Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_153276.3

Sequence Length

2127 nt

GC Content

0.6060

AGCAGACCCUGAAAGCUGAGCUGCCCUGACCCCCAAAGUGAGGAGAAGCUGCAAGGGAAAAGGGAGGGACAGAUCAGGGAGACCGGGGAAGAAGGAGGAGCAGCCAAGGAGGCUGCUGUCCCCCCACAGAGCAGCUCGGACUCAGCUCCCGGAGCAACCCAGCUGCGGAGGCAACGGCAGUGCUGCUCCUCCAGCGAAGGACAGCAGGCAGGCAGACAGACAGAGGUCCUGGGACUGGAAGGCCUCAGCCCCCAGCCACUGGGCUGGGCCUGGCCCAAUGGCCUUUAAUGACCUCCUGCAGCAGGUGGGGGGUGUCGGCCGCUUCCAGCAGAUCCAGGUCACCCUGGUGGUCCUCCCCCUGCUCCUGAUGGCUUCUCACAACACCCUGCAGAACUUCACUGCUGCCAUCCCUACCCACCACUGCCGCCCGCCUGCCGAUGCCAACCUCAGCAAGAACGGGGGGCUGGAGGUCUGGCUGCCCCGGGACAGGCAGGGGCAGCCUGAGUCCUGCCUCCGCUUCACCUCCCCGCAGUGGGGACUGCCCUUUCUCAAUGGCACAGAAGCCAAUGGCACAGGGGCCACAGAGCCCUGCACCGAUGGCUGGAUCUAUGACAACAGCACCUUCCCAUCUACCAUCGUGACUGAGUGGGACCUUGUGUGCUCUCACAGGGCCCUACGCCAGCUGGCCCAGUCCUUGUACAUGGUGGGGGUGCUGCUCGGAGCCAUGGUGUUCGGCUACCUUGCAGACAGGCUAGGCCGCCGGAAGGUACUCAUCUUGAACUACCUGCAGACAGCUGUGUCAGGGACCUGCGCAGCCUUCGCACCCAACUUCCCCAUCUACUGCGCCUUCCGGCUCCUCUCGGGCAUGGCUCUGGCUGGCAUCUCCCUCAACUGCAUGACACUGAAUGUGGAGUGGAUGCCCAUUCACACACGGGCCUGCGUGGGCACCUUGAUUGGCUAUGUCUACAGCCUGGGCCAGUUCCUCCUGGCUGGUGUGGCCUACGCUGUGCCCCACUGGCGCCACCUGCAGCUACUGGUCUCUGCGCCUUUUUUUGCCUUCUUCAUCUACUCCUGGUUCUUCAUUGAGUCGGCCCGCUGGCACUCCUCCUCCGGGAGGCUGGACCUCACCCUGAGGGCCCUGCAGAGAGUCGCCCGGAUCAAUGGGAAGCGGGAAGAAGGAGCCAAAUUGAGUAUGGAGGUACUCCGGGCCAGUCUGCAGAAGGAGCUGACCAUGGGCAAAGGCCAGGCAUCGGCCAUGGAGCUGCUGCGCUGCCCCACCCUCCGCCACCUCUUCCUCUGCCUCUCCAUGCUGUGGUUUGCCACUAGCUUUGCAUACUAUGGGCUGGUCAUGGACCUGCAGGGCUUUGGAGUCAGCAUCUACCUAAUCCAGGUGAUCUUUGGUGCUGUGGACCUGCCUGCCAAGCUUGUGGGCUUCCUUGUCAUCAACUCCCUGGGUCGCCGGCCUGCCCAGAUGGCUGCACUGCUGCUGGCAGGCAUCUGCAUCCUGCUCAAUGGGGUGAUACCCCAGGACCAGUCCAUUGUCCGAACCUCUCUUGCUGUGCUGGGGAAGGGUUGUCUGGCUGCCUCCUUCAACUGCAUCUUCCUGUAUACUGGGGAACUGUAUCCCACAAUGAUCCGGCAGACAGGCAUGGGAAUGGGCAGCACCAUGGCCCGAGUGGGCAGCAUCGUGAGCCCACUGGUGAGCAUGACUGCCGAGCUCUACCCCUCCAUGCCUCUCUUCAUCUACGGUGCUGUUCCUGUGGCCGCCAGCGCUGUCACUGUCCUCCUGCCAGAGACCCUGGGCCAGCCACUGCCAGACACGGUGCAGGACCUGGAGAGCAGGAAAGGGAAACAGACGCGACAGCAACAAGAGCACCAGAAGUAUAUGGUCCCACUGCAGGCCUCAGCACAAGAGAAGAAUGGACUCUGAGGACUGAGAAGGGGCCUUACAGAACCCUAAAGGGAGGGAAGGUCCUACAGGUCUCCGGCCACCCACACAAGGAGGAGGAAGAGGAAAUGGUGACCCAAGUGUGGGGGUUGUGGUUCAGGAAAGCAUCUUCCCAGGGGUCCACCUCCCUUUAUAAACCCCACCAGAACCACAUCAUUAAAAGGUUUGACUGCGCACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-898.9 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -929.8

