Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_144585.4

Sequence Length

2792 nt

GC Content

0.6275

AGUCUAAAAUUAAAGUCUUCAGUCUCCACAUUCCCUACUUUCCAAAUUCAGCUUUCCCGGGAGGUCUGGAGCAGCUGCCUCUCUGGGGAGAUGCUGGAGGUCUCGGAAUCACCUCACGCGGCCUCAGGGCCCAGUUGGAGCCACCCCAAGUGACACCAGCAGGCAGAUGACCAGAGAGCCUGAGCCUCCGGCCCCGAGUCUGUGAAGCCUAGCCGCUGGGCUGGAGAAGCCACUGUGGGCACCACCGUGGGGGAAACAGGCCCGUUGCCCUGGCCUCUUUGCCCUGGGCCAGCCUUUGUGAAGUGGGCCCCUCUUCUGGGCCCCUUGAGUAGGUUCCAUGGCAUUUUCUGAACUCCUGGACCUCGUGGGUGGCCUGGGCAGGUUCCAGGUUCUCCAGACGAUGGCUCUGAUGGUCUCCAUCAUGUGGCUGUGUACCCAGAGCAUGCUGGAGAACUUCUCGGCCGCCGUGCCCAGCCACCGCUGCUGGGCACCCCUCCUGGACAACAGCACGGCUCAGGCCAGCAUCCUAGGGAGCUUGAGUCCUGAGGCCCUCCUGGCUAUUUCCAUCCCGCCGGGCCCCAACCAGAGGCCCCACCAGUGCCGCCGCUUCCGCCAGCCACAGUGGCAGCUCUUGGACCCCAAUGCCACGGCCACCAGCUGGAGCGAGGCCGACACGGAGCCGUGUGUGGAUGGCUGGGUCUAUGACCGCAGCAUCUUCACCUCCACAAUCGUGGCCAAGUGGAACCUCGUGUGUGACUCUCAUGCUCUGAAGCCCAUGGCCCAGUCCAUCUACCUGGCUGGGAUUCUGGUGGGAGCUGCUGCGUGCGGCCCUGCCUCAGACAGGUUUGGGCGCAGGCUGGUGCUAACCUGGAGCUACCUUCAGAUGGCUGUGAUGGGUACGGCAGCUGCCUUCGCCCCUGCCUUCCCCGUGUACUGCCUGUUCCGCUUCCUGUUGGCCUUUGCCGUGGCAGGCGUCAUGAUGAACACGGGCACUCUCCUGAUGGAGUGGACGGCGGCACGGGCCCGACCCUUGGUGAUGACCUUGAACUCUCUGGGCUUCAGCUUCGGCCAUGGCCUGACAGCUGCAGUGGCCUACGGUGUGCGGGACUGGACACUGCUGCAGCUGGUGGUCUCGGUCCCCUUCUUCCUCUGCUUUUUGUACUCCUGGUGGCUGGCAGAGUCGGCACGAUGGCUCCUCACCACAGGCAGGCUGGAUUGGGGCCUGCAGGAGCUGUGGAGGGUGGCUGCCAUCAACGGAAAGGGGGCAGUGCAGGACACCCUGACCCCUGAGGUCUUGCUUUCAGCCAUGCGGGAGGAGCUGAGCAUGGGCCAGCCUCCUGCCAGCCUGGGCACCCUGCUCCGCAUGCCCGGACUGCGCUUCCGGACCUGUAUCUCCACGUUGUGCUGGUUCGCCUUUGGCUUCACCUUCUUCGGCCUGGCCCUGGACCUGCAGGCCCUGGGCAGCAACAUCUUCCUGCUCCAAAUGUUCAUUGGUGUCGUGGACAUCCCAGCCAAGAUGGGCGCCCUGCUGCUGCUGAGCCACCUGGGCCGCCGCCCCACGCUGGCCGCAUCCCUGUUGCUGGCAGGGCUCUGCAUUCUGGCCAACACGCUGGUGCCCCACGAAAUGGGGGCUCUGCGCUCAGCCUUGGCCGUGCUGGGGCUGGGCGGGGUGGGGGCUGCCUUCACCUGCAUCACCAUCUACAGCAGCGAGCUCUUCCCCACUGUGCUCAGGAUGACGGCAGUGGGCUUGGGCCAGAUGGCAGCCCGUGGAGGAGCCAUCCUGGGGCCUCUGGUCCGGCUGCUGGGUGUCCAUGGCCCCUGGCUGCCCUUGCUGGUGUAUGGGACGGUGCCAGUGCUGAGUGGCCUGGCCGCACUGCUUCUGCCCGAGACCCAGAGCUUGCCGCUGCCCGACACCAUCCAAGAUGUGCAGAACCAGGCAGUAAAGAAGGCAACACAUGGCACGCUGGGGAACUCUGUCCUAAAAUCCACACAGUUUUAGCCUCCUGGGGAACCUGCGAUGGGACGGUCAGAGGAAGAGACUUCUUCUGUUCUCUGGAGAAGGCAGGAGGAAAGCAAAGACCUCCAUUUCCAGAGGCCCAGAGGCUGCCCUCUGAGGUCCCCACUCUCCCCCAGGGCUGCCCCUCCAGGUGAGCCCUGCCCCUCUCACAGUCCAAGGGGCCCCCUUCAAUACUGAAGGGGAAAAGGACAGUUUGAUUGGCAGGAGGUGACCCAGUGCACCAUCACCCUGCCCUGCCCUCGUGGCUUCGGAGAGCAGAGGGGUCAGGCCCAGGGGAACGAGCUGGCCUUGCCAACCCUCUGCUUGACUCCGCACUGCCACUUGUCCCCCCACACCCGUCCACCUGCCCAGAGCUCAGAGCUAACCACCAUCCAUGGUCAAGACCUCUCCUAGCUCCACACAAGCAGUAGAGUCUCAGCUCCACAGCUUUACCCAGAAGCCCUGUAAGCCUGGCCCCUGGCCCCUCCCCAUGUCCCUCCAGGCCUCAGCCACCUGCCCGCCACAUCCUCUGCCUGCUGUCCCCUUCCCACCCUCAUCCCUGACCGACUCCACUUAACCCCCAAACCCAGCCCCCCUUCCAGGGGUCCAGGGCCAGCCUGAGAUGCCCGUGAAACUCCUACCCACAGUUACAGCCACAAGCCUGCCUCCUCCCACCCUGCCAGCCUAUGAGUUCCCAGAGGGUUGGGGCAGUCCCAUGACCCCAUGUCCCAGCUCCCCACACAGCGCUGGGCCAGAGAGGCAUUGGUGCGAGGGAUUGAAUAAAGAAACAAAUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1209.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1255.78

