Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_145815.2
Sequence Length
2363 nt
GC Content
0.6335
AGGCCGGUGGCGGUGGCGGGCACAGCCGGACGCUUCGGAGGCAGCGCGGAGCUGGGGUCGGCGCGGGGCCGAGGCAGGAGAGCGAGAGGGGCCCCUGCUCGGGAGUCGGGGGUGGGAGCCCCGAGGGGGGGCCCUGGCCUGGGGCUGAGCCUGGCGCGAACCCGACCGGGAAGGCCCUGGGAGCCCGGGGGAGGGAGACGGACUGAUCCCGAAGGGGCGCAGCGUCUCUUGCGGGUCGCGGUUGGCCUUUGAACCCUGGGGGGACUCAGUCCUGGUUUUCCGAGCCGCAGUGCGGACCACAGCCCCAUAGUGUGAGCCCCAGGAGGGCCCCCGGUCCCAUCUGCCCCAGCCCUCGGGGAGGCCCCGUAGCCUCCCGCCUCUGGACUCCACUCUGUCUUCCGGCCACCGGCCCCUUUUCCAGGCUCAGUAGAGACCUCGGAUCUUUUCUGAAUGGCAGGGGAGACCCCUAUCCCCUUUUCCUGAAUUCCAGCGAGGCCCAGUCCUCUUCUGAGCCCCAGCCAGGGCUCUGUUCUUCUCCUUCUGUGGAUGCCGGGGUCCUACUGCCUCUCUUGAGACCCGGAUUGAAUUCCGACCUCCCCUUGGGAGCUUCCCGGGACCCCAGGUCUUCCUUUUCCGAAUCCCAGAGGGUCCCCAAGUCCUCUGUUCUCAAACUCUGAGCCCAAGGGAACCCCGGCCACAUCUCCUCCAAACACACACAGGACCUCAGGUCCCUUCCUGGGUACCCCAAACUCUUAGCCCUAGUGGGGUGCUCAGAUCUCUCAGGAAAACCAGUUUCCCUUUUGUUAACCCCCCAGCGGGGACCCCAAAGCAGCCCCUUGGAGCUGCAGGGAGCUUCAGCGGGCACCAGUUCUCAUUCCUCUGGAGCUCUUGGGGGGACUCCCUCCUGGGAAGCCGAAUUCUAUCUCUAAACCUCAGGGUGGGGGCCUUGUUUUUCCUCUGGGCCCCGUCUUCUUUGCCAAGUUCUUGAGGGCAACCUAGACCCUCCUCUGAACCCCAGAGGCUUCCCCAGCCCUGGGGAUCAUUUUUCUCUUCUGAACCCCAGAAGCAAUCUCGACUUUCGCAUUUGAGAUUCCAGACAGGACUCGGCUCUCCCUCUUUCAUACCCAGGGGAAACUGAGUCCCUCACCCCCUUCAAGACCCCAGGCCGCUCCUCGCUCCCGCCCCUCGAGGCCCUUCGCCGGCUCUGCCUCCUCCCCCUUCCCGACCCCACCGGCCAUAAGAUGAUGUGGUCCAACUUCUUCCUGCAAGAGGAGAACCGGCGGCGGGGGGCCGCGGGCCGGCGGCGGGCGCACGGGCAGGGCAGGUCGGGGCUGACGCCCGAGCGCGAGGGGAAGGUGAAGCUGGCGCUGCUGCUGGCCGCCGUGGGCGCCACGCUGGCGGUGCUGUCCGUGGGCACCGAGUUCUGGGUGGAGCUCAACACCUACAAGGCCAACGGCAGCGCCGUGUGCGAAGCGGCCCACCUGGGGCUGUGGAAGGCGUGCACCAAGCGGCUGUGGCAGGCGGACGUGCCCGUGGACAGGGACACCUGCGGCCCCGCGGAGCUGCCCGGAGAAGCAAACUGCACCUAUUUUAAAUUCUUCACCACGGGGGAGAAUGCACGCAUCUUUCAGAGAACCACAAAGAAAGGCCUGCUGCUCUUGGUGAGCCUGGAGGUGUUCCGGCAUUCCGUGAGGGCCCUGCUGCAGAGAGUCAGCCCGGAGCCUCCCCCGGCCCCACGCCUCACCUACGAGUACUCCUGGUCCCUGGGCUGCGGCGUGGGGGCCGGCCUGAUCCUGCUGUUGGGGGCCGGCUGCUUUCUGCUGCUCACACUGCCUUCCUGGCCCUGGGGGUCCCUCUGUCCCAAGCGGGGGCACCGGGCCACCUAGAGCCACGCGUGAGACUUCUCUAAGCAACCACCGAGCCCUUUGACCUUCUCCAUUGUACCCCCAAGAUCUUUUUGCCCCAUCUCCUAGAGAAACUGUGUUCUCCCUGCUCGGGGGCCCAUGUUUUUUUACACGCCUGCCUCCUGUCCCCUUAUCCUUUCUCCCUCUGUAAAUACGUUUUUCUCUGUGGCUGUAUGUGGGUUGCUUGGGGGUGGGAUGGGAAGAGGCUCUUUGCAAACGAGGGUCCCCAGAGAAGACUGGCGGGGACCUGAUGGGGUAGCUGGGGUGUGGGGUUGGGGGAUGAGGUCAGGGGGUCUUGGGUGGGAGUUGGGGGCCCCUUCAUUUCCCAGGUCUGGAUCGAUUCACUUGCCGGGAGAGACUUUUUACAACUCAUCUGCAGCUCCGGGUGCGGUUGGGGGAGAUAGCGAAGGGUCUGGCCUCGCUGUGAUCUGAUUUGGGAUUAAAGGUUUGGAAAUUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1115.