Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_172245.4
Sequence Length
1815 nt
GC Content
0.4915
ACUCAGAAGCGGGAGUCUCCGAGAGAAGAAAAGCAGGUGGAAGGAGAGGAAGCGGAUGCCGUGGGGUUUACAGCAGGAAAAUCCGUGGAGACAGCAGAUCCGAGAAGCGGCGAUGUUUGCGUAGAACCCUCUCUUCCCUUCUCUCUGACCAGCACCAUGCUUCUCCUGGUGACAAGCCUUCUGCUCUGUGAGUUACCACACCCAGCAUUCCUCCUGAUCCCAGAGAAAUCGGAUCUGCGAACAGUGGCACCAGCCUCUAGUCUCAAUGUGAGGUUUGACUCCAGGACGAUGAAUUUAAGCUGGGACUGCCAAGAAAACACAACCUUCAGCAAGUGUUUCUUAACUGACAAGAAGAACAGAGUCGUGGAACCCAGGCUCAGUAACAACGAAUGUUCGUGCACAUUUCGUGAAAUUUGUCUGCAUGAAGGAGUCACAUUUGAGGUUCACGUGAAUACUAGUCAAAGAGGAUUUCAACAGAAACUGCUUUAUCCAAAUUCAGGAAGGGAGGGUACCGCUGCUCAGAAUUUCUCCUGUUUCAUCUACAAUGCGGAUUUAAUGAACUGUACCUGGGCGAGGGGUCCGACGGCCCCCCGUGACGUCCAGUAUUUUUUGUACAUACGAAACUCAAAGAGAAGGAGGGAGAUCCGGUGUCCUUAUUACAUACAAGACUCAGGAACCCAUGUGGGAUGUCACCUGGAUAACCUGUCAGGAUUAACGUCUCGCAAUUACUUUCUGGUUAACGGAACCAGCCGAGAAAUUGGCAUCCAAUUCUUUGAUUCACUUUUGGACACAAAGAAAAUAGAACGAUUCAACCCUCCCAGCAAUGUCACCGUACGUUGCAACACGACGCACUGCCUCGUACGGUGGAAACAGCCCAGGACCUAUCAGAAGCUGUCGUACCUGGACUUUCAGUACCAGCUGGACGUCCACAGAAAGAAUACCCAGCCUGGCACGGAAAACCUACUGAUUAAUGUUUCUGGUGAUUUGGAAAAUAGAUACAACUUUCCAAGCUCUGAGCCCAGAGCAAAACACAGUGUGAAGAUCAGAGCUGCAGACGUCCGCAUCUUGAAUUGGAGCUCCUGGAGUGAAGCCAUUGAAUUUGGUUCUGACGACGGGAACCUCGGCUCUGUGUACAUUUAUGUGCUCCUAAUCGUGGGAACCCUUGUCUGUGGCAUCGUCCUCGGCUUCCUCUUUAAAAGGUUCCUUAGGAUACAGCGGCUGUUCCCGCCAGUUCCACAGAUCAAAGACAAACUGAAUGAUAACCAUGAGGUGGAAGACGAGAUCAUCUGGGAGGAAUUCACCCCAGAGGAAGGGAAAGGCUACCGCGAAGAGGUCUUGACCGUGAAGGAAAUUACCUGAGACCCAGAGGGUGUAGGAAUGGCAUGGACAUCUCCGCCUCCGCGACACGGGGGAACUGUUUUCUUGAUGAUGCUGUGAACCUUUAUAUCAUUUUCUAUGUUUUUAUUUAAAAACAUGACAUUUGGGGCCAGGCGCGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCAGGCGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGCCCAACAUGGUGAAACCCCAUCUGGACUAAAAAUGCAGAAAUUUACCCAGGCACGGCGGCGGACGCCCAUCAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAACCCGUGAGGCGGAGGUUGUAGUGAGCCAAGAUCGCACCAUUGCACACCAACCUGCGUGACAGAGCAAGAUUGCAUCUCAAAACAAACAAUAAUAAUAAAUAAUAAAAACCUGAUAUUUGGCUGGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-571.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -606.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 427.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((((((.(((.((((((.......(.(((..((((((.(((.(((......(((((((...(((((.....(((((((.........))).....)))).....)))))...)))))))....))))))))))))..))).)......)))))).))).))).....))))))).).))))).......((((((.((((((.((.(((((((((..(((((((((.((((.((((...(((((.((.((((...((.(((......))))))))).........((((((((((((((((((((.(((............))))))))).((.((((((....(((((((((.((....(((((..(((....((((((((......))).)))))...))).)))))..(((((.(((..(..(((((((((...(((.......)))....)))))))))..)..))).)))))(((((.(((((((.((((.(.....((.((((.((.((((.(((((...........(((((.((....)).)))))(((((((..((((((....)))))).((((..((.(((......))).)).))))...(((...)))..((((((.((((.(((.((((.................)))))))..((((((((((..(((((........)))))....)))))))))).........(((((.....)))))