Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_145296.2

Sequence Length

2189 nt

GC Content

0.6007

GGCGCGGGCGGUGCAGGUGCCGGGCCGGGAGCGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCACCAUGGGCCGGGCCCGGCGCUUCCAGUGGCCGCUGCUGCUGCUGUGGGCGGCCGCGGCGGGGCCAGGGGCAGGACAGGAAGUACAGACAGAGAACGUGACAGUGGCUGAGGGUGGGGUGGCUGAGAUCACCUGCCGUCUGCACCAGUAUGAUGGGUCCAUAGUUGUCAUCCAGAACCCAGCCCGGCAGACCCUCUUCUUCAAUGGCACCCGUGCCUUGAAGGAUGAGCGUUUCCAGCUUGAGGAGUUCUCCCCACGCCGGGUGCGGAUCCGGCUCUCAGAUGCCCGCCUGGAGGACGAGGGGGGCUAUUUCUGCCAGCUCUACACAGAAGACACCCACCACCAGAUUGCCACGCUCACGGUACUAGUGGCCCCAGAGAAUCCUGUGGUGGAGGUCCGGGAGCAGGCGGUAGAGGGCGGCGAGGUGGAGCUCAGCUGCCUCGUUCCGCGGUCCCGUCCGGCUGCCACCCUGCGCUGGUACCGGGACCGCAAGGAGCUGAAAGGAGUGAGCAGCAGCCAGGAAAAUGGCAAGGUCUGGAGCGUGGCAAGCACAGUACGGUUUCGUGUGGACCGUAAGGACGACGGUGGUAUCAUCAUCUGUGAGGCGCAGAACCAGGCGCUGCCCUCCGGACACAGCAAGCAGACGCAGUACGUGCUGGAUGUGCAGUACUCCCCCACGGCCCGGAUUCAUGCCUCCCAAGCUGUGGUGAGGGAGGGAGACACGCUGGUGUUGACGUGUGCUGUCACGGGGAACCCCAGGCCAAACCAGAUCCGCUGGAACCGCGGGAAUGAGUCUUUGCCGGAGAGGGCGGAGGCCGUGGGAGAGACGCUCACGCUGCCGGGUCUGGUAUCCGCGGAUAACGGCACCUACACUUGCGAGGCGUCCAAUAAGCACGGCCAUGCGAGGGCGCUCUACGUACUUGUGGUCUACGACCCUGGUGCGGUGGUAGAGGCUCAGACGUCGGUUCCCUAUGCCAUUGUGGGCGGCAUCCUGGCGCUGCUGGUGUUUCUGAUCAUAUGUGUGCUAGUGGGCAUGGUCUGGUGCUCGGUACGGCAGAAGGGUUCCUAUCUGACCCACGAAGCCAGUGGCUUGGAUGAACAGGGAGAAGCAAGAGAAGCCUUCCUCAAUGGCAGCGACGGACACAAGAGGAAAGAGGAAUUCUUCAUCUGACCCUAUCCCCACCCCAGGCCUAGGCCUGGGCCUGGGCUGGGGUCCCCCCCACUGCCAGCUGCAAGGAACCAGCAAAGACAUUUACCAGAGUCUGGGAUGGUGGGCUUCUCCCCCCACCACUAACACCUCAGACGCUUGGGCAGGGAUGGGGGUGUUGGAUGCCUGGAUCUCUGUAAGGGCCAGAAGUGAGGGCCCAGAGGUCUGGGUCCCCCAGGGGGCAGGGGCCAAAGGUCCAGACCCCCCAAGUCCAGUGAGGGCAGUAGGGAUUGGGUUGGGGGAAGAUAACUGGGGGAAGGCCAGGGCCCCUAGGCUACAAAACCAGGUCUUGUGGGGAGGGGGUCAGUUUCUGGGAAGGGUGGGGGGGGCAGGGAAGGGGAACACAGAUUUCUUUGGGGGUCCUAGACCCCAUGCCAGCCAUUGUAAGAGUUCCACAGAGCUCUGGGCACUUCUUUGCAAAGCCAUGUUUGCACGGUGGGGGGAUGGGUGGGGGGAGGGCGUGGAAAUAGGGAUUCUGUGUCUUUGUGUCAUAACUUUGAUGGGGGCAGUGAGGGAGACAGCCCCAACCCUUUUCUCCAAUCCCCCUUCCCCAGGUUCCUGGGCUCCCCUUCUCUCUACCUUCUCCCCCAACGUCUGUCCCAUCCAUAUUUGUCUCUCUGUCCACCCACUCCUGGGGGGGCCUUCCCCAUCUCUCCUCCAGGCCCCCCGGGGAGGGGGAAAGGAGUUUGGGGAGGAUUCGUGGUCUUCAUGGUUUUAUAUAUAAUAUAUUAAAAAAUCAAAAGUCUGUAUGAAAAUAUCAGAUUGCACCCCCCUCUCCCCAUUCCUGGCUUUUGCCCCCUUUUUCUUGUUAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAACCACACACACAUUUUGUACGGGGUGGGGAGGGGAAUGGGGAGGGGGUUUGGCAAUCUCACUAACCACCAUUAAACUGAGGAGAGAACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-978.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1012.69

