Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_175931.3
Sequence Length
4185 nt
GC Content
0.6103
GUGAGACUCUCGGGCGAGCGCGCGGCGUUGGAGCCACAGGCGCGGCGGCUGGACCCGGCGCGGGCCGCGGAGGCCGGAGACCGCCCCGGGCGGGGUGCGCGCUUUGUUCCCGCGCGGGGUGGCCGGAGCCGAGUCCCCGGCAUGGCCCAGGCGGCCGCCCCGCGCGCCCCAGCCCCGCCGCGCGCCUGAGCCCGGUGCGGCGCCAGAAGACAGCGCGCAGCCGCCCCUGAGUCGUGGAGGCGGGGACCAAGCUGGAAGGAGCAGCGACUCCCGGACCGAGUCGCGAGUGUGCGCCGUCCGCCGCCCGCCGGAUCCCCCGGACCCCCCGACCCCCCAGUGGACAGGAAAGCUAAGGCCUCAGCGAUGCCGGACUCCCCAGCGGAGGUGAAGACGCAGCCCCGGUCCACACCCCCCAGCAUGCCGCCCCCACCGCCUGCCGCAUCCCAGGGGGCCACACGCCCCCCCUCCUUCACGCCACACACACUGAUGAACGGCAGCAGCCACUCACCAACAGCCAUCAAUGGUGCACCGUGCACACCCAACGGCUUCAGCAAUGGCCCGGCCACCUCGUCCACAGCCUCCUUGUCCACACAGCACCUGCCCCCAGCCUGCGGGGCCCGGCAGCUCAGCAAGCUCAAGCGCUUCCUCACCACACUGCAGCAGUUUGGCAGCGACAUCUCCCCAGAGAUUGGGGAGCGCGