Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_139345.3

Sequence Length

2226 nt

GC Content

0.6164

CUCUGUCCCCGCGUCGCUCGCUGGCUAGCUCGCUGGCUCGCUCGCCCGUCCGGCGCACGCUCCGCCUCCGUCAGUUGGCUCCGCUGUCGGGUGCGCGGCGUGGAGCGGCAGCCGGUCUGGACGCGCGGCCGGGGCUGGGGGCUGGGAGCGCGGCGCGCAAGAUCUCCCCGCGCGAGAGCGGCCCCUGCCACCGGGCGAGGCCUGCGCCGCGAUGGCAGAGAUGGGCAGUAAAGGGGUGACGGCGGGAAAGAUCGCCAGCAACGUGCAGAAGAAGCUCACCCGCGCGCAGGAGAAGGUUCUCCAGAAGCUGGGGAAGGCAGAUGAGACCAAGGAUGAGCAGUUUGAGCAGUGCGUCCAGAAUUUCAACAAGCAGCUGACGGAGGGCACCCGGCUGCAGAAGGAUCUCCGGACCUACCUGGCCUCCGUCAAAGCCAUGCACGAGGCUUCCAAGAAGCUGAAUGAGUGUCUGCAGGAGGUGUAUGAGCCCGAUUGGCCCGGCAGGGAUGAGGCAAACAAGAUCGCAGAGAACAACGACCUGCUGUGGAUGGAUUACCACCAGAAGCUGGUGGACCAGGCGCUGCUGACCAUGGACACGUACCUGGGCCAGUUCCCCGACAUCAAGUCACGCAUUGCCAAGCGGGGGCGCAAGCUGGUGGACUACGACAGUGCCCGGCACCACUACGAGUCCCUUCAAACUGCCAAAAAGAAGGAUGAAGCCAAAAUUGCCAAGCCUGUCUCGCUGCUUGAGAAAGCCGCCCCCCAGUGGUGCCAAGGCAAACUGCAGGCUCAUCUCGUAGCUCAAACUAACCUGCUCCGAAAUCAGGCCGAGGAGGAGCUCAUCAAAGCCCAGAAGGUGUUUGAGGAGAUGAAUGUGGAUCUGCAGGAGGAGCUGCCGUCCCUGUGGAACAGCCGCGUAGGUUUCUACGUCAACACGUUCCAGAGCAUCGCGGGCCUGGAGGAAAACUUCCACAAGGAGAUGAGCAAGCUCAACCAGAACCUCAAUGAUGUGCUGGUCGGCCUGGAGAAGCAACACGGGAGCAACACCUUCACGGUCAAGGCCCAGCCCAGUGACAACGCGCCUGCAAAAGGGAACAAGAGCCCUUCGCCUCCAGAUGGCUCCCCUGCCGCCACCCCCGAGAUCAGAGUCAACCACGAGCCAGAGCCGGCCGGCGGGGCCACGCCCGGGGCCACCCUCCCCAAGUCCCCAUCUCAGCCCACAGAGAGUCCAGCCGGCAGCCUGCCUUCCGGGGAGCCCAGCGCUGCCGAGGGCACCUUUGCUGUGUCCUGGCCCAGCCAGACGGCCGAGCCGGGGCCUGCCCAACCAGCAGAGGCCUCGGAGGUGGCGGGUGGGACCCAACCUGCGGCUGGAGCCCAGGAGCCAGGGGAGACGGCGGCAAGUGAAGCAGCCUCCAGCUCUCUUCCUGCUGUCGUGGUGGAGACCUUCCCAGCAACUGUGAAUGGCACCGUGGAGGGCGGCAGUGGGGCCGGGCGCUUGGACCUGCCCCCAGGUUUCAUGUUCAAGGUACAGGCCCAGCACGACUACACGGCCACUGACACAGACGAGCUGCAGCUCAAGGCUGGUGAUGUGGUGCUGGUGAUCCCCUUCCAGAACCCUGAAGAGCAGGAUGAAGGCUGGCUCAUGGGCGUGAAGGAGAGCGACUGGAACCAGCACAAGGAGCUGGAGAAGUGCCGUGGCGUCUUCCCCGAGAACUUCACUGAGAGGGUCCCAUGACGGCGGGGCCCAGGCAGCCUCCGGGCGUGUGAAGAACACCUCCUCCCGAAAAAUGUGUGGUUCUUUUUUUUGUUUUGUUUUCGUUUUUCAUCUUUUGAAGAGCAAAGGGAAAUCAAGAGGAGACCCCCAGGCAGAGGGGCGUUCUCCCAAAGAUUAGGUCGUUUUCCAAAGAGCCGCGUCCCGGCAAGUCCGGCGGAAUUCACCAGUGUUCCUGAAGCUGCUGUGUCCUCUAGUUGAGUUUCUGGCGCCCCUGCCUGUGCCCGCAUGUGUGCCUGGCCGCAGGGCGGGGCUGGGGGCUGCCGAGCCACCAUGCUUGCCUGAAGCUUCGGCCGCGCCACCCGGGCAAGGGUCCUCUUUUCCUGGCAGCUGCUGUGGGUGGGGCCCAGACACCAGCCUAGCCUGGCUCUGCCCCGCAGACGGUCUGUGUGCUGUUUGAAAAUAAAUCUUAGUGUUCAAAACAAAAUGAAACAAAAAAAAAAUGAUAAAAACUCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-934.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -969.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 585.00

