Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_052995.2
Sequence Length
1444 nt
GC Content
0.4543
UGCCUCCCCACCAUUCACCAGGCUCCACUGCACUGGCUCAUUCCUGCCUCAGUUGUGCUUCUUUUCCCUGGAAAGUUCUUUCUGUAGAUCUUUAAAGGGUGAUUUCCUUCUCAACAUUCAGGUGUCAGCUCGUUUCACUUUCCUGACCAUGCCCAUCCACUCAGAGAUCACUCAAAAUCCCAUUACCCUAUUUUAUUUCUCCAUCAUAUGUAUCACUAUCUGAAACUAUCUUGUUGUUGAUGCAGGCUAUUUUCUUGACCCCUUCAUGGGACUCCCAACAGGGGUACCCCAUUUACUCAGCCUGCCCUGCUCAACCUCUUGCAGGAGGGAGCACACGAGUGAACGAGUGCAGGAACCAGCUGGCUGCUUUAGUGCUGUGAGGAGUAAACUCCAUGCAGGCCCUGCAGCAGCAACCAGUUUUUCCAGAUUUGCUCAAAGCAAUCCCAGUGAGCAUCCACGUCAAUGUCAUUCUCUUCUCUGCCAUCCUUAUUGUGUUAACCAUGGUGGGGACAGCCUUCUUCAUGUACAAUGCUUUUGGAAAACCUUUUGAAACUCUGCAUGGUCCCCUAGGGCUGUACCUUUUGAGCUUCAUUUCAGGCUCCUGUGGCUGUCUUGUCAUGAUAUUGUUUGCCUCUGAAGUGAAAAUCCAUCACCUCUCAGAAAAAAUUGCAAAUUAUAAAGAAGGGACUUAUGUCUACAAAACGCAAAGUGAAAAAUAUACCACCUCAUUCUGGCUGACUAAAGGCCACAGCUGAGCCUGGAACUGACCCUUCCUUCAUCCUCAACCUGCUGUCCUCCAGAAAGCACCAAGGAAAAAGCAGAGAAUGACAGCAAACAGAUCACUAGGCCUCUGACCACAGGUGCUGAGUACUCAGCAGCCCUCAUAUAAUAGGUUUGAAAGUACUCCUUAAAAUAAAACACUGUUUCCCUUUGGAACUAUUUACAAGGAUGAAACAACCGUAUACCUGAGAAAUAACUUGCUCUGGUGUCAAUUCGCUAUUCGCCAGCAGACAUCAGAACACACCGAGUUUCCAGAUGCUGGUUUUUCCCCUUAAAUCAGGAAAUACACCUGGACAAUUUCUAGAAGACUACAAUUCAGUCUAGCCACAAAGGGGAUUUUUUUUUUUUGGUAACAGGCUAGAGCCCGGUUCUGUAAGUCUUUAGCUGAAAUGGUCCAGUACAAAAGCACUGGAAAUGAGUGGGCUAGGAGGACAAGGACCGUCUCCUGCGUGAGGAGUUGGUUGGAGGUCCCCAAGGCCAGGUACCCCCUGCACUCUUAUUGGAUUCCUCUCUGUCUUCUUGGAGUUUUGAAAAACUCCUUCGAACACCAGGCUUUUUUCUUUAGAAAACAAGUCUCCAAUCGUUCUCUGUUCCGUAGAAAGAGAAAGAAAACCUGGAGCAGCUGCUGAAAAAUCUAAUGAGGAACUAAGAGGCAAACCCACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-417.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -442.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 329.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...........((((((......)).))))((((((......(((((.(((((((....((((..((((.(((......))).))))..))))(((........))).......((((((((..............)))))...)))..(((((((.(((....)))...................(((((((((....(((((.......(((...(((......)))...)))(((((((.......((((((((...((((...))))..))))))....)).......)))))))(((((..........))))).((((((((.((......)).)))).((((..(((((((((((.(((.((((((.((((....)))).)))).)).))).))))))...))))).))))....(((((...)))))))))(((((........((...(((((((((((.(((((((((..(((......)))..)))))))))((((((((..(((((((....(.((((((((....)))))))))..)))))))......)))))))).......(((..(((((((((((((((((((((.....((((...(((.((((((.(((((.((((.......))))...))))).......)))))).)))......((((....)))).......((..(((((.............)))))...))))))....))))))))..)))))))))).)))..))).(((..((((.....((((.((.....)).))))...))))..))).))))))))))))).......))))).(((.((((....)))).)))(((((((...(((.(((........))).)))..)))))))...............((((((.(((((..........)))))..))))))..)))))....)))))))))..((.(((((((((.....((.....)).....))))))))).))......((((((((.((((.((.(((((..........))))).))..((((((.(((((..((((((((((...(..(((((((.(((((((((....)))))))))......))))))).....)...))).)))))))....))))).))))))......)))))))))))))))))))..(((((((((..(((((.(((((.....))))).)))))(((((...(((((..((((.....))))..)).....)))...))))).)))))))))(((((((....)))))))..........(((((((((((....))))).))))))....((.((((((.(((....))))))))).))......)))))).).))))).......)))))).......)))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((,,,,,{,{{..((((((,...,,||,||}|,((((({,,,..,|||{,((((((({{..((((..((((.(((......))).))))..)))).{{......,,{{{,,,..{{(({(((((...{,...,,....)))))...|,,.......,,.(((,,..}}}....................,,,,{{,,....,,{,{,.,,,..,|,}}}{||......),)},,)),(((((((.......{(((((((...((((...))))..))))))....}}.......)))))))(((((..........)))))})))))))},,}))))}.),}))))}|(({..(((((((((((.(((.((((((.((((....)))).))))}}).))).)))))}..,))))}.}}}}.{{,{((((...})))}}},,{((({.,.,,...{{...(((((((((((.{{((((..(((((...(((({.....{{|,,{(((((((.,,...,,,((({,..({(((,((,..,{{.,,||},....,,}},))}..,,.})))))))}}.....{((..(((((((((((((((((((((.....((((...(((.((((((.(((((.((((.......))))...))))).......)))))).))}......((((....)))).......,{..,{{{,.............}}}}}.}))}})))....))))))))..)))))))))).)))..}},........,,......)))))))}))},..))))).)))))...}),))))))))))).....,.},}}}}}.{((.((((....)))).))}(((((({...{((,({{........))),)))..}))))))...............((((((,(((((..........)))))..))))))..|||||..{{|,|||||,,..((.(((((((((...,.((.....)).,,..))))))))).},......||||||||.|||{|||,{{({{..........))))}.,,..((((((.(((((..((((((((((,,{,.,((((((({(((((((((....))))))))},}....)))))))....}),..))),}))))))....))))).))))))......)))}))))})))).))))){,.((,((((...(((((.(((((.....))))).))))),,,,|}}}||,{|{.((((.....)))),.}}|{{,{|||{{{}}||,,|||}|||,,(((((((....)))))))...||,....(((((((((((....))))).))))))....{{.{(((((.{((....))})))))).))....,}))}||,.,.)))))..,}}}})))))),......)))))).........
Back