Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032996.3
Sequence Length
2869 nt
GC Content
0.5295
AGAUGCGUCCCGGGGAGUGGGCGGUGACGCGGUGGCAGGUUCUGGGGACAGGCGGUGACCCCAGAAUUGACCCUGGGGACAGGGCGAGGCGCGGAGGCGUCCUGAAGGCGAGGCGGUGACGCAAGAGCGAAUCCUUGGGGCGGGGCGAGGCGUUGGAGAUGCGUCCUGCGGGCGGGACGGUAACGCGGGGGCGGGGCGGUGACGUGAGCGGGCAGGCUCUGGAUCUCGGCGGGAUCAGGCCAGGCAGCUGAUCAUAGAUCUGGAGACUCGAGGGAGUCAGGCUCUUCCUUUGUUCAUCUCCUGCUUAGAGGACACAGGCCAGGACAUGCUGGCUUCGUUUCUGCGAACUAACAGGCAAGCAGCAAAGUUGUCGAAGCCAACCCUAGAAAACCUUACCCCAGUGGUGCUCAGACCAGAGAUUCGCAAACCAGAGGUUCUCAGACCGGAAACACCCAGACCAGUGGACAUUGGUUCUGGAGGAUUUGGUGAUGUCGGUGCUCUUGAGAGUUUGAGGGGAAAUGCAGAUUUGGCUUACAUCCUGAGCAUGGAGCCCUGUGGCCACUGCCUCAUUAUCAACAAUGUGAACUUCUGCCGUGAGUCCGGGCUCCGCACCCGCACUGGCUCCAACAUCGACUGUGAGAAGUUGCGGCGUCGCUUCUCCUCGCUGCAUUUCAUGGUGGAGGUGAAGGGCGACCUGACUGCCAAGAAAAUGGUGCUGGCUUUGCUGGAGCUGGCGCAGCAGGACCACGGUGCUCUGGACUGCUGCGUGGUGGUCAUUCUCUCUCACGGCUGUCAGGCCAGCCACCUGCAGUUCCCAGGGGCUGUCUACGGCACAGAUGGAUGCCCUGUGUCGGUCGAGAAGAUUGUGAACAUCUUCAAUGGGACCAGCUGCCCCAGCCUGGGAGGGAAGCCCAAGCUCUUUUUCAUCCAGGCCUGUGGUGGGGAGCAGAAAGACCAUGGGUUUGAGGUGGCCUCCACUUCCCCUGAAGACGAGUCCCCUGGCAGUAACCCCGAGCCAGAUGCCACCCCGUUCCAGGAAGGUUUGAGGACCUUCGACCAGCUGGACGCCAUAUCUAGUUUGCCCACACCCAGUGACAUCUUUGUGUCCUACUCUACUUUCCCAGGUUUUGUUUCCUGGAGGGACCCCAAGAGUGGCUCCUGGUACGUUGAGACCCUGGACGACAUCUUUGAGCAGUGGGCUCACUCUGAAGACCUGCAGUCCCUCCUGCUUAGGGUCGCUAAUGCUGUUUCGGUGAAAGGGAUUUAUAAACAGAUGCCUGGUUGCUUUAAUUUCCUCCGGAAAAAACUUUUCUUUAAAACAUCAUAAGGCCAGGGCCCCUCACCCUGCCUUAUCUUGCACCCCAAAGCUUUCCUGCCCCAGGCCUGAAAGAGGCUGAGGCCUGGACUUUCCUGCAACUCAAGGACUUUGCAGCCGGCACAGGGUCUGCUCUUUCUCUGCCAGUGACAGACAGGCUCUUAGCAGCUUCCAGAUUGACGACAAGUGCUGAACAGUGGAGGAAGAGGGACAGAUGAAUGCCGUGGAUUGCACGUGGCCUCUUGAGCAGUGGCUGGUCCAGGGCUAGUGACUUGUGUCCCAUGAUCCCUGUGUUGUCUCUAGAGCAGGGAUUAACCUCUGCACUACUGACAUGUGGGGCCAGGUCACCCUUUGCUGUGAGGCUGUCCUGUACAUUGUGGGAUGUUCAGCACUGUCCCUUGCCUCAAUGCCAGUAACGCGUCUUCCUGAGUGGUGCCAAACAAAAAGGUUCUCAGGUGUUGCCAAAUAUGUCCUGGGGUAUAAAACUUUCCUCGCCUGACAACCACUGGUCUGUAGGGAUUUUUGGCUACACACAAACCAGUAUCGCUCAUAGAUCAGCAAACCGGGGCCUACUAGAGUCUGAACAGCUGUAAUCUAUGAAUUCUAAGUGAAAUUUUAAAAAUUGUUAAUUUUUCCUAUAUUGCAUUAAUUUUAAAAAAUAAAUCUGAGGCAAAUAUGGACUCUCUUUUGCCUAUUUCUUCCCUCAUUUUGCUCCAACUCUUUCUUCUUCCUUACAAAAGAGACUUUUGCUUUUUUCGAAACAUUUCCCCAUGUUUUUCUGGGGUCUCGCUAUGUUGCCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGGGCUCAAGUGACCCUCCCAAGUAGCUCUUACUACAGGCGUGCACCAUUGCACCCAGCCCCAUUUAUUCAUGUCUUAUUUCACUUGAUCCUUAUCCCAUCCCAGGAAGGCAACAAGGGUGAGAACCCUGUGCUCAGGGAGGUUAGGUCUCUUGUCCAAGGGAAAACGAUUAUCCAGAGAAGAGACCUGGCCAGAACCUGGGUCCCCUGAGUCCUAGCCAUGCUUCCCAUGUGCCUUACUUGCUGAAGCACCCCCGGACUGCAGUGUGAACGUGCUGUGCAAUAGUGACACGCUGGGCUUCCCCACAAGGCUCCACCCUGAGGUCUUUUAAGCUGUCCUUAUGCCAGCCUAUUUCUUGUUUUUUGGGCCUUUUUUUUUGGAGAUAGGGUCUCACUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGACGCAAUCUUGGCUUAUUGCAGUCUCGACCUCCUGGGCUCAAGAGAUCCUUCCACCUCAGCCACCUGAGUAGCUUGGACUACAGGUGUGCACCACCUCUCCCAGUUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGAGUUAUGCCAUGUUACUCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGGACUCAAGCGAUCAGCCUGCCUUAGCCUCCCAAAGUGCAGGGGUUACAGGCUUGAGCCAUUGCGCCUGACCUAUUUCUGGUUCUUAGGGCCCUGGAUGUUAGGAUGGAUUUCUGAAUUAAUAAUAAUAAUAAAACCCUCAUCAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1046.89 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1099.