Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_033317.5

Sequence Length

1924 nt

GC Content

0.5925

GAGAAGCCCAGGCAGUUGAGGACAGGAGAGAGAAGGCUGCAGACCCAGAGGGAGGGAGGACAGGGAGUCGGAAGGAGGAGGACAGAGGAGGGCACAGAGACGCAGAGCAAGGGCGGCAAGGAGGAGACCCUGGUGGGAGGAAGACACUCUGGAGAGAGAGGGGGCUGGGCAGAGAUGAAGUUCCAGGGGCCCCUGGCCUGCCUCCUGCUGGCCCUCUGCCUGGGCAGUGGGGAGGCUGGCCCCCUGCAGAGCGGAGAGGAAAGCACUGGGACAAAUAUUGGGGAGGCCCUUGGACAUGGCCUGGGAGACGCCCUGAGCGAAGGGGUGGGAAAGGCCAUUGGCAAAGAGGCCGGAGGGGCAGCUGGCUCUAAAGUCAGUGAGGCCCUUGGCCAAGGGACCAGAGAAGCAGUUGGCACUGGAGUCAGGCAGGUUCCAGGCUUUGGCGUAGCAGAUGCUUUGGGCAACAGGGUCGGGGAAGCAGCCCAUGCUCUGGGAAACACUGGGCACGAGAUUGGCAGACAGGCAGAAGAUGUCAUUCGACACGGAGCAGAUGCUGUCCGCGGCUCCUGGCAGGGGGUGCCUGGCCACAAUGGUGCUUGGGAAACUUCUGGAGGCCAUGGCAUCUUUGGCUCUCAAGGUGGCCUUGGAGGCCAGGGCCAGGGCAAUCCUGGAGGUCUGGGGACUCCGUGGGUCCACGGAUACCCCGGAAACUCAGCAGGCAGCUUUGGAAUGAAUCCUCAGGGAGCUCCCUGGGGUCAAGGAGGCAAUGGAGGGCCACCAAACUUUGGGACCAACACUCAGGGAGCUGUGGCCCAGCCUGGCUAUGGUUCAGUGAGAGCCAGCAACCAGAAUGAAGGGUGCACGAAUCCCCCACCAUCUGGCUCAGGUGGAGGCUCCAGCAACUCUGGGGGAGGCAGCGGCUCACAGUCGGGCAGCAGUGGCAGUGGCAGCAAUGGUGACAACAACAAUGGCAGCAGCAGUGGUGGCAGCAGCAGUGGCAGCAGCAGUGGCGGCAGCAGUGGCGGCAGCAGUGGUGGCAGCAGUGGCAACAGUGGUGGCAGCAGAGGUGACAGCGGCAGUGAGUCCUCCUGGGGAUCCAGCACCGGCUCCUCCUCCGGCAACCACGGUGGGAGCGGCGGAGGAAAUGGACAUAAACCCGGGUGUGAAAAGCCAGGGAAUGAAGCCCGCGGGAGCGGGGAAUCUGGGAUUCAGAACUCUGAGACGUCUCCUGGGAUGUUUAACUUUGACACUUUCUGGAAGAAUUUUAAAUCCAAGCUGGGUUUCAUCAACUGGGAUGCCAUAAACAAGAACCAGGUCCCGCCCCCCAGCACCCGAGCCCUCCUCUACUUCAGCCGACUCUGGGAGGAUUUCAAACAGAACACUCCUUUCCUCAACUGGAAAGCAAUUAUUGAGGGUGCGGACGCGUCAUCACUGCAGAAACGUGCAGGCAGAGACGAUCAGAACUACAAUUACAACCAGCAUGCGUAUCCCACUGCCUAUGGUGGGAAGUACUCAGUCAAGACCCCUGCAAAGGGGGGAGUCUCACCUUCUUCCUCGGCUUCCCGGGUGCAACCUGGCCUGCUGCAGUGGGUGAAGUUUUGGUAGGCAAUUUCUUGCAACCACCACCGAGGCCCCGAAAAGCACUGGUCGUCAGGGAGCUCCUCCCCUUGGCCCCCAGCCUGUGCCAGCCCUGGCCCGGCUGCCACACCUCUGUUUCCUAGGCUGGGGACCCAGCUUGUCUCUCCUUGUUUCUUCCCACUGCACUGUGGUGCUUCAGUGGCCACCAGCCUCGUCACAUACACCAGCAUCUUUCUGUACCUCCUCCCUUUGGUGACCUGAAGUCACUGUGACAGUUCUCCAGGAAGGAGGAGCUUCCUACUUUUGAGUUUCUCUGUGGAAAUAAAACAUGAAUCUUGUUUCCCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-794.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -827.22

