Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_139029.2
Sequence Length
1541 nt
GC Content
0.6152
AUUCUCAGCGCUGGGAGCCGCCGCCCCCGCAGCUGCUGCCGCCGCCGCCAGGGCCCGGACUCGGACGCGUGCCUAGAGUCCUGGGGAGCUUCUGUCCACCUGUCCUGCAGAGGAGUCGUUUCCAGCCCGGCUGCCCCAGGAUGGGUGAGUUCAACGAGAAGAAGACAACAUGUGGCACCGUUUGCCUCAAGUACCUGCUGUUUACCUACAAUUGCUGCUUCUGGCUGGCUGGCCUGGCUGUCAUGGCAGUGGGCAUCUGGACGCUGGCCCUCAAGAGUGACUACAUCAGCCUGCUGGCCUCAGGCACCUACCUGGCCACAGCCUACAUCCUGGUGGUGGCGGGCACUGUCGUCAUGGUGACUGGGGUCUUGGGCUGCUGCGCCACCUUCAAGGAGCGUCGGAACCUGCUGCGCCUGUACUUCAUCCUGCUCCUCAUCAUCUUUCUGCUGGAGAUCAUCGCUGGUAUCCUCGCCUACGCCUACUACCAGCAGCUGAACACGGAGCUCAAGGAGAACCUGAAGGACACCAUGACCAAGCGCUACCACCAGCCGGGCCAUGAGGCUGUGACCAGCGCUGUGGACCAGCUGCAGCAGGAGUUCCACUGCUGUGGCAGCAACAACUCACAGGACUGGCGAGACAGUGAGUGGAUCCGCUCACAGGAGGCCGGUGGCCGUGUGGUCCCAGACAGCUGCUGCAAGACGGUGGUGGCUCUUUGUGGGCAGCGAGACCAUGCCUCCAACAUCUACAAGGUGGAGGGCGGCUGCAUCACCAAGUUGGAGACCUUCAUCCAGGAGCACCUGAGGGUCAUUGGGGCUGUGGGGAUCGGCAUUGCCUGUGUGCAGGUCUUUGGCAUGAUCUUCACGUGCUGCCUGUACAGGAGUCUCAAGCUGGAGCACUACUGACCCUGCCUUGGGCCUUGCUGCUGCUGCACCCAACUACUGAGCUGAGACCACUGAGUACCAGGGGCUGGGCUCCCUGAUGACACCCACCCUGUGCCAUCACCAUAACCUCUGGGGACCCCAACCUCAGAGGCAGCUUCAAGUGCCUUUUGCUGCGCACCAAUGCCCAGCAGGGGAGGUGAGGGGGGCUGGCGGGGCGAAGUUUGGGGGGUGUUUUGUGGGGCUCCCCAGACACACUCUCUGCCUGGUGGUCAGAUGCAGGUUGGAAGGGGCCUUGCUGAGUGGCGCAAGGCCGAGCGUUCCCAGCAGGGGGAGAAACCCUUCACACCCCAGGCCCUUCAGGAACUGGGGCCUUGCCUUGCAGCCACAUGGCCCCAUCCCAGUUGGGGAAGCCAGGUGAGCUCUGACCCUUGGGCCUGGGCCUCUGCCCCUCCCAACCCAGCCCUCGUCUCCCUCGACAGCGCCCCUGCUGUCUUCCCCACCGCAGUCACCACCACCCGAAAUGCCACGUGGUCACUGUGCACUGCCCUGUUCAUGUGCCUCUGCGGGGCAGGGCCUUCCUGGUUUUGUUCACUGCUGUACCCAGAUGCCUACAACCAUCCCUGCCACAUACAGGUGCUCAAUAAACACUUGUAGAGCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-669.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -694.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 437.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((.(((.((....))))).)).))))((((.((((((((((((((.....((((...((.(((((...(((((((((((((.(((...((...((((....))))...))...)))...)))).)))))))))))))).))....)))).........((.((.((((.....)))).)).))....(((((......)))...)).)).)))))).))).))).((((.(..((((..((((((((((((..(((((...(((....))).....)))))..(((((((.(((((.......(((.((((((((.((((((((((((((..(((.((...(((((((((..(((((...(((((....)).))).)))))(((.(((.(((...))).))).)))...((((((((((((((...(((.....(((((((((.....((..(((......)))..))....)).))))))).)))....)))))...)))).....)))))..)))))))))..)).))).)))))).)))))..))))))))))).))))).))).)).))))).(((((((........))))))).((((((((((..(.(((((..