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((((((((((((((((.(((.(((.(((((.(((.((((.(.(((((((.((((((((..((((((.(((((......))))).)).)))).)))))))))).))))).).)).)).))))))))(((.((((((((...((((((.(.(......).).)))))).....)))))))))))..(((((...))))).(((.....))).))).))).))))....))))))).))))).....((.(((((..(((((.(..((...))..).)))))..(((((....)))))....))))).)).))))))(((((....(((((.((.((....)).)).)))))..........(((((((((((((((((.((...(((((.(((....))).))).))....)).))))))))).......(((((.((((((...))))))....((.(((((((.((.(((((....(((((..((((.((((.((((...(((.........(((((((.........)).))))).........(((((((...))))))).(((((.((((((......)).)).)).))))))))...)))).(((.....))).(((........)))(((((((((((((((((.((.((.((((.((((((..............(((((..((..........))..))))).........((((((((((((((((..........(((((((.(((.((((((((..(((...((((((((((((((....(((((((..(((((((((....((.....))...)))))...............)))))))))))))))))).((((..(((.((((..((((((((((((((((((((...((((((((....))))))........(((((.((.......))))))))).....)))))).))).)))).)).))))).(((((.((.((...)).)).)))))...)))).)))..).)))((((((......)))).))((((.(((...)))...)))).....))))))).(((((........)))))...((((...(((((((....((((((((.(((((.((.(..((......))..).))((((((.(((.((((...))))(((((............)))))..((((........))))).)).))))))....(((((((..((.(((.....))).)))))))))(((((((((.((((((((.(.(((....))).).)))))))).........))))))))).))))).)))))))).((((..(((.((...)).)))..)))))))))))..))))(((((((((.(.((((.(((.....)))..))))))))))))))(.(((........))).)...)))...))))))))))).)))))))))))))))..)).)))))).(((((((((((((..(((((....((((((((((((((((.(((((.(((((.(((...)))..((((....))))..))))))))..)).)))))))(((.(((((((......((((.....))))..)))))..)).))).((((((..(((((..(((((((((((((((......((((((....(((((.((((((((....((((((..(.((((..(((((((........)))))))..((((((....))).)))..(((((.((.((((........(((.(((.(((((((((.(((((.((((.((((((((.....)))))))))))).))))).)))))))))...))).))))))))).)))))........)))))..))))))....)))..))))).)))))..))))))(((((........)))))......))))).))..))))))))..))))).))))))..))))))))).)))))...)))))).....))))))))))))).)))).)))))))))).)))))).....))))).)))).))))..)))))..(((((((....(((((((....)))).))).)))))))..)))))((((......))))....)).))))))).))))))))))))))).............((.((((........))))))....................)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((((((((((((((((((,(({,((({({({(,(((.((((,(.(((((((.((((((((..((((((.(((((......))))).)).)))).)))))))))).))))).}.)).)),}|||||||(((,{(((((((...((((((.(.(......,.}.)))))).....)))))))}))).}}|)|),.}})}.)})}|})).,)))}))).})),))))....)))))))||)))).....((.(((((..(((((.{..,....})..}.)))))..(((((....)))))....))))).)).)))))){((((....(((((.((.((....}}.)).))))),,,.,{{,..(((((((((((((((((.((...(((((.(((....))).))).))....)).))))))))).,{{(,,{{{,..||{({{..,||,|||.....})),})),{{|||{|||,,,|.(((((..({((,((({.(({{,,,(((........{{((((,{........,)),)}}|||.|{,....(((((((...))))))).(((((,((((((,.....|}.}}.)}.)))))}}},|,}|||,(((.....))).(((...|,,,,||}}|||.((((((((((((.((.((.((((,((((((.((,{,.......,(((({..{{........},)),.)}}}}.......,,{((((({{(({{{||{||}},.....(((((((.(((.((((((((..(({...((((((((((((((....(((((((..{((((((((....{(.....))...)))))...,,........,.)))))))))))))))))).{(,(,.(((.{{((..((((((((((((((((((((...{{((((((....)))))).......,(((((.((.......))))))))}.....)))))),,)).)))).)),,)))).,||||,,|},|,..},,||,||||},,,|||},}}}..}..|.{(((((......)))).})|||{.|||,..))),,,)}))..,..))))))).(((((........)))))...((((...(((((((,...((((((((.(((((..,.{..{{......}}..}.,.(({{((,(((,((((...})}}((((.......,,,,..),)))}.((((........))))}.}}.)))))).,,.(((((((..((.(((.....))).))))))))}(((((((((.((((((((.(.(((....))).).)))))))).........))))))))).))))).)))))))).((((..(((.((...)).))).,)))))))))))..))))(((((((({,(.((((.(((.....)))..))))))))))))))(.(((.,|...|}))).)...))}...))))))))))).))))))))))))}))}}))}}})})}.(((((,,(((({{..(((((....((((((((((((((((.((,,(,(((((.(((...)))..((((....))))..))))))))..)).))))))){((.(((((((......((((.....)))).,)))))..)).))}.((((((..{((((..(((((((((((((((,.,,,,((((({,...(((((.((((((((....((((((..{.((({..(((((((........)))))))..(({(((....))).)}),.(((((.((.((((........(((.(((.(((((((((.(((((.((((.((((((((.....)))))))))))).))))).)))))))))...))).))))))))).))))),,......}})))..))))))....))),,)))}),))))}..)))))){{{{{.|.,,.,.}}))),...,.))))).))..))))))))..))))).))))))..))))))))).))))).,.)))))),,}}}))}}})})))))),))}).)))))))))).))))))}}...))))}})))),)))}.,)))))..|||,,,,,.,,))))}((((((((((((((((((({{{((.,.........,.))))))))))))))))).))),)))),,)))))))),,......,,,...{{((((........))}},},...................))))}