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1149.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 624.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((..(((.(((((.((..(((.(.(((((((((..((.((.(((((((.(((...(((((((.((..(((((((....(((((((((.((((((..((........))..)))))).)))))))))..(((((((((...(((((((......)).)))))..)))))))))..(((((((...((((.(.(((((..((((((((((((...)))))))).))))...))))).).))))...)))))))(((((...))))).)))))))...((((...))))..((((.........)))).((((.....)))))).)))))))..)))))))))))).))(((((((......)))))))))))))))))))).)).))))).)))))))))))))...(((((((((((((.((((((....).))))).)))).....((((((........))))))..((((((((((((((((((((.((.((.((((.((((((......)))))).(((..(((((.((((.(((((((((((((((.....(((....)))...((((......))))..(((((...)))))......)))))))).))).............))))))))((((((((((.((((.....((((.....))))(((((((...((((((((.((((((((((..((((...(((.(((((((((((((..((((((((((((...............))))))))))))...((((((((.....(((((((((((((....((((.....))))....))))(((((((...)).))))).(((((((((((.(((.............))).))))))))))))))))))))...)))))))).((((...(((.(((((...((((.(((((((((.((((..(((((((((((.............(((.((((((.((((((......).)))))...(((.((((((.((((.....)))))))))).))).......((((((.....)))))).((((((((.........))))))))......)))))).)))...............))))))))))).)))).))))))))).(((((...((((..((.((((..((..((.((((((((.(((((.((((((((.((((..((((((((...(((........(((((((......)))))))....((((.(((.....))))))).))).)).))))))..)))))))))))).)))).).))))..)))).)).))((((....))))))))))..))))....)))))..((((((((((.(((((...(((((.((((...))))((((((.......))))))(((((((....)))))))....)))))..))))).))))))))))((.(((((((((((((.....)))))))((((((((((.....((((((.(((((((((((..((((((.......))).)))))))((((((((((((.((((.(((..........((((((.......(((((((.((...)))))))))(((.((..(((((.............))))))).))).((((.....))))....)))))))))))))))))))).))))))))))))((((((.(((((..(.((((((.(((((((((((((.((((((.(.(..(....)..)).)))).)).))))).))))))))...............))))))))))))))))))))))))..))).)))))))((((.(((((((.(((..((((((.....))))))..))))).))))).)))).((..(((....)))...)).......(((((.......((((.(((((.((((((((((........((((((((.((((((((((.((((((..(...((..((((((.(.(((......))).)...)))))).)).....................)..))))))..)))))))).))..).))).))))..)))))))))).))))))))).))))))))))).))))))......)))))))).))))))))))))))...)))..)))..))))..))..)))))))).)))).)))).))))))).)))).))))))))))..((.((((((.(((..(((.....)).)..)))))))))))..........((((.(((((.