Frequency: 0.0000

Diversity: 608.64

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.................((((((((((....(((..(((((((...............)))))))..)))(((.((((((((((((((....((((((((.(((((..((.........((((....))))..(((((.(.(((.....))).).))))).(((....).))...))..))))))))))))))))...........(((((((.((((((((.....))))..((((((.......((((((((..(((((..(((((((.(((......)))..))).))))..((((((((.((((((.......)))))))))(.(((((...((((((((((((((...(((((((((((..(((.((.(((((..((((..(((((((((((.((...((((((..((((.((((...))))....).))))))))).)))))))))))))...))))((((((((((((.......))))))))).....(((.....)))...)))((((((((....((...((((((.((((((.((((...((..((.((((.(((....(.(((((((........((.....)).(((((((((..(((((...((((((.((..((((.(((((.((..(((((((((..(((((.((((((((((.((((((((((((.(.(((((((((((((.(((((...((......(((((..((((....))))....)))))...(((.((((((...))))))..))).)).)))))))))).))))))))))))))........((((((.(((((.....)))))))))))...((.((((..(((((.((((.(.((((.(((((..((..((.......))..))..)))))..)))).).)))).)))))..)))))).)))))).).))))....))).))).))))).....))))))))))).)))........)).))))...)).))).))).))))))))))))))))))))).)...))).)))).))..))..)))).)))))).))))))))...))))))))((((((((((((....((((.......))))....))))))))))))((((..((((((............(((.....))).....((((((.(((((((..(((....(((.......)))..((((((.(((.((((((((((.(((.((((.(((((((((...))))....((..(((((.(((((((((....(((........)))((((((..........))))))(((((((((...(((((((((....(((((.(((((((...(((...)))))))))).))).))....(((((.((((.........)))).)))))(((...)))............)).)))))))(((..(((..(((.((((((((...((((((...(((....((((((((.......))))))))...))).))))))(((((((....(((....))).....))).))))((((((.((((((((((.(((((((...)))))))...))).....(((.....(((.((.(((((........))))).)))))....)))..))))).))))))))(((((((((((((((((((((....(((((....(((((.((((.(((((((((..((((((((..(((...)))..))))))))(((((((.(((.(((((...((((((((....))))((((((..((((((((...)))))...))).))))))..(((((((.(((....))).))).)))).((((.(((....))))))))))).)))))))))))))))....))))))))).))))..............))))))))))....)))))).......((((....((((..(((((((..(((((((((((((((.......)))))))..(((((((((......((((((.....(((((((((...)))))))))..(((((((((.....(((((..........))))).)))))))))(((((((((....)))))).))).)))).))))))).(((((((((......))).))))))((((((...........))))))((((((((....))))))))...))))..........)))))..)))..)))))))..)))).....))))........(((((..((((((((((((((((.(((((.((.........))))))).))...)))))))))...)))))....))))).....))))))).)))))))).)))))))).))))))..)))...((((....))))......((((.((.(((.......))))).)))).)))))))))...(((((.....)))))))))))...))).)))))..))))))).)).)).))).))))))))))))))))))).))).....))))))).)))).))...................))))))..))))............))))).))))).....))))))))))).)))...)))))).))))).....))))).)...........))))))))))..))).))))).(((..(((......)))..))).((((((((((((((....)))....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..).)))).)))))))))