCUUCCAGUCCUGGUGGGAUCGGAACUUGGGCAGGGGAAGCUCCGCCCCCUCCCAGUGACCUUCGCUCCACAUCCCGAAACUCCACCCGUUCCCACUGCCCUGGGCAGCCAUCUUGAAUAUGGGCGGAAGUACUUCCCUCAGGCCUAUGCAAAAAGAGGAUCCGUGCUGUCUCCUUUGGAGGGAGGGCUGACCCAGAUUCCCUUCCGGUGCGUGUGAAGCCACGGAAGGCUUGGUCCCAUCGGAAGUUUUGGGUUUUCCGCCCACAGCCGCCGGAAGUGGCUCCGUGGCCCCGCCCUCAGGCUCCGGGCUUUCCCCCAGGCGCCUGCGCUAAGUCGCGAGCCAGGUUUAACCGUUGCGUCACCGGGACCCGAGCCCCCGCGAUGCCCUGGGGGCCGUGCUCACUACCAAAUGUUAAUAAAGCCCGCGUCUGUGCCGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-419.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -433.13

Frequency: 0.0000

Diversity: 258.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((..((((..(((((((((((((.(((((.((((((((.....(((((...((.(((((((.(((((.........))....))).)))))))..))..))))))))))))).)))))....(((((((((......((((..(((..........))).))))...(((((((((((((((....))).))).))))))..)))...((((.((..(((...)))..))))))(((.(((((((...(((((((((...((.(((...(((((.((((((((((((......(((.((((((((((((...(((((....))))).))))(((((..((((((..........)))).))..))))).....((((((((((.(..(......)..)))))))))))..((((((...))))))))))))))))).....((((.(((..(((..(((....))).....)))...))).).)))..))))))).))))).)))))...))).))((((.(((((..((...))))))))))))))).)))))))))))).))).........))))))))).(((((...)))))..)))))))...(((((((((.......((((..((....)).....))))....((.((.(((((...))))).)).)).((((((((....(((((((((.(.((.(((((......))))).).))))))))))).))))))))))))))))).((((((.....))))))....)))))))))).(((((..((((((((((((((((.(((((.(((........)))))))).........(((((.(.(((........))).).)))))))))))))........................)))))))).))))).)))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((..((((..(((((((((((({.(((((.((((((((.((..{{(((...({.({(((({.({({{....,,,,.||..,.})),}))))})..}}..||||||}||}}}}.}}|||,...{(({{{(((.|,...|||||,(((..........))).})))...||{((((((((((((....))).))},))))))..|||..{((((.((..(({...}))..))))))|||}|(((({(...{{{{|||{|...,|,||{...(({({.((((((({((({..,...(((,((((((((((((...(((((....))))).))))(((((.,(((({{..........)))}.))..)))))...,,((((((((({{(..{......}..))))))))))).,{((((,...}))))})))))))}))},..,.{{{|||||..,((..(((....))),,...}}},..)))|},}}),.))))))}.}}|}}.}}))),}.))).}}((((.(((((..{,...,}))))))))))))}},))))))))})).))).....,,,.})))))))).||||{,,,))))),,}))))))...((((((((({,.((((((((..((....})....,||||{...,,.|,,,,|})),,.)))))))))),((((((((....(((((((((.(.,(.(((((......))))).).}}))))))))).)))))))),)))))))).((((((.....))))))....)))))))))).(((((..((((((((((((((((.(((((.(((........)))))))).........(((((.{.(((........})),).)))))))))))))..,...............,.....)))))))).))))).)))...