Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_138455.4
Sequence Length
1240 nt
GC Content
0.4435
GAAAGGCGCAUUGAUGCAGCCUGCGGCGGCCUCGGAGCGCGGCGGAGCCAGACGCUGACCACGUUCCUCUCCUCGGUCUCCUCCGCCUCCAGCUCCGCGCUGCCCGGCAGCCGGGAGCCAUGCGACCCCAGGGCCCCGCCGCCUCCCCGCAGCGGCUCCGCGGCCUCCUGCUGCUCCUGCUGCUGCAGCUGCCCGCGCCGUCGAGCGCCUCUGAGAUCCCCAAGGGGAAGCAAAAGGCGCAGCUCCGGCAGAGGGAGGUGGUGGACCUGUAUAAUGGAAUGUGCUUACAAGGGCCAGCAGGAGUGCCUGGUCGAGACGGGAGCCCUGGGGCCAAUGGCAUUCCGGGUACACCUGGGAUCCCAGGUCGGGAUGGAUUCAAAGGAGAAAAGGGGGAAUGUCUGAGGGAAAGCUUUGAGGAGUCCUGGACACCCAACUACAAGCAGUGUUCAUGGAGUUCAUUGAAUUAUGGCAUAGAUCUUGGGAAAAUUGCGGAGUGUACAUUUACAAAGAUGCGUUCAAAUAGUGCUCUAAGAGUUUUGUUCAGUGGCUCACUUCGGCUAAAAUGCAGAAAUGCAUGCUGUCAGCGUUGGUAUUUCACAUUCAAUGGAGCUGAAUGUUCAGGACCUCUUCCCAUUGAAGCUAUAAUUUAUUUGGACCAAGGAAGCCCUGAAAUGAAUUCAACAAUUAAUAUUCAUCGCACUUCUUCUGUGGAAGGACUUUGUGAAGGAAUUGGUGCUGGAUUAGUGGAUGUUGCUAUCUGGGUUGGUACUUGUUCAGAUUACCCAAAAGGAGAUGCUUCUACUGGAUGGAAUUCAGUUUCUCGCAUCAUUAUUGAAGAACUACCAAAAUAAAUGCUUUAAUUUUCAUUUGCUACCUCUUUUUUUAUUAUGCCUUGGAAUGGUUCACUUAAAUGACAUUUUAAAUAAGUUUAUGUAUACAUCUGAAUGAAAAGCAAAGCUAAAUAUGUUUACAGACCAAAGUGUGAUUUCACACUGUUUUUAAAUCUAGCAUUAUUCAUUUUGCUUCAAUCAAAAGUGGUUUCAAUAUUUUUUUUAGUUGGUUAGAAUACUUUCUUCAUAGUCACAUUCUCUCAACCUAUAAUUUGGAAUAUUGUUGUGGUCUUUUGUUUUUUCUCUUAGUAUAGCAUUUUUAAAAAAAUAUAAAAGCUACCAAUCUUUGUACAAUUUGUAAAUGUUAAGAAUUUUUUUUAUAUCUGUUAAAUAAAAAUUAUUUCCAACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-375.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -401.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 329.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((.((((.((.(((...))).)).)))).))))((((........))))((((((.(((((((((((((.(((((((..((((.(((((..(((((...)))))..)))))........((((((...((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))....))))))))..(((((.(.((......((((((......((((....))))......)))))).)).).))))).))))))))))))...(((((..((((((((.....((..((((..((((.((.((((.......)))).)))))).))))..)))))))))).)))))))))))(((((.....))))).........))))....))))))..).)))))))........))))))((((((((((.............))))))).)))(((((.(((((((((((...((...((((((.....(((((((..((((.(((((................((((...)))))))))..))))...)))))))((......)).((((((((((((...)))))..))))))).........((..((((....))))..))..))))))))...)))))))))))..)))))....(((((...(((((((((............((((.(((((.((((((....))))))...)))))..)))).(((((((((((((((((.(((((..(.(((.((((((.((.((((......((....)).(((((....(((((((...))))))).....))))).....)))).)).)))))).......(((((..((((((((((...............((((...((((((((..(((......)))))))))))))))...............))))))))))..)))))................))).)..))))).)).))))).......))))))))))))))))))))))))........)))))).(((((((((........((((((((((((........)))...)))))...))))........)))))))))..((((.(((((((.((((...((((..........)))).)))).)))))))))))....))))..............((((..((((..(((((((.........)))))))..))))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,..{{(((((,,,.|||.|||}(,((((((..((((((,.(((((((..,((,,{,((..............}})))}),)))))))....)))))).)))))),})){.(((((((((((..(.((((((((((((((((((((((.((((((((...(((((.....)))))....)))))))).,({{{{.|,((,,....((((((.,....((((....))))......)))))).)).},)))}).)))))))))}||.{{,(({,,......||},}...,..,{(((((((....))}})))))....}))).)))))))))}}.))))).)))))).}..((((((....)))))).{(((,{({..{,,(((({{{{,(((((((((({(((((((((((((((((((((((((((({((((({{{...{(,,|(((({,{{...,}|.|||||.,|,||.},}...}}}|}......,(((((((,,{{{{.{|{{{{,,|||,,,...,,|.||||,..}}}}})))),.})))...)))}|||((,...,{||.((((((({((({...})))}..))))))).,,||||.,..,}}))),)))))))))}}))))).....))))))......{{(((,{(((({.(((((...(((((((({............,(((.(((((.((((((....))))))...))))).,)))}||((((((((((,,{((({{..,,}}}}||,.((((((.((.((((,.....((....)).(((((....(((((((...))))))).....)))))....,)))).)).)))))}.......(((((..((((((((({...............,,,,,..{(((((((..{{{......}}}))))))))}}}},.....,........,)))))))))..))))).......,,,,,.,{||...((((((....)))))),,,....))))))))))})))))))))))))),,,,{,,,{||}}}....}},,,,,.....})))}}.)))}}.)))))))}.,}..)))))))))).,,({(((((..........)))))))}}}}}},..)))))))},....((((,(((,{{,,....|||||||}}}},...,}}}))))},,},)),,,,||||,.{(((..(((((({.........)))))))..)))),.}}},.
Back