(((((....)))))......(((((((.((((....))))..)))))))........))))...))))))........((((((((((..(((...........)))..)))))))))).....)))))))...((((((((((.........(((..((((.((.((((((((...((........))....)))).)))).)).))))..))).........))))))))))..(((((((...........)))))))((((((....)))))).....)))).).)))).)).)))).))...).))).).))))))))))))..(((((..((.((((((.......))))).).))..))))).)).)))))))))(((((....)))))(((((....)))))...)))))).))))))..)))).))))))...........(..(((...)))..))).)))))...))))..))))..))))))........(((..(((.....)))..)))......)))..)).)))))))((......)).))))))))((..((((((..........))))))..))((((......))))(((..((.(((..(((((.(.(((((...(((....)))((((((((..((((((..(((.(((((((((..((((.(((((....))))).))))...(((((((((....))))))))).......((((.((((..(((((.((.(((((((..((((((....)))))).......))))))))))))))...((((..(....)..)))).))))))))....(((.(....))))((((...........))))......(((((.(..((((.....)))).....((((((....))))))).))).))))))))))).).))...))))))..))))))))....((((.......)))).))))).))))))...))).))..))).(((....)))......................((((((.((......)).)))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((((((((((.(((.((((({....{,,(,(((..((((((((((.(((.,..,.(((((((((.(((((.....(((((((.........))).....)))).....)))))))}))})))},.,.))))))))))))..))}.).,}.,,)))))).))).)),....}))))))).).))))).......((((((.{(((({,{(.((((((({{..(({((((((.((((.((((,..(((((.{{.(({{,..((.{((,,,...|||||||||..,,{,...(((((((((({(((((((((((((............))))))))}.{(.((((((....(((((((((.((....(((((..,{{....((((((((......)))}}}))),..,,,.))))).,(((((.(((..{..(((((((((.,.(((.......)))..,.)))))))))..}..))).)))))|(({{{(((((((.((((.(,{.{.((.((((.((.((((.(((((.,.........{((((.{{....)).))))}((((((({.((((((....)))))).|{{..|{{.||{,,,...||}|}}..))),,,|{{...}}}..((((((.{{((,(({,((({............}},..}))}}}}..((((((((((..(((((........)))))....))))))))))......|||{(|||..,}})},,.(((((....)))))..,...{((((((.,((.....,)))..))))))}........}}})...)))))),.....,,((((((((((..(((...........)))..)))))))))}.....)))))))...{(((((((((.|{,{{...,((..((((.((.((((((((...((........)}....)))),,))).)).)))}.})}},.}},....))))))))))..(((((((...........)))))))((((((....)))))).....)))).).)))).)).)))).)).}}).))).).))))))))))),..{((((..((.({((((.......))))}.}.))..))))).)).)))))))))(((((....)))))(((({....)))))...)))))).)))))}..)))).))))}|{,.,,{,,...(|,({{...))}..},|,|})))...))))..)))),.}))}}}........{{{..{{{....,)})..))},,....)))..}}.}|||||}{(......,)}))))))),((..((((((.,......}.))))))..)){{{{.,,...}}}){{(..((.(((.,(((((.(.(((((...(({....}))((((((((..((((((.,{,,.{(((((((({.((((.(((({....})))).)))}.,,(((((((((....))))))))).....,,(((,{((((..(((((.((.(((((((..((((({....}))))).......))))))))))))))...((((..{....)..)))).))))))))...,|{(,{....,}}}|(((,........|.}}},..,,,.,||||,{..((((.....)))),,.,.((((({....,)))))},})).}}))))))))).}.}}...))))))..)))))))).,..((({.,.....}})).))))).))))))...))).))..)}},(((....))).,,,..................,,,,,,.,.......},.)}))}})))))).
Back