Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_058195.4

Sequence Length

1052 nt

GC Content

0.5827

ACCUCUGGUGCCAAAGGGCGGCGCAGCGGCUGCCGAGCUCGGCCCUGGAGGCGGCGAGAACAUGGUGCGCAGGUUCUUGGUGACCCUCCGGAUUCGGCGCGCGUGCGGCCCGCCGCGAGUGAGGGUUUUCGUGGUUCACAUCCCGCGGCUCACGGGGGAGUGGGCAGCGCCAGGGGCGCCCGCCGCUGUGGCCCUCGUGCUGAUGCUACUGAGGAGCCAGCGUCUAGGGCAGCAGCCGCUUCCUAGAAGACCAGGUCAUGAUGAUGGGCAGCGCCCGAGUGGCGGAGCUGCUGCUGCUCCACGGCGCGGAGCCCAACUGCGCCGACCCCGCCACUCUCACCCGACCCGUGCACGACGCUGCCCGGGAGGGCUUCCUGGACACGCUGGUGGUGCUGCACCGGGCCGGGGCGCGGCUGGACGUGCGCGAUGCCUGGGGCCGUCUGCCCGUGGACCUGGCUGAGGAGCUGGGCCAUCGCGAUGUCGCACGGUACCUGCGCGCGGCUGCGGGGGGCACCAGAGGCAGUAACCAUGCCCGCAUAGAUGCCGCGGAAGGUCCCUCAGACAUCCCCGAUUGAAAGAACCAGAGAGGCUCUGAGAAACCUCGGGAAACUUAGAUCAUCAGUCACCGAAGGUCCUACAGGGCCACAACUGCCCCCGCCACAACCCACCCCGCUUUCGUAGUUUUCAUUUAGAAAAUAGAGCUUUUAAAAAUGUCCUGCCUUUUAACGUAGAUAUAUGCCUUCCCCCACUACCGUAAAUGUCCAUUUAUAUCAUUUUUUAUAUAUUCUUAUAAAAAUGUAAAAAAGAAAAACACCGCUUCUGCCUUUUCACUGUGUUGGAGUUUUCUGGAGUGAGCACUCACGCCCUAAGCGCACAUUCAUGUGGGCAUUUCUUGCGAGCCUCGCAGCCUCCGGAAGCUGUCGACUUCAUGACAAGCAUUUUGUGAACUAGGGAAGCUCAGGGGGGUUACUGGCUUCUCUUGAGUCACACUGCUAGCAAAUGGCAGAACCAAAGCUCAAAUAAAAAUAAAAUAAUUUUCAUUCAUUCACUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-419.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -435.73

Frequency: 0.0000

Diversity: 177.90

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((.((....)).)))((((((....((((((((.((((((..(((((((((.(((((((.((.....)).))))))).))..)))))))..)))).)).)).))))))))))))((((((((((((((.(((((((((((((.((.....)).))))((((((.((.(...).))))))))((((..(((((((((((....)).)).)))).)))))))(((((((.(((....)))))))))).......(((((((.(.(.((((((..((((((((((((((.......))))).((((((((.......)))))))).....)))))))...((((.(((((((((..((((((((((((.....))))))....)).))))..).)))).)))).)))).((((((....((((((((.((((((.(((.(((.((..((((.(((((((....))))))))))).)))))))).)).))))..))))))))))))))((((((....(((((.((((..((((((((((.((((.((((((((((..((((((...((.(..(((.......))).).)).))))))..(((((((...(((.........)))..))).))))......((((.......)))).................(((((....((((((.....)))))))))))........(((((.(((........))))))))..))))))).........((((((....)))))).....((((((((......))))))))........(((((......(((((.(((........).)).))))))))))((.((((....)))).))....)))..)))).))))))))))...))))..)))))...))))))))..)))))).)).)))))))........))))))))).))))))))(((((((((...)))))))))(((((....((((((.....)))))).......)))))(((.(((((......))))).)))...)))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((.((....)).)))((((((....((((((((.((((((..(((((((((.(((((((.((.....)).))))))).))..)))))))..)))).)).)).))))))))))))((((((((((((((.(((((((((((((.((.....)).))))((((((.((.(...,,))))))))((({.,(((((((((((....)).)).)))).)))))))(((((((.(((....)))))))))).......(((((((.(.(.((((((..((((((((((((((.......))}}}.((((((((.......))))))))...,,)))))))...((((.(((((((({,.((((((((((((,...,))))))....)).}))),)).)))),}))).)))).((((((,...((((((((.((((((.(({,(((.((..((((.(((((((....))))))))))).)))))))).)).)))).,})))))))))))))((((((....(((((.((((..((((((((((.((((.((((((((({...,{{,,.{{(..({.((({{{{...{{{.|,((((((({{..(((((((...{((.......,.)))..))),}))).}}.)))))))....,,{{....||.............{{{{{.,,,|{((((.....)))}}}}}}}}.,......||||}}||,}}}}}}}}),,))),,.,)))))))..{{{{.{{(,(((,.{{,||||||,.{,{((((((((......))))))))))}},,,,|{{{,,.,...((..,.||.........),)}}))),}))),)||}|||,,,..,,,},),....)))..)))).))))))))))...))))..)))))...))))))))..)))))).)).)))))))........))))))))).))))))))((((((((,...})))))))}(((((....((((((.....)))))).......))))),...{{(({......}}))}.,,....)))))).