Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_145862.2
Sequence Length
1775 nt
GC Content
0.4558
GCAGGUUUAGCGCCACUCUGCUGGCUGAGGCUGCGGAGAGUGUGCGGCUCCAGGUGGGCUCACGCGGUCGUGAUGUCUCGGGAGUCGGAUGUUGAGGCUCAGCAGUCUCAUGGCAGCAGUGCCUGUUCACAGCCCCAUGGCAGCGUUACCCAGUCCCAAGGCUCCUCCUCACAGUCCCAGGGCAUAUCCAGCUCCUCUACCAGCACGAUGCCAAACUCCAGCCAGUCCUCUCACUCCAGCUCUGGGACACUGAGCUCCUUAGAGACAGUGUCCACUCAGGAACUCUAUUCUAUUCCUGAGGACCAAGAACCUGAGGACCAAGAACCUGAGGAGCCUACCCCUGCCCCCUGGGCUCGAUUAUGGGCCCUUCAGGAUGGAUUUGCCAAUCUUGAAUGUGUGAAUGACAACUACUGGUUUGGGAGGGACAAAAGCUGUGAAUAUUGCUUUGAUGAACCACUGCUGAAAAGAACAGAUAAAUACCGAACAUACAGCAAGAAACACUUUCGGAUUUUCAGGGAAGUGGGUCCUAAAAACUCUUACAUUGCAUACAUAGAAGAUCACAGUGGCAAUGGAACCUUUGUAAAUACAGAGCUUGUAGGGAAAGGAAAACGCCGUCCUUUGAAUAACAAUUCUGAAAUUGCACUGUCACUAAGCAGAAAUAAAGUUUUUGUCUUUUUUGAUCUGACUGUAGAUGAUCAGUCAGUUUAUCCUAAGGCAUUAAGAGAUGAAUACAUCAUGUCAAAAACUCUUGGAAGUGGUGCCUGUGGAGAGGUAAAGCUGGCUUUCGAGAGGAAAACAUGUAAGAAAGUAGCCAUAAAGAUCAUCAGCAAAAGGAAGUUUGCUAUUGGUUCAGCAAGAGAGGCAGACCCAGCUCUCAAUGUUGAAACAGAAAUAGAAAUUUUGAAAAAGCUAAAUCAUCCUUGCAUCAUCAAGAUUAAAAACUUUUUUGAUGCAGAAGAUUAUUAUAUUGUUUUGGAAUUGAUGGAAGGGGGAGAGCUGUUUGACAAAGUGGUGGGGAAUAAACGCCUGAAAGAAGCUACCUGCAAGCUCUAUUUUUACCAGAUGCUCUUGGCUGUGCAGAUUACUGAUUUUGGGCACUCCAAGAUUUUGGGAGAGACCUCUCUCAUGAGAACCUUAUGUGGAACCCCCACCUACUUGGCGCCUGAAGUUCUUGUUUCUGUUGGGACUGCUGGGUAUAACCGUGCUGUGGACUGCUGGAGUUUAGGAGUUAUUCUUUUUAUCUGCCUUAGUGGGUAUCCACCUUUCUCUGAGCAUAGGACUCAAGUGUCACUGAAGGAUCAGAUCACCAGUGGAAAAUACAACUUCAUUCCUGAAGUCUGGGCAGAAGUCUCAGAGAAAGCUCUGGACCUUGUCAAGAAGUUGUUGGUAGUGGAUCCAAAGGCACGUUUUACGACAGAAGAAGCCUUAAGACACCCGUGGCUUCAGGAUGAAGACAUGAAGAGAAAGUUUCAAGAUCUUCUGUCUGAGGAAAAUGAAUCCACAGCUCUACCCCAGGUUCUAGCCCAGCCUUCUACUAGUCGAAAGCGGCCCCGUGAAGGGGAAGCCGAGGGUGCCGAGACCACAAAGCGCCCAGCUGUGUGUGCUGCUGUGUUGUGAACUCCGUGGUUUGAACACGAAAGAAAUGUACCUUCUUUCACUCUGUCAUCUUUCUUUUCUUUGAGUCUGUUUUUUUAUAGUUUGUAUUUUAAUUAUGGGAAUAAUUGCUUUUUCACAGUCACUGAUGUACAAUUAAAAACCUGAUGGAACCUGGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-555.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -586.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 401.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((...((((.....(((((.((((((((((...((((((.(((((((....(((((((((....))))).))))..))))))).))......)))).))))))))).).)))))))))..(((((((((...((((((((..(((.((((.....((((((((.((((.(((....))).........(((.(((((((((.(((.((((((((((((.(((((.(.(((((((((....((((((((..(((....))).)))))))).((((((((..........))))))))....((((((.(.(((.(((((..(((((((.(((((.....((((...)))).......))))).)))))))..((..(((((((((((..(((((((((((...........(((((((((..(((((((..........)))))..))..))..(((((..........................))))).....(((((((..........)))))))..)))))))........)))).)))))))..))))).....)))))).....))....((((...((((((((((((....(..((((((..((((((...((.((((((((((((....((((......))))........((..((((((...(((.(((((((........))))))).)))....))))))..))((.((((.....)))).)).....