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 596.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((.(((((((((((((.((.(((.((((((((((.((((((.(((((.((((((((((..(((..((((((((((..((((((((..(((((..(((.(((((((.(((..(((....))).)))(((((((((((..(((((.((((.(.(((((((((....))))))(((((.(((((((.(((((((((..(.(((((((..((((((((..(((((.((......(((((......((((...)))).((.(((((((((((((((((.((.((((....(((((((((((((..((((...((((((((...((((((((((((((((((...((....))...)))).))).....)))))))).((((.((.((((((......((((..(((......)))..))))......)))))).))..((((((..(..((((((((((....))))).)))))..).))))))....((((.((((....))))))))))))....)))..))))))))...))))))))).(((((((.(.((((((.((.......(((......)))......)).))).)))))))))))((....))................(((((((((...(((((((...........)))))))))))))))))))))))))))).)))))))))((((......))))(((((((((...)))))))))(((((((..(((........))).)))))))((((.(((((((((((((((.(((((...((((((((.((((.......))))))))).....(((((((.........)))))))((((..((((((.......)))))).....))))....))).)))))))))))))(((((((.(.(((((((..(((..(((...)))..)))..))))))).).)))))))..))))))).))))...)))).....))))))))))))).....)))))))))))).)))..))))))))..(((((((....)))))))..((....)).)))).(((((.((((((((.(((((((((((((....))))).............(((((........)))))((.(((((..(((((((((((((((.((((.((...)).)))))).........))).)))).))))))........((((......))))...))))).))...))))....))))...))).....))))))))))(((((((...............((((((...))))))..............)))))))))))).).)))))).)))))..))).))))).)))))))))))))))).(((.(((..(((((((((((..((.(((((((....(((((....((((((.......)).)))))))))...)).))).)).)).))))).))))))..))).)))......((((.((((((((((....(.((...(((((((......(((.((((((((.((..(((....).))..)))).)))))).)))..((((((((.((((((((..........((((..(((.((((((......)))))).)))..))))))))))))))))))))((((......))))))))))).....)).)....))))))))))))))))))))))))))))).....)))))))))))).(((((((..........((((.....((((.((((((...(((((((((...........)))).....((((((...))).))).))))).)))))).))))...)))).)))))))((((((((((((......((((((...)).)))).....))))..)))))))).........((((..((((......))))..))))(((((((((.(((..((((.....))))..))).)).)))))))..(((((((((............................................))))))))).(((((.......)))))....)))))).))).))))))))))))))).....(((((((..(((.....))))))))))((((((((.........((((......)))).((((((((....)))))...)))....................))))))))((((...........)))).((((.((.((((....))))))))))((((..(((((((((((((.((...(((.((....)).))).)).)))))))))))))....)))).)))))).))).))).))))))).))))....))).))))(((....))))))).)))).)))........(.((((.(((..((.((((.((((((((((......(((......))))))))))....)))))))))..))))))))....(((((......(((((.........)).((((((((...))))))))((((((((.(((.((((((((.((.......)))))))))).))).)....)))))))(((.(((((((.(((......((((((((((((((.(((...(((((((.....))))).............(((((.((((....)))))))))))....))).)))))))))).))))....(((((((((.(((((((......((((((((.........))).)))))