Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032992.3
Sequence Length
1367 nt
GC Content
0.4301
GUGGCUUCAGGAAGAGGAGGGCAAGGUGUCUGGCUGCGCGUUUGGCUGCAAUGAGCUCGGCCUCGGGGCUCCGCAGGGGGCACCCGGCAGUGUCAACUGUUAGCCACGCAGAUGCCGAUUGCUUUGUGUGUGUCUUCCUGAGCCAUGGCGAAGGCAAUCACAUUUAUGCAUAUGAUGCUAAAAUCGAAAUUCAGACAUUAACUGGCUUGUUCAAAGGAGACAAGUGUCACAGCCUGGUUGGAAAACCCAAGAUAUUUAUCAUUCAGGCAUGUCGGGGAAACCAGCACGAUGUGCCAGUCAUUCCUUUGGAUGUAGUAGAUAAUCAGACAGAGAAGUUGGACACCAACAUAACUGAGGUGGAUGCAGCCUCCGUUUACACGCUGCCUGCUGGAGCUGACUUCCUCAUGUGUUACUCUGUUGCAGAAGGAUAUUAUUCUCACCGGGAAACUGUGAACGGCUCAUGGUACAUUCAAGAUUUGUGUGAGAUGUUGGGAAAAUAUGGCUCCUCCUUAGAGUUCACAGAACUCCUCACACUGGUGAACAGGAAAGUUUCUCAGCGCCGAGUGGACUUUUGCAAAGACCCAAGUGCAAUUGGAAAGAAGCAGGUUCCCUGUUUUGCCUCAAUGCUAACUAAAAAGCUGCAUUUCUUUCCAAAAUCUAAUUAAUUAAUAGAGGCUAUCUAAUUUUACACUCUGUAUUGAAAAUGGCUUUCUCAGCCAGGCGUGGUUACUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGUCCAAGGUGGGCGGAUCACCUGAGGUCGGGAGUUCGAGACCAGCCUGACCAACAUGGAGAAGCCCCGUCUCUACUAAAAAUGCAAAAAAAAAUUUAGCUAGGCAUGGCGGCGCAUGCCUGCAAUCCCAGCUACUUGGAAGGCUGAGGCAGGAGAAUCACUUGAACCCAGGAGGUGGAGGCUGCGGUGAGCCGAGAUUGCGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAACGAGUGAAACUCCGUCUCAAAAAAAAGAAAAUGUCUUUCUCUUCCUUUUAUAUAAAUAUCGUUAGGGUGAAGCAUUAUGGUCUAAUGAUUCAAAUGUUUUAAAGUUUAAUGCCUAGCAGAGAACUGCCUUAAAAAAAAAAAAAAAAAGUUCAUGUUGGCCAUGGUGAAAGGGUUUGAUAUGGAGAAACAAAAUCCUCAGGAAAUUAGAUAAAUAAAAAUUUAUAAGCAUUUGUAUUAUUUUUUAAUAAACUGCAGGGUUACACAAAAAUCUAGCUGAUUUAACUUGUAUUUUGUCACUUUUUUAUAAAAGUUUAUUGUUUGAUGUUUUUAAAGGUUUUUGAAAUCCAGGAAUUAAAUCAUCCCUUAAUAAAAUAUUCGAAAUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-409.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -437.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 426.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..(((((((((((((((..(((((((((((...(((.(((((...(((((((((((((((((.(((((.(((....))).(((((....)))))((((((((((((((..(((((((((((.((..((.....))..))..)).))))))))).))))..)))....(((......)))......(((.......)))(((((((.......)))))))......(((((((((((((.((.....((((((((((((((((((((((((....))....)))))))))...........))))))..))))))).((((((((((..(((((...))))).....(((((.(((.((.....(((((((((.(...((((.(((((.(((..((((..((((.........))))..))))..)))))).)).))))...))))))))))..((((.....(((((.((((.....)))).)))))....))))))))).)))))((((((...)))))).((.((((((((...((((....))))...)))).))))))...(((((..........)))))((((((((((((((.((....(((..((......)).)))....)).))))..))))))))))...............((((.....))))........)))))).))))....)).)))).))))))))))))))))....(((((....((((((....)))))).....))))).))))).).)))))))))..)))))))....))))).))).....((((((.......)))))).....................)))))))))))((((.....)))).((..(((.((...)).)))..))((((((.((((..(((((((..((((((...(((((..(((((((.((((....)).)))))))))))))).))))))...)))))))..))))))))))............)))))))))))))))...............(((((((((((((((..((((....))))..))))))))..(((((..(((...)))..))))))))))))........................))))))((.((...((((((((.((((....(((((.(((..((((((..((..((((((..((((((((((....(((((.....)))))...)))(((((.(((((((((((.....)))))...)))).....)).))))).)))))))..))))))..))...))))))..))).)))))...))))...)))))))).))))......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((,.,(((((((((((((((,,((((({(((({,({(({.(((((,..(((((((((((((((((.(((((.(((....)))|(((((....)))))|{{{((({{{{{{|,.{{{{|||||||,|{,,|(||,,,))},))}.}}}}}}})}}}}.}}|},.,||,,.,{||}},...,||,.....{{(.......}}}{(((((({....}}}}))))),,|,,.(((((((((({((.,({,.{{(,{{{|||,,,{,((((((((({(....}}..,.))))))))).,.,..,.,{,||}}||..,}}}}},.|||,{{{{||..(((((...)))))....,(((((.(({..{,({{,(((((((((.{...((((.{((((.(((..((((..((({......,,.})))..))))..)))))),)).))))...}))))))))){{({{|.,,,,{{{{{.,,{||||||))||,||}||....}}}}))))).))}}}((((((...)))))).|{.({((((((...{(((....})))...))))}))))}}}},{{({{..........))}},((((((((((((((.((....(((..((......)).)))....)).))))..)))))))))).......,,,,,..{(((({..{{,,,.....}}..)))))).}))}...})).)))}.)))))))))))))}}}..,.(((((,...(((((,....})))))...,.))))),))))).}.)))))))))|,}}))))}...,)}})),}))}....{(((({.,.....)))))}....,..,,,.........,,}}||}||||||{{,{,,.},}))),||..{{{,{{...,},))}..})((((((.((((..(((((((..((((((...(((((..(((((((.((({....,).)))))))))))))).))))))...)))))))..))))))))))............})))))))))))))}..........,.,.{((((({(((((((((.,((((....)))}..))))))))}.,,{{{.,{({,.,|||..|||||.,,,,................}}})).)}}})))))),|,|,,,,((((((((.((((....(((((.(((.,((({((((((({((((((..{(((((({,,.,,|{{{{{,,...})))},..}||{{({{,{{{...(((((.....)))))...,))))}))))}.|,,,,,}))))))..)))))))))))}},})))}..))).)))))...))))...))))))}).,)))}),,,......,,.,.......
Back