(((......(((((((....))))))).((((((..((((.(.(((.((((((((.(((((((((......))))))))).)))).)))).))).).))))))))))........((((((..(((((((.(((....(((.(((.((((((((....(((((((((.((((((((((....(((..(((((((.((((.......)))).)))))))))))))))))))).))))).))))...))).))))).)))))).)))...))).))))))))))(((((((..(((((..............(((((.((.((.(((.....))).)))).)))))..(((((.(((.......))).))))).......((((((((.......)))))))))))))..)))).)))...(((((.(((....))).)))))((((((((((((((((.(((.((((((..(((((((((((.((....)).))))))))))).....(((.((((((.(((((((.((.....(((.((((((.......((((((((((((...((.......))(((((......)))))....((((((..((....))..))))))....))))))).)))))..)))))).)))((.((((.....)))).)).))))))))).))))))..)))....))))))..))).)))..))))))))))))).((((((......))))))........((((((.(((((...............))))).))))))..(((((((((............))))))))).))).))))))..))))....))))))..))))))))))))..))))..).))))..((((((((.........))))))))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((.(((.((....))))).)).))))((((,((((((((((((,(((((((((((.,....,}),.)))))).))),.,(({(({{{(((((((((((..{.({(((((.........))))).)},))))))))))).},....,.}}}}).,,.,.,{.((.((((.....)))).)),||,...{,{((......}}}...)},}}})))))).))).))).((((.{..((((..((((((((((((.,((((({({.({,,{{{{{,,,{.,|,(({.({{{{{{,{{{|,.....,|||{.((((((((.((((((((((((((..(((.((...(((((((((.{{,({((,,{(((({.{,||,|,,,{{,,.{((,(({.,((,..,}|.|}}.},.}},,{{{.|||{|||||,..,,,.....(((((((((.....((..(((......)))..))....)).))))))).,))....))))),,,)))}..,}}),})),.)))))))))..)).))).)))))},)))))..))))))))))).}||||}|||,||.}}}||{(((((((..,.....))))))),|||||,{{{{..{,({(((,,(((......(((((((....))))))).{{{{||}}||{{}{,|||,||||{{{{,{(({{{{({......)))))}))),)))).)))),))).}.}}},}|||||..,.....,,{|{|}||||{(((,{((...,(({,{{{,(((((((({...{((({{{{|,||||||||{{.,{{((({{((((({,{((,,.}}}..,||||{|||}},.||||||}}}}}}},))))),)))),},}})||||||.,}}}})})}),,.}},.||||||,,||(((,(((.{((,((.{{,......,,,,(((((,{{.{{.{((.,,..}}|||}}},|}}}}..{((((.(((.......))).))))}......{((((((((.......)))))))))))))..}})),)}}...|||,|}|||.}},,))})))))|||((((,((,(((((((((.((((,{..(((((((((((.((....)).))))))))))).....,,,.((((((.(((((((.((.....(((.((((((.,.....((((((((((({.{{(,,..,,,.},,{{{(,.,...,}})),...((((((..((....))..)))))),})}))))))).)))))..)))))).})}((.{{((,....)))).)).))))))))).)}))))..|||{....))))}.})),.,))})))))).)),})))}((((((,....,)))))).}}})),,((((((.(((((..........,....))))).))))))..(((((((((............)))))))))}))).)))))),.})))...,}))))}..))))))))))))..))))..}.))))..((((((((.........)))))))),.)))).
Back