(....).))))).))))))))).))))))))).)))))))))))).))....))))))))......))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((((,,(({,(((({.{|,,{{{,|,|{(((((({..{(,((,({((((({(((,..{{{|||(,(((.(((({((....(((((((((.((((((.,({,,,,,,,,||.,}}}}}}.|||||||||..(((((((((...(((((((,,...,|}.}})))..))||||}|}..(((((((...((((,(.(((((..((({((((((({...)))))))).)))),,,))))).),))))...))))))){((((...))))},)))))))..|((((...})))..{{{,.,.,,...,)))},||||},,,,))))))}))))))),})}}))))})))).))||{{|||,,,...))))))})))))}})))))),)),))))),)))))))))))))...(((((((((((((.{(((((....).))))}.)))}..,,.((((({...,,,,.))))}|,.(((((((((((((((((((({((.((.((((.((((((......))))))........(((......))).((((((((........(((....)))...((((......))))..,,,(({{{|||,|{{{...((((((((.((..(((.......)))..)).).))))))).}})}.,,..,..((({.....})))}}))}))).))))))))...((((((((((..{.((({{.(((((...)))))....((((((((((((.............,,))))))))))))........(({...,{((((((((({.,{....,((({....))))..,,|,,.(((((((...}).))))).{{(((((((((.(({.............})).))))))))))}{(((((..{|||}}},||||{({{((.{{{{.{{{....,{{...{|||,(((((((.(.....,,.|,|||}}}}{{{{...{{(((.,,,,,..,,,|||},...})}),,,}...(((.((((((.((((.....)))))))))).))}.......((((((.....)))))).{(((((((.........))))))))..})).)))),)})))}.}}}}.........}}}))))))))}})})}))}}|||||,{{{{..,.((((,{({{((((,{(({.((.((((((((.,((((.((((((((.((((..((((((((,..(((........(((((((......)))))))....{(({{(((.....))))))}.))).)).))))))..)))))))))))).)))).}.}))),.)))).)}.}}{{||,...)))))}))))}}))))..))})),},,((((((((((.(((((...(((((.((({...})))((((((.......))))))(((((((....)))))))....)))))..))))).))))))))))))))),}...,|{(((((((((((((((((((((((((,.,,.,{{||{||{{(((((,(,.{,((((,..,}.}}}),.).)))))((((((((((((.(({({(((...,,.....||{{{{.......(((((((.((...))))))))){{{.((.,(((((.,..........,))}}}}}.}}).{{{(...,.))))..,.)))))))))))))))))))).))))),,||,||((((((.(((((,{(.{(({(({(((((((((((((.((((((.(.(..(....).,),.)))).)).))))))))))))))...............)))))))))))))))))))),)),..))).)))))))((((.(((((((,(({..((((((.....))))))..))))).))))).)))).((..(((....)))...))..((((((((((((((((((((,(((..,.,(((((({,.{{({{.{(((((((((,{{{,({(({.,.,,,}}}|{((({(({((((((((.(((((........(({{,(,(({({((((...{((({..,,(((.,.(((,.(((({....,..,,,)}....))),)}},,}}..))))).))))))))).))))).....,.))))).)))))))).}}}......,}})))))...))))))))))..))))},))))))}}}}))).)))))))))))).)))})))))((((((|||,...,.{{.((((((.(((..(((.....)).}..))))))))))}.......))))))....))))))))))))).)))))))))))))...)))))).)))))))))))).)}....))))))))..,..}))))))))).....
Back