(((((((((((.((((((......)))))....).)))))))))))......................((((.((((.((.(((.((((((((((.(((((..(((((((.(((((..........)))))..))))))).....))))).((((((((....((............))....))))))))..))))))))))..))).)).)))).))))...)))))))))))).))...))))))..)).))))..).....((((.........))))............))))))))))))...))))(((((...((((((.(((.((((........)))).)))..)))))).)))))(((((....)))))(((((...)))))((((.....))))...)))))..))).).))))))(((((....))))).)))))).......)))..).))))))))))))))).)).)))............(((((....)))))(((((.....(((((...((((((......))).))).....)))))......))))).......((((((....))))))((.(((((..(((.(((((....)))))))).))))).))....))))))))).)))......(((.((((((.((((((.(((((.((..........(((((((((((..((((((.(((((......))))).).)))))..))))))).........)))).(((..(((...)))...)))..)).))))).)).)))))))))))))..)))).)))).))))..((((((............)))))).)))).))).)))))))))))))))))((((((((((......(((((((.......)))))))....(((((((............((((.....(((((((((((........))))))))))).....)))).............)))).))).....)))))..)))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((,,{.({,,,.{(((((.((((((((((.(((,,(((.(((((((..,.(((((((((....))))).))))}.))))))).)).......))).))))))))).).))))))})},.(((((((((..,((((((((,.{((.((((.....((((((((,((((.(((....))).......,.(((.(((((((((,{{{.((((((((((({,(((((.{.(((((((((....((((((((..(((....))).)))))))).((((((((..........)))))))).....{(..({,.((((.(((((((.(.(((.(((.....({.((({{{((((((.....,)))))){(((((((((.....)),,))))))},{(((.....}}}.|,,,{(.(((((((((((((((((((.......{(((({{(,({,.,,.,(((((..................,,......))))}.{{..(((((((.|,...}}..))))))),.)).............((((((.(((...,,...,,...))))))))).......(((((...(((((.(((({,..((((((........))))))...,.})))))))).,.))))).,})))..})))))......)))))))))))}...{((.(((((((........))))))).))}}}}}))).)}....((.((({.....)))).)).....(((((((((((.((((((......))))}..,,}.)))))))))))....,,,|,,......,|||{,.....,{(((..((((((......})))))..))}|{(((((.(((({,{.......})))))..)))))},.||{,{,,...,||||||....,|||.,,{{.{(,{({(((((,,((({,......,}|||,|}}}})))},))},.,},....})))))),.,))))).,)))))))},},|,,....,.{((((((((((.......((((((((..((..,.(((({{({|,,.,,,.....|||...,,,,|}}}.|)))).,..}}..))))))))...{{||,..,})))(((((....))))),{{||...|}},,,,}}...))))))).))))))).))).).))))))).)))).,,)),.},)))))).......)))..).))))))))))))))).)).}}}..........{{(((({..,,}}}}}(((((.....(((((.,.((((((......))).)))...,.)))))......))))).....,.((((((....)))))){|}|||||,.(((.(((((....)))))))).|}}}}.}},.}.))))))))).)))......(((.((((((.((((((.(((((.({...,......(((({((((({..((((((.{((((......,)))}.}.)))))..))))))}....,,...)))).{{{..{{{...)))...}))..}).))))).)).)))))))))))))..)))).)))).})))..((((((........|...)))))).)))).))).))))))))))))))))).,,((({{,,...},,(((((((.......)))))))....(((((((............((((..,{,(((((((((((........))))))))))).,,,.))))......,,.....)))).))).....,,,}}..,}}))))))).....
Back