Frequency: 0.0000

Diversity: 573.87

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((.((((.(((.((((((..(..(.((..((((.(((.((((((((((((.(((((((((((..(....((.((((.(...((.((.(((((...(((((.(((.(((.(((((((((.((((((....))(((.......))).(((((.(((((((((((((............(((((((((((((.(..(((((..((((..((((((((((..((((.((((.......)))))))))).)))))).))..))))..))).)).....).))).)))))))))).(((((((......((((((.......))))))....)))))))((((......))))(((((.(.(((((((....)))))))..).)))))(((((((((....(((.(((........((((((((.....)))))))).((((((((.(.(((.((((((((((..((((((..(((......)))..)))))).......((((((((.(...((((...(((((......((((....))))((((.(((...)))))))..((((((....)))))))))))))))...).))))))))....((((.(((.(((.((((...(((((((.((((((...)))))).))))))))))).)))..))).)))).(((((((..((((((....))))))..))))))).(((((((((((.(((((....(((..((((((((....)))))))))))..)))))......(((((((....(((((((.......)))))))....)))))))...((((...((((((.....))))))....)))).......(((((..((.(((((..(((((((...)))))))...((((((.....)))))).(((.((.(((((((.(((((.((.((.((....((.((......((....)).....)).))....)).)).)).).((.((....)).)).((.((.((.((....)).)).)).))..((.((.((.((.((....)).)).)).)).))..........)))).)))))))))))))))))))..)))))...((((((.(((.(..(((...)))..)))).))))))...((......(((((((......(((((.(((((.(((((((((....))))).....((((((((.....(((((..((((((.((((((....((.(((..((.....))..))).))....))))..((((((.........((((.................)))).........))))))..(((.((((((........(((......)))((((..(((......)))..))))(((((......))))).........)))))).)))...........(((((......))))).)))))))).)))))................((.((.((((((((((......)))))))..))).)))).....(((((....))))).)))))))).))))))))).))))))))))))....))..)))))))).))).((((......((((..((((....)))).)))).))))...))))...))))))))).))))))))).))).))))))))))))))))))))(((.(((((.......))))).))).))))).))))).(((((((....))))))))))))))))))))....)))..))).)))))...))...))).)).)).))))).))...........)..)))))))).)))))))))))))).)..))).)))).)).)..).)))))).((((((......))))))))))))).)))))))...((((((((..........))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((.((((.(((.((((((.{{.,(.{{..((((.(((.{(((((((((((((((((((((((..({..,((.((((.(...((.((.(((.(((.(((((.(((.(((.(((((((({{((((((....}}{{(,......})),(((((.((((({((((((({,....,,..,.((((((((((((({({{,(((({{((((..(((,,,,,..}}||||,||||}}}}.}}))||||||,,.}|,,,,.}}..,)))..))).||.....,.))).))))))))))}(((((((......((((((......,)))))}....)))))))((((......)))}{((((,(.(((((((....)))))))..},)))))(((((((((.,{{(((.{((.,,,{((.((((((((.....}}})))))))||{{|{{.{.|{{.{{||||||((..((((((((.((,.,((((...(((((((,......{{{{{(,{.....{|||...|||{{,.....||||....},},)))))))...))))))).)))).))))||{{(((,(|((((((||{..,{((||||||,..,{{{{|{{{,{||,{|||.,|||{((({,((((((...))))}}.}}))))))|||,|||..}||,||||,(((((((..((((((....))))))..))))))).,|||{{||||{.|||||,,..(((..((((((((....))))))))))).((||{{...({{({(((((,,..((((({{.,,....|}}}}}}...,|}||||}..,((((...((((((.....))))))....))))......|(({(|..{,{((((({,{{{(({(,..)))))}).||((({{{.....}))))},{{(,((,(((((((.{((({{(,,(,.{,{{.,({,({.{,.{{.({....|,....}}.|..}}.}}.)).)).},{|.{|..|.|}.}}.{{.{|.||.||.,,.}).)).}|,,|..((.((.((.((.((....)).)).)).)).))..}.}}.}.,)})).)))}))))))}}|||||}}|,}|,||{..((((((.(({,(..(({...}))..)))).))))))..}}}.......|||||{|},,,.,,(((,(({,,,{,,((((({,,,,|||||{,,,,(((({{((,,...{{{{(,.((((({,{{{{{{{{{....,,,}||}..,,,||||,,,.......,))),.{{||||,,,,.....{(((,.,.,,...........))})}},}},.,,)))))}..{{|.||{{{{,,,,.,,|{||,,},..,)))|||},,||,.....}},..}}}((((((......))))))........||}||||}||,,.{{{{.,,.(((((......)))))..,)))))).}}}}}................{{.((.((((((((((......)))))))..))).))}}.....(((((....})))),)})))))),))))})))},}))))))))))).,..)))))))))))),))),||||,,|,..{|{{.,{|{,....)))).}))},)))),,,)))),..,)))))))),)})))))).,})),))})))))))))))))))))(((.(((((.......))))).))).))))).))))).(((((((....)))))))))))))))))))}.,,.)))..))).))))).,.)})}.))).)).)).})))).)).,.....))..,..)))))))).)))))))))))))).}..))).)))).)).}..).)))))),((((((......))))))))))))).))))))).,.((((((((..........)))))))),..