Frequency: 0.0000

Diversity: 645.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((...((..((((.(((((((((((((...((.(((((((((((((((.((((.(((.((..((((...)))))).))).)).)).)))))))))))))))))...))))).))))...(((((((((((((......((((((((.............(((((((..(((((((.(((((((..(..((((((.((((((((.......(((((....(((((.((((.((..((((((((((((......((((((((.((((....))))))))))))((((((((((..(((((.((.(((((((....(((((((....)))))))........((((.(((.(....).))).))))...((((..(((((((........(((..(((((((..(((((((((.............))))).......))))..)))))))..)))..((((((((((((.(((..(.((...)).)..))).))))))).)))))(((((((((.(((((.((......)))))))...)))))))))..)))))))..))))((((.(((((((((......))))...((((((..((((.(...(((((((((((((.....))))))))........((((....))))..))))).).))).)..))))))((((((.(((((.(((.....((....)).....)))))))).).))))).((((((((((((..(((........)))...)))))))...)))))(..(((((....)))))..)...)))))))))))))))))))))))....((((.....))))..((((((.......((((((((......))))))))))))))..))))))))))..)))))))).))))..))...)))).)))))..(((((..((((((((((((.....(((......)))..)))))).)).))))..))))).....)))))))))))))))))))..))))))..(((.(((.....((((((((.(((.(((.((((.....((((....((((((.((((....(((((...((((((......)))))))))))(((((((((...))).)))).))..(.(((((...))))).))))).))))))..)))))).)).))).))).))))))))..))).)))....((((((.......))))))....(((((((.(((...(((((((....)))))))...))).))))))))))))))))..)))))))..(((((((...(((((...(((..((((((.((.(((((((........)))))))))....((((((((.((((((((((((((((((........((((((((((((....(((((.........)))))))))))))))))))))))(((((...(((((...)))))...)))))...((((.....))))....(((((.(((((((((((.((.....((((((((((((((((((((...((((((.((...)).))))))...)))))).....((((((.((((.((((..((.(((((((((..(((((((.(((((...(.(((((...((((((.(((.((..(((.(((((((....)))))))..)))((.((.((((((......)))))).)).))..)).)))))))))..))))).)......))))).)))))))......((((......)))).(((((.((.......)).)))))..)))))))))))..)))))))).))))))..))))).....))))))))).....))))))))))).)).))))).............))))))))).(((.(((((.(((((((((................))))))))).))))))))...))).)))))))).))))))))))))))..)))))))..........................)))))))).......))...)))).)))((((((((((((((((..(((((..((((......(((((....)))))..........((((((.............))))))..))))..)))))))))))))))))))))..)))).))))))))..)).)).....................

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((((,{{{{{{||,,|{((({(((((...((,{((((((((((((((.((((.(((.((..((((...)))))).))).)).)).)))))))))))))))))...))))).||||{{.((({(({((.,..{.,...||.,...,......(((.((((((((..((((,,,((({.(((((.,(..((((((.((((((((,......(((((....(((((.((((.((..((((((((((((.,....((((((((.((((....))))))))))))((((((((((,.(((((.((.(((((((,...(((((((....))))))).....,,.((((.(((.(....).))).)))).,,{(((((,.(({((.{{{{{{.((,..,,((((({.(,((((((((({{.{{{..{{.}||||{,{,.,,,,,}}}})))}}).,)}),,((((((((((({.{{({{(.((...,}.,..))).))))))).)))))(((((((((,(((((.((......))))))).,.)))))))))..}}}||||...,,,,},,,}||}.((((......)))).,}|||||)}}}|||||}}.|.(..((((((((.....))))))))..,.....||||}}...,)).})))))}}})))))},....,,{{({(||{(({{.(((.,,..((....}}.,,..))))))}}.),))})}.((((((((((((..(((........)))...)))))))...)))))(..(((((....)))))..),||}},}}})))))))))))))))))....((((.....))))..(((((|......{((((((((......))))))))))))))}.)))))))))).,)))))))).))))..))...)))).))))),,({(((..((((((((((((.....(((......)))..)))))).)).))))..)))))}....))))))))))))))))))).,)))))).)}})....))))..)))))))).,})))).})))))).)))))}|{|({((({.((({,{{,(((,({,(((({{(,{{{{{,||||}|,||.,{||(((((.{{|||.,||}.||{,(.(((((...))))).).}}..,,}}||,.}|,.}}.}},,))}))},}.,}}}})}}},)|}}}.,..(((((...,.(((((((((.{(.((((((.((((((((((({{(((((((....)))))))))))))}(((((((,(((((.((((........))))...........,{((.(((((((.(((((((........)))))))......,)|))))).}},})))))}}.,}))))....,,..((((((((((((,...(((((.........)))))))))))))))))|{{||,((((({..(((((...)))))...|||||{..((((.....))))....|||.,.||}||((((({((({....,((((((((((..{,(((((,{{||.,....,..{||.,,||||{.{{||||,{{{...,(((({,((({((((((((.(((((((((({.,.{(({...,}})}((((((...)))))).{,{{.,{|..,||.(((((((....))))))).}))},,.,,.((((((......)))))).||.((((((({,,,{((((((((((.{{,,..((((((((.....))))))))((((......)))),(((((.((.......)).))))).,)))))))))))}}))))))).}|((((....))))}.))))))))))),..}}},}))))))}.}.))),))))}.......})).)))))).))))},,,|||||}|||||}}|}}}}}}}}}}.}}}}}})}))))))}}))),}))))).))).))}.)}))))))))).}..))))).(((((((,((({...,}))}...)))))))...|{||||||,...,}},))|||{((.,..((((((((((((((((..(((({(((((...,{,.(((((....))))).,}}......{((({{.............))))))..)))))))))..))))))))))))))))...,)))}))))))),.}),)),}.....}}},,)}}}..,..