Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_052906.5
Sequence Length
8370 nt
GC Content
0.6240
GUCUGCGCGCACACGCGCGCUCCCAGACACACACACAGACACACGCGGGCCACCCCACGGCCACGCACCCCGCACCCACACCCGCGCUCACACUCACAUUCACACUCACACUCACACGCGCAGGCCCCGCGGCCGCCGCUUCCCGGAGGCGGUGCUUGGCCCGGAUCCCGGCUGGGGCUGGGAAGGAGAGGACUUGGGUGAGGAGCUGCUGCCACCCGGGCUGGGCCAGGACCUGAGAUCUCAUUGCUACUGCUGCCGCUGCUGCCUGGGGAACCUUUCUGAGACCCAGGUUGGGGACAGUGCCGGAGGGGCCUCCUCUGCUGCAGACAUCUGGAACCAGGUGCAGAUGGGUCUCUUCCUUCCUGCCCCCAUCUCUCUCACUCCUGGCUCAGUGCGGCACUCUCCAGCCUCCUGUGGGAAUCAUCUGAAGUUCUGAGCCCGGAAGCCAAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGAGAGGAAGUCAAGCCCUGAGAACCCUUGCACCUUCCUAGCAGGAGACAAGGAGCAACGCUGCGGUGGGGAGCAGGCUGUGGGGCCCCCACCCCCAGCCCUAGCCAGGCCUAGUGCCUGCUGUAGCACCCUAGAAGAUCCCCAGCAGUUGGCACUAGCUGUACCCACCUUGCCUGGGGCCCCCGUGCUGGGGGUCGCCCCCAAGAUGGUGGCGGCCCCAGGGAGGACUGUACUGCCAGCCCCAGCCUCUGGCCGCUAGGCACCCCCUGCCUUGCCCUGGCCCCUCACUCCGAGGCCAGCGCCAUGCUGCGCCUGGGGCUGUGCGCGGCGGCGCUGCUGUGCGUGUGCCGGCCGGGUGCCGUGCGUGCCGACUGCUGGCUCAUUGAGGGCGACAAGGGCUACGUGUGGCUGGCCAUCUGCAGCCAGAACCAGCCGCCCUACGAGACCAUCCCGCAGCACAUCAAUAGCACCGUGCACGACCUGCGGCUCAACGAGAACAAGCUCAAAGCCGUGCUCUACUCCUCGCUCAACCGCUUUGGGAACCUCACCGACCUCAACCUCACCAAGAACGAGAUCUCCUACAUCGAGGACGGUGCCUUCCUGGGCCAGUCGAGCCUGCAGGUCCUGCAGCUGGGCUACAACAAGCUCAGCAACCUGACGGAGGGCAUGCUGCGAGGCAUGAGCCGCCUGCAGUUCCUCUUUGUCCAGCACAACCUCAUCGAGGUGGUGACGCCCACCGCCUUCUCCGAGUGCCCGAGCCUCAUCAGCAUCGACCUGUCCUCCAACCGCCUCAGCCGCCUGGACGGUGCCACCUUUGCCAGCCUCGCCAGCCUGAUGGUGUGUGAGCUGGCCGGCAACCCCUUCAACUGUGAGUGCGACCUCUUCGGCUUCCUGGCCUGGCUGGUGGUCUUCAACAACGUCACCAAGAACUACGACCGCCUGCAGUGUGAGUCGCCGCGGGAGUUUGCCGGCUACCCGCUGCUGGUGCCCCGGCCCUACCACAGCCUCAACGCCAUCACCGUACUCCAGGCCAAGUGUCGGAAUGGCUCGCUGCCCGCCCGGCCCGUGAGCCACCCCACGCCCUACUCCACCGACGCCCAGAGGGAGCCAGACGAGAACUCGGGCUUCAACCCCGACGAGAUCCUUUCGGUGGAGCCGCCGGCCUCGUCCACCACGGAUGCGUCGGCAGGGCCAGCCAUCAAGCUGCACCACGUCACGUUCACCUCGGCCACCCUGGUGGUCAUCAUCCCACACCCCUACAGCAAGAUGUACAUCCUCGUGCAGUACAACAACAGCUACUUCUCCGACGUCAUGACCCUCAAGAACAAGAAGGAGAUCGUGACGCUGGACAAACUGCGGGCGCACACUGAGUACACCUUCUGCGUGACCUCGCUGCGCAACAGCCGCCGCUUCAACCACACCUGCCUGACCUUCACCACGCGGGACCCCGUCCCCGGAGACUUGGCGCCCAGCACCUCCACCACCACCCACUACAUCAUGACCAUCCUGGGCUGCCUCUUUGGCAUGGUUAUCGUGCUGGGAGCCGUGUACUACUGCCUGCGCAAGCGGCGCAUGCAGGAGGAGAAGCAGAAGUCUGUCAACGUCAAGAAGACCAUCCUGGAGAUGCGCUACGGGGCUGAUGUGGAUGCCGGCUCCAUUGUGCACGCCGCCCAGAAGCUGGGCGAGCCUCCCGUGCUGCCCGUAUCUCGCAUGGCCUCCAUCCCCUCCAUGAUCGGGGAGAAGCUGCCCACCGCCAAGGGGUUGGAGGCCGGGCUGGACACACCCAAGGUAGCCACCAAAGGCAACUAUAUCGAGGUGCGCACAGGCGCCGGCGGGGACGGUCUGGCUCGGCCCGAGGAUGACCUCCCGGACCUCGAGAACGGCCAGGGCUCGGCUGCAGAGAUCUCCACCAUUGCCAAGGAGGUGGACAAGGUCAACCAGAUCAUUAACAACUGCAUCGAUGCUCUCAAGCUGGACUCGGCCUCUUUUCUGGGAGGCGGCAGCAGCAGUGGGGACCCCGAGCUGGCCUUCGAGUGCCAGUCCCUCCCUGCAGCUGCUGCCGCCUCCUCAGCCACUGGCCCCGGGGCCCUGGAGCGGCCCAGCUUCCUUUCGCCUCCCUACAAGGAGAGCUCCCACCACCCACUACAGCGCCAGCUGAGCGCCGACGCGGCCGUGACCCGCAAGACCUGCAGCGUGUCGUCCAGUGGUUCCAUCAAGAGCGCCAAGGUCUUUAGCCUGGACGUGCCCGACCAUCCGGCCGCCACAGGGCUGGCUAAGGGCGACUCCAAGUACAUCGAGAAGGGCAGCCCCCUCAACAGCCCGCUGGACCGGCUCCCGCUGGUGCCGGCGGGCAGCGGCGGGGGCAGCGGCGGGGGCGGGGGCAUCCACCACCUGGAGGUGAAGCCGGCCUACCACUGCAGCGAGCACCGGCACAGCUUUCCCGCCCUGUACUACGAGGAGGGUGCCGACAGCCUGAGCCAGCGCGUGUCCUUCCUCAAGCCGCUGACCCGCUCCAAGCGUGACUCCACCUACUCGCAGCUCUCCCCCAGACACUACUACUCAGGGUACUCCUCCAGCCCCGAGUACUCAUCCGAGAGCACGCACAAGAUCUGGGAGCGCUUCCGGCCCUACAAGAAGCACCACCGGGAGGAGGUGUACAUGGCCGCCGGUCACGCCCUGCGCAAGAAGGUCCAGUUCGCCAAGGACGAGGAUCUGCAUGACAUCCUUGAUUACUGGAAGGGGGUCUCCGCCCAGCAGAAGCUGUGACCCCCCCCUUCCUCCCUGGUGAGGUCGGAGCCAGAGGGCUGGGGGCCUUUUGGGGGAAGGGUCCAGGCGGCCAGGGCGGGGAGCAGACUCGGGGGCCAAGGCCCAGGAGAGGACGCACAUGCAGACCCGCACGCACGCACGCACACACACACCUGACCACCACCCGACUGUGAACAAACCAACAUCCGACAAUAACGGACAGGAAAACAGAGACACAUUUUCCUUAAAGUUUACAAACUGAUACCGAAACCAGUCGUCUUUACUGUGCUGCCCAGGGACUCUGCUGGGGUGUGCAGGGCCGGGGGGCUGGCGGGGGGAGGAAGGAAGCCAAGAGAGGGUGUGGGGUCUGGGGGGUCUGGGGCUAGAAACAGGUGUGGGGGUCAAGAAAGCUGGAGUAGAGAGGGACUGAAGCCCCUCUAGGGCAGGGAGAGGGUCCCUUCCCAAGCUGGGAGUCAAGUCACCUGCAGAUUUAGCAUUAGACAUCGGGCAAUGUCUCCUUCCACUUUAGAGAGGGGGGGAAACUGAGGCCCAGAGAAGGGAGUUGACAACCCCAGGGUCACACAGCAGCUUAGCCUCAAGUCCCCCAACUUCCCAGCCCAGUGCUGUCCCGGAACCCCCUGCAGCUCUCUUGUGGACCCCUGCCCGCCCUGUGCCCACCCCACAUCCCUUUCCGAAGCUGUGGUCCCUUGGGGCUGAGGGACUUGGGAAUCAGGCAGGUGCUUUUUCUUCCUAGAAAGCCACAUGGCAGUGCCCCCAGAGUGUGCAGCUGUGAUUCAGAAUCCUGGGGGGCUUUUGACCCCUAUGCCGGCACCCGGGAGAAGGGAGAGGGUCCUGUUGACGGGAAAGGAGCCGAGGCAGGGCGACAUUCCACCAGCCCACUUCAAGUGUCUUCCACGUGGCCUGGGAAGAGUGGGGCGUGUGGCGGGCAGGCCAGCUCCCAGGACGUCUCAGGUGCAGGCUCCCGGCCCCAGCUUCUCUGGUCCUCCGAGACCCCUGCCCACCGCAGAAGGGCAGCGGUGCACUGUGAUGCCUGGAGGGCUGCAGGGAGGAGCUGUCAUGGGGGACUUCCUGCCUGUCCCCAUGGCCUGUGUCCCCACCUGCCCGACCCCAUCGUGGGAUCUCGGCUCCUAUCUCAGCCGCCCACCCGGGGAAGGAGGGCUUUCUCACCCAUCCCCUCUGGGCUGCUCAUCCAGGCCUGGCCCCCUGGCCAGAGGGGCUCCCAUGUUUCCGUGGCAAUGGCCACUUCCCUCUUUCUGACCCCCCCACCCAACAUCAAACAAAGCACAAACAGUGAGGCCCCCACCCGAGAGAGGGUUGAGGAGCAGGCUGGGUUCGUGGCGCCCCAGCCCCUCCCAGCCAGCCUCUGUCACCAUGGUAACCCUGUGCCUGGCAGUUGGUGCCCAGAGUGACCGUUGGGCUCUGGGGUUCUCUGUCCAUGUAGGCGGUGGCAGAGGGUGGUGAGGGAGGGCCAGCCUGGCAGCAGCUCCUGGGGCCAGCUCUUUUGGGAGGCAAAUCUGCGGUCCUGAGACUGGGGUCUUGACCAGUCAGGAUGCUGAUGGGCCGGAGUCCAUCAUCCUUCACCUCUGGGUGGGAGCUGGCCCAGCGGGGUGUGGGGACGCCUCUACUAGCAGCUUUGCCCGCCUAGCAACAUGUCGCUUGGCUGCCACCCACCUCAGCUUGGGGGGCCCCGGCUCUCCCCACGCCCCUGCCAGAGACCCCCAGUCUAGGGCCUGUGGCCCACA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-3797.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -3931.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 2171.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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