................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.................((((((((({....(((..(((((((...............)))))))..)))(((.((((((((((((((....((((((((.(((((..((...{{,.{.((((,...))}}{.(((((.{.(((.....))).}.))})},|||...,},.,.,.)}..))))))))))))))))...........((((((,,(((({{(({{.{,|}}|,,{((((((..{{..((((((((..(((((..(({(({(,(((,.....}}}..))))}))}..{(((((((.((((((.......))))))))){.(((((,,.((((((((((((((...(((((((((((..(((.((.{((((..((({..(((((((((((.(,.,.((((((,.((({.((({...}})).,}.,.}}})))))),)))))))))))))...})}}({{(((((((((.......))))))))).,...{((.....}})..,))}((((((((....((...((((((.((((((.((((...((..((.((((.(((....{.(((((((........((.....}}.(((((((((..(((((..{(({,.{|||}.((((.(((((.({..(((((((((..(((((.((((((((((.((((((((((((.(.(((((((((((((,({(((...((,,{,..{((((..((((....))))....))))}....,{.((((({...}))))).,,}..)).)))))))))).)))))))))))))),,,..,{,((((((.(((((.....)))))))))))..,||.((((..(((((.((((.(.((((.(((((..((..((.......))..))..)))))..)))).).)))).)))))..))))}},)))))).).))))....)))}})).))))).....))))))))))).)))........)}.))))...|{{|.,..))}))))))))))))))))))))).,...))).)))).))..))..}))).)))))).))))))))...))))))))((((((((((({....((((,,.,...}})).,..))))))))))))((((..((((((............(((.....))).....((((({.(({({(({.(((,.({(((,......,,,..((((((.(((.((((((((((.(((.((((.((((((.(({{.{{......||..(((((.((({(((((....{{|{....,,{{||||||||...,}|{,.{{||||.((((((((({..(((((((((....(((((.(((((((...(((...)))))))))).))).))...,(((((.((({,.....,..)))).))))){((...)))............))},)))))){{{.,({{,.|||,((((((((...((((((...(((....((((((((.,....,))))))))...))).))))))(((((((.{.,(((....)))...,.)))},)))((((((.(({(((((((.(((((({...}))))))...))).....(((.....(((.((.(((((.,.....,))))).)})))....)))..))))).))))))))(((((((((((((((((((((....(((((....(((((.((((.(((((((((..((((((((..(({...}))..))))))))(((((({{(((.(((((...({({((((....))))((((((..((({((((...}})))...))).))))))..(((((((.(((....))).))).)))){((((.(((....))))))))))).)))))))))))))))....))))))))).))))...,.......,..))))))))))....)))))),...,..((((....((((..(((((((..((({((({{{,,{{{.......}}}}}}|,,,{{{(((({.,,{,.({.(((,{{{,(((((((((...))))))))}.,(((((((((.,,.,(({{{..........))))).)))))))))|{{{{{{||,,.,)))))),)))))))}.,.}}}}},(((((({{(,.....))}.))))))((((((...........))))))((((((((....))))))))...,))},,}}..,,,,)}}))},)))..)))))))..)))).....)))).},,,...(((((..((((((((((((((((.((({({((.........))))))).)),..}))))))))...)))))....))))).....))))))).)))))))).)))))))).)))))),})},.,,({{,....))))..,||,|{{{.{{.(((.......))))).))))|)))))))))...(((((.....))))))))))).,.))).)))))))))))))).)).)).))).))))))))))))))))))).))),...,,)))))).))),,,},....}}}}}.........))))))..))))............))))))),))).....))))))))))).)))...))))))))}))).,...))))).),,,......,,})),,)))))..))).)))))..}}...)))))),.})},,)}}.((((((((((((((....)))....)))))))))))},,.,.)))))))))))))))))))))..).))),.))))))))}................