Frequency: 0.0000

Diversity: 543.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.((((((...(((..((.((((...(((...(((........)))....)))...)))).))..))).))))))((((((((((....(((((((((((.......((((((((..((((.....((((((.((.....((((...))))..)).)))))))).))..))))))))))))))))))).((..(((...((((((((((.(.(.(.(((.(((...((((.(((.(((((.((((((.........)))))))))))((((....))))........((.((((...)))).))(((((((.(((((.....(((((....(((((((....)))).)))....))))).....))))).......)))))))((((.......))))..))))))).....))).)))).).).)))))))..)))...)))..))..(((..((((((.(((..((.(((((((((.(......).))))))))).)).))).))))))..)))...)))))((((((((((...((((...(((.((((......)))).)))...))))(((((((((((.(((.((((((((((((((((((.(..((((((((((((((.(((....(.(((((.(((((.(((((((......))))))).)))))(((....))).))))))..))).)))).))))))))))....)...))))).)))))))))(((.((......)).)))..((((((((((.(.......(((.....(((.((..((((((.(((....)))))))))..)))))......)))..........).)))))))))).....))))))).)))))))..))))...)))))..)))))...........((((((((((....)))))).))))(((((....(((((((((......))...))))))).)))))(((((((..(((((((((((((((((((......(((((....(((.((..((((((..((((((((......(((..((((.(((((((......(((((.((((.((((((.((((...((.(((.(((((((....))))((.((.(((((...)))))..)).)).))).))))))))).)))))))))).))))).))))))).))))..)))...((((...))))))))))))))))))..)).)))......))))).)))))..)))))))))).))))..)))).))).((((((.((.((((((((((((((((.(((......(((((((....)))).)))...........((((.(((((..((((((((((..((((((((((......(((((.....))))).(((((.((((((.((.(((((..((((.((((.((((((..(((((.......(((((((....)).(((((((.((.((((......))))))))))))).......((((((((..((((((...)))))).......((((..((((..(((..(((.((.(((((((...((((((.((((((((((....(((..((((......))))...((((((......)))).)).)))...))))).((((...((((..(((((((.(..(((((..((.((((((((((((((((.....(((((((.((.....)).)))).))).......)).........)).))))))))))))))..)))))...).)))))).)..)))))))))))))))))))...)))).))).)).)))...)))...)))).)))))))))))).))))).......((....)).)))))))).))).))))...))))......))))))).)))))).)))))......)))))))))).)))....(((((((..(....(((....)))..)..))))))).)))))))..)))))))))....))).)))))))))))...))))).....)).))))))(.((((((((.((((......))))..(((((................)))))....)))))))).).......)))))..))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((.((((((...(((..((.((((..,(({...(((........)))....)))...)))).))..))).)))))){(((((((({.,..(((((((((((,.....,{(((((({,,({({.....((((((.((.....((((...)))}..,),)))))))).))..}))))))}))))))))))).{{..{((...((((((((((.(.{.{.{((,(((,.{(((,,(((,(((((.((((((,,,{....,)))))))))))||||,,..)))),,......{{,{{{({,,||||,||(((({{{.{((({,,,,.||{{{..|{(((.,,,))))),|},)},,},})))))...|,||}}}.......,}}}}}}((((.......)))).}))}))},.....}}}.)))}||.,.)))}|||..|||,..}}|..}}..(((..((((((.(((..((.(((((((((.{......).))))))))).)).))).))))))..)))...|||||({{{{|||||..,((((...{((.((((......)))).})}.,.})))((({(((((((.(((.((((((({((((({{{{(.,..((((((((((((((.(({,|..{.(((((.(((((.(((((((......))))))).)))))(((....))).)))))}.|))).}))).))))))))))...,|,|,|}}|}.}}}}}||}}(((.({.....,)}.}))..((((((((((.,,,,...,||......(((.((..((((((.(((....)))))))))..)))))......,,,..........}.)))))))))).,,..})))))).))))))),,}))),,,)))}}},,})))..,........((((((((((....)))))).)))}{{((({{,,(((((((((......))...))))))),)))})||||{{{..({{{{{(((((({{{(({{...,,,{{|{{...|(((.((..((((((..((((((((....,,{((..((((.(((((((.,....(((((.((({{((((((.{(((...((.(((.(((((((....))))((.((.(((({...})))).,)}.)).))).))))))))}.)))))))))).))))),))))))).))))..}}},..{|||},.)))}))))))))))))))..)).)))}.....))))).})))),,)))))))))}.)))),,)))),))),((((((,({.,{.((((..(((((((.(((((((.,({(((((...,||}}.|||...........{(({.((({{..((((((((((..((((((((((....({(((((.....))))}.(((({.((((((.((.(((((..((((.((((.((((((..(((((.......(((((((....}}.((((({{{((.((((......))))))))))))).......((((((((..((((((...)))))).......((((..((((..(((,.(((.((.(((((((...((((((.((((((((((....{{,..((((......}))}...{{((((......}))).}}.})}...)))}|,,((({{,((({..(((((({.,..{({{(,.((,(((({(({{{{{{,||,,,,,(({((((,((.....)}.}})).}}}..,}))))))),,},......||))}))|}}}}}}..))}}}..,).)))))).}..}}}},,,))))))))))))...))))}})).)).))).,.)))...)))).)))})))))))).))))).......((....)).)))))))).))).))))...))))......))))))).)))))).})))).,,...)))))))))).)))....((((((({.{....(((....))}..),)))))))).)))))))..)))))}))),,,,.)))}}))).)))))))..)))).,...}).)))))){.((((((((.((((......))))..(((({................}))))....)))))))).}.......)))))..))))......