........))))))))))....((((((((.......))))....))))...))).))).))).))))))))))...................)))....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((({({(((({((((((((.((.((,{((((((((((.((((((.(((((.((((((((((..(((..((((((,{(({.((((((((..(((((..((,{(((((((.(({..(((....))).}})(((((((((((,.,((((.((((.(.(((((((((....))))))(((((.(((((((.(((((((((.,,.(((((((..((((((((..(((((.((...,..((((((...,.((((...)))).|{.(((((((((((((((((.((.((((....(((((((((((((,,{(((...((((((({...((((((((((({{{((((...{{....}}...)))).}}},....)))))))).{{({.,,.,{{{{{......{{({,.(((..,,,,|||..||||,.,,,,||||||,||,|(((({,..(.,((((((((((....)))))}})))).,}.))))))..}}|||},,|||},,.),))}}}})))}....)))..}))))))}...))))))))},(((((((.(.((((((.((..,,,..{{,.....}}))......)).))).)))})))))))|,..,,|},.,}}},,,,......(((((((((...(((((((..{.....,..)))))))))))))))))))))))))))).)))))))))((((......))))(((((((({...}))))))))(((((((..(((.,.....,))).)))))))((((.(((((((((((((((.(((((...((((((((.((((.......))))))))).,..,(((((((..{,...},)))))))|{{{..((((((.,....,))))))....,}}}}....})).)))))))))))))|((((((.(.(((((((..(((..(((...)))..)))..))))))).).))))))}..})))))).))))...)))).....)))))),)))))).,...)))))))))))).)))..))))))),..(((((((....)))))))..,,{{{{(({.,,,...|||}|||,|{{{.||||.{{,(((((....)))))||,,,,,..,,{{(((((........))))),|}||,.,..|||||||{{(({(((.({{{.((,,,}|,))}},|.,||,{||{|||.||||,}}}}}}...||,,||{||,,,...)))),,}))))){|,...}},|,,,.||||,.,||},,|,,}}}}}})}}.{||{{{|........,,,,...|||{{,...,}}}}}..............)))))))))))).).)))))).)))))..))),})))).)))))))))))))))).(((.(((..(((((((((((..({.((((({{....{((((....((((((.......)).))))}}}))...))}})).)).)).))))).))))))..))).)))......(((,{((((((((((....{,{,...(((((((......(((.((((({{(.{,,,(((....}.}),}}))).)))))).)))..((((((((.((((((((..........((((..(((.((((((......)))))).)))..))))})))))))))))))))((((......))))))))))).....)).)....))))))))))))))))))))))))))))).....)))))))))))|(((((.((.,,.......((((.{{{((((,.{,{,,,..,{,{,,{{||.,.........}},))}}}}}.}}}},{{{||.{{{|||},,..,},,),})},....)))})),,|,|((((((((((((......(((({{...}}.)))),....))))..)))))))}......,{.||{{..((((,,..,.}}}}..}}}}||,.|||||.,,,.|||||.....,,,,..||(((|{{{,|.{{...,,,,}}})))),.........,...,}.)).}},,}}}..............,{||||||.,.,,,},}},,,..,,,.....)))))).))).))))))))))))))).....(((((((..({,.....,),)))))))((((((((.........((((......)))).(({(((((....))))),,.}}}.,,,......,,}.......)))))))),{{{....,......,))).{((,,(,{((((....)))))))))|((((..(((((((((((((.((...(((,,,....,}.))).)).)))))))))))))....)))),)))))).))).))).))))))).))))....))),,))}{{{....)))})))))))).)))........{.((((.(((..((.((((.(((((({{{{,,,..,(((,,....},))})))))....)))))))))..)))))))}....{((((......(((((.........)).((((((((...))))))))(((((((,.(((.((((((((.{(,....,,}})))))))).))).}....)))))))((,{(((((((.(((...,{{((((((((((((((.(((.,...(((((.....)))))........{{{,{(((((.(((,....))),)))))))}}..))).)))))))))).)))}..})|{{((({((.(((((((,,,,..((((((((.,.....,.))).))))),,,,....)))))))))}..{,{(((((((.......))))...,)))).,.))).}},.))).)))))))))),,,,.......,.......)))....))))}
Back