Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_053013.4
Sequence Length
1453 nt
GC Content
0.5643
GACACUGUCCCAGCUGCCACCUAGACUCGGAGCUCCAUCCAAACCUCCAGCGAAGACAUCCCAGCCAUGGCCAUGCAGAAAAUCUUUGCCCGGGAAAUCUUGGACUCCAGGGGCAACCCCACGGUGGAGGUGGACCUGCACACGGCCAAGGGCCGAUUCCGAGCAGCUGUGCCCAGUGGGGCUUCCACGGGUAUCUAUGAGGCUCUGGAACUAAGAGACGGAGACAAAGGCCGCUACCUGGGGAAAGGAGUCCUGAAGGCUGUGGAGAACAUCAACAAUACUCUGGGCCCUGCUCUGCUGCAAAAGAAACUAAGCGUUGUGGAUCAAGAAAAAGUUGACAAAUUUAUGAUUGAGCUAGAUGGGACCGAGAAUAAGUCCAAGUUUGGGGCCAAUGCCAUCCUGGGCGUGUCCUUGGCCGUGUGUAAGGCGGGAGCAGCUGAGAAGGGGGUCCCCCUGUACCGCCACAUCGCAGAUCUCGCUGGGAACCCUGACCUCAUACUCCCAGUGCCAGCCUUCAAUGUGAUCAACGGGGGCUCCCAUGCUGGAAACAAGCUGGCCAUGCAGGAGUUCAUGAUUCUGCCUGUGGGAGCCAGCUCCUUCAAGGAAGCCAUGCGCAUUGGCGCCGAGGUCUACCACCACCUCAAGGGGGUCAUCAAGGCCAAGUAUGGGAAGGAUGCCACCAAUGUGGGUGAUGAAGGUGGCUUCGCACCCAACAUCCUGGAGAACAAUGAGGCCCUGGAGCUGCUGAAGACGGCCAUCCAGGCGGCUGGUUACCCAGACAAGGUGGUGAUCGGCAUGGAUGUGGCAGCAUCUGAGUUCUAUCGCAAUGGGAAGUACGAUCUUGACUUCAAGUCGCCUGAUGAUCCCGCACGGCACAUCACUGGGGAGAAGCUCGGAGAGCUGUAUAAGAGCUUUAUCAAGAACUAUCCUGUGGUCUCCAUCGAAGACCCCUUUGACCAGGAUGACUGGGCCACUUGGACCUCCUUCCUCUCGGGGGUGAACAUCCAGAUUGUGGGGGAUGACUUGACAGUCACCAACCCCAAGAGGAUUGCCCAGGCCGUUGAGAAGAAGGCCUGCAACUGUCUGCUGCUGAAGGUCAACCAGAUCGGCUCGGUGACCGAAUCGAUCCAGGCGUGCAAACUGGCUCAGUCUAAUGGCUGGGGGGUGAUGGUGAGCCACCGCUCUGGGGAGACUGAGGACACAUUCAUUGCUGACCUUGUGGUGGGGCUCUGCACAGGACAGAUCAAGACUGGCGCCCCCUGCCGCUCGGAGCGUCUGGCCAAAUACAACCAACUCAUGAGGAUCGAGGAGGCUCUUGGGGACAAGGCAAUCUUUGCUGGACGCAAGUUCCGUAACCCGAAGGCCAAGUGAGAAGCUGGAGGCUCCAGGACUCCACUGGACAGACCCAGGUCUUCCAGACCUGCUUCCUGAAAUAAACACUGGUGCCAACCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-547.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -576.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 282.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((..((.......(((......)))..(((((((.((........(((....)))....(((((.....)))))(((((....)))))......((((...)))).)).))))))).(.(((((((((((((((((((...((((((((..(.((((((.((((.....))))))))))....)..)))).))))...((((..(..((......((((..(((.((((......))))..)))..))))......))..)....)))).((((((((..((((.............))))..)))).((((..(.(((((....))))).)..)))).((((((.((((.........))))..)))))))))).(((((......))))))))))))))))))))).))))))..)))))))...(((((((((.(((((...((((((((.((.....((((((((....((....))...))))))))...((((.((.(((..((..((((((((.((.((..(((.....(((((((..(((((((.........)).)))))..).)))))))))..)).)).))))..((((....)))).(((((........)))))..((.((.((((....(((....)))....)))))).)).(((((((((.(((((....)))))))))).))))))))))..))).))))))((((((...((((....))))..))))))..(((((((((((.......).)))))))))).)))))))))).(((...((((((((((((((.((..(((((((.((((....)))))))(((.(...((((.((.(((......(((((......)))))((((((.......))))))...............((((((.(((((....(((((((.(.(((....((((((((((.(((.((..(((((((((..(((((.........((((((.(((.....))).))))))....))))).))))))..((.(((((.((((((........)).)))).)))))..))....((....)).((((((.((((...)))).)))))).))).)).)))..))))))))))...)))).)))))))))))).)).)))).))).))))))...).)))..........))))..)))))))))))))))))))))))).........((.(((((.....))))).))(((((.((((((.............(((((..((.(((.((.((..((((.(..((..((((...))))))..).))))..))....)))))...))..)))))..)))))).))))).))))))).))))))))...(((((((...))))))).................((((....)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((((((((..((.......(({...,,.|||..(((((((.((,{({..({((,,...,|}....(((((.....)))))|||||}..})))||...}}.((((...)))).)).))))))),|,(((((((((((((((((((.,.((((((((..(.((((((.((((,...,)))))))))}....}..)))).))))...,{{{.,({,(,......((((..(((.((((......))))..}))..))))......}}..,....)))),((((((((,,,,,,,,...........,,||{{.{((.((((..,.(((((....))))).}..)))).)}}|}|,((((.........)))).,}},,)))))).(((((......))))))))))))))))))))),,)).))..)))))))....(((((,(((({,((.....(((((.(.((....((((((((....{{....}}...))))))))..,,.)).).)))))....)))))))))))).{(((((.......,},.))).))}(((((((.(((,{(((((((((((((((..{.((..(((((..(((.,((((....)))).,.))}....((((((((...{(,((.((((....(((....)))....)))))).)).(((((((((.(((((....))))))))))},))).((((.(...(((.((.(((((((...((((....))))..)))))).).)).))).)))))...)))))))).(((((((((((((((((((.((((((((((.((.(,,{,,(((({.({...,||}}}}).,)}|}|{{({((..{({....))..)}))}.})}))))}})))))))..)))))...{(..{{{....,}}..}}.((((.,(((((((.{({...(((((((.(.(((....((((((((((.(((.((..{{,((((((.,((({(......,{,{{{{{|,|{(,.,,,||}.}})))),,}.,)))).)))))),{({.,(((((.{{.....,,.))))))}},..{{{{{,....,..||,,..||.((((((.((((...)))).)))))),))),)).))}..))))))))))...)))).)))))))..|{{{(,,,}}}})})),},))))))),)))))))))))),})))))))))).)).}.)))))).)))))).))))))).((.(((({.....})))).))(((((.((((((.............(((((..((.(((.({.((..((((.(..(,.{((({...})))))..).))))..))....)))))...))..)))))..)))))).))))).)))))))...))))))...(((((((...))))))).................((((....)))).
Back