Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_139344.3

Sequence Length

2358 nt

GC Content

0.6183

CUCUGUCCCCGCGUCGCUCGCUGGCUAGCUCGCUGGCUCGCUCGCCCGUCCGGCGCACGCUCCGCCUCCGUCAGUUGGCUCCGCUGUCGGGUGCGCGGCGUGGAGCGGCAGCCGGUCUGGACGCGCGGCCGGGGCUGGGGGCUGGGAGCGCGGCGCGCAAGAUCUCCCCGCGCGAGAGCGGCCCCUGCCACCGGGCGAGGCCUGCGCCGCGAUGGCAGAGAUGGGCAGUAAAGGGGUGACGGCGGGAAAGAUCGCCAGCAACGUGCAGAAGAAGCUCACCCGCGCGCAGGAGAAGGUUCUCCAGAAGCUGGGGAAGGCAGAUGAGACCAAGGAUGAGCAGUUUGAGCAGUGCGUCCAGAAUUUCAACAAGCAGCUGACGGAGGGCACCCGGCUGCAGAAGGAUCUCCGGACCUACCUGGCCUCCGUCAAAGCCAUGCACGAGGCUUCCAAGAAGCUGAAUGAGUGUCUGCAGGAGGUGUAUGAGCCCGAUUGGCCCGGCAGGGAUGAGGCAAACAAGAUCGCAGAGAACAACGACCUGCUGUGGAUGGAUUACCACCAGAAGCUGGUGGACCAGGCGCUGCUGACCAUGGACACGUACCUGGGCCAGUUCCCCGACAUCAAGUCACGCAUUGCCAAGCGGGGGCGCAAGCUGGUGGACUACGACAGUGCCCGGCACCACUACGAGUCCCUUCAAACUGCCAAAAAGAAGGAUGAAGCCAAAAUUGCCAAGCCUGUCUCGCUGCUUGAGAAAGCCGCCCCCCAGUGGUGCCAAGGCAAACUGCAGGCUCAUCUCGUAGCUCAAACUAACCUGCUCCGAAAUCAGGCCGAGGAGGAGCUCAUCAAAGCCCAGAAGGUGUUUGAGGAGAUGAAUGUGGAUCUGCAGGAGGAGCUGCCGUCCCUGUGGAACAGCCGCGUAGGUUUCUACGUCAACACGUUCCAGAGCAUCGCGGGCCUGGAGGAAAACUUCCACAAGGAGAUGAGCAAGCUCAACCAGAACCUCAAUGAUGUGCUGGUCGGCCUGGAGAAGCAACACGGGAGCAACACCUUCACGGUCAAGGCCCAGCCCAGUGACAACGCGCCUGCAAAAGGGAACAAGAGCCCUUCGCCUCCAGAUGGCUCCCCUGCCGCCACCCCCGAGAUCAGAGUCAACCACGAGCCAGAGCCGGCCGGCGGGGCCACGCCCGGGGCCACCCUCCCCAAGUCCCCAUCUCAGUUUGAGGCCCCGGGGCCUUUCUCGGAGCAGGCCAGUCUGCUGGACCUGGACUUUGACCCCCUCCCGCCCGUGACGAGCCCUGUGAAGGCACCCACGCCCUCUGGUCAGUCAAUUCCAUGGGACCUCUGGGAGCCCACAGAGAGUCCAGCCGGCAGCCUGCCUUCCGGGGAGCCCAGCGCUGCCGAGGGCACCUUUGCUGUGUCCUGGCCCAGCCAGACGGCCGAGCCGGGGCCUGCCCAACCAGCAGAGGCCUCGGAGGUGGCGGGUGGGACCCAACCUGCGGCUGGAGCCCAGGAGCCAGGGGAGACGGCGGCAAGUGAAGCAGCCUCCAGCUCUCUUCCUGCUGUCGUGGUGGAGACCUUCCCAGCAACUGUGAAUGGCACCGUGGAGGGCGGCAGUGGGGCCGGGCGCUUGGACCUGCCCCCAGGUUUCAUGUUCAAGGUACAGGCCCAGCACGACUACACGGCCACUGACACAGACGAGCUGCAGCUCAAGGCUGGUGAUGUGGUGCUGGUGAUCCCCUUCCAGAACCCUGAAGAGCAGGAUGAAGGCUGGCUCAUGGGCGUGAAGGAGAGCGACUGGAACCAGCACAAGGAGCUGGAGAAGUGCCGUGGCGUCUUCCCCGAGAACUUCACUGAGAGGGUCCCAUGACGGCGGGGCCCAGGCAGCCUCCGGGCGUGUGAAGAACACCUCCUCCCGAAAAAUGUGUGGUUCUUUUUUUUGUUUUGUUUUCGUUUUUCAUCUUUUGAAGAGCAAAGGGAAAUCAAGAGGAGACCCCCAGGCAGAGGGGCGUUCUCCCAAAGAUUAGGUCGUUUUCCAAAGAGCCGCGUCCCGGCAAGUCCGGCGGAAUUCACCAGUGUUCCUGAAGCUGCUGUGUCCUCUAGUUGAGUUUCUGGCGCCCCUGCCUGUGCCCGCAUGUGUGCCUGGCCGCAGGGCGGGGCUGGGGGCUGCCGAGCCACCAUGCUUGCCUGAAGCUUCGGCCGCGCCACCCGGGCAAGGGUCCUCUUUUCCUGGCAGCUGCUGUGGGUGGGGCCCAGACACCAGCCUAGCCUGGCUCUGCCCCGCAGACGGUCUGUGUGCUGUUUGAAAAUAAAUCUUAGUGUUCAAAACAAAAUGAAACAAAAAAAAAAUGAUAAAAACUCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-994.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1031.93

Frequency: 0.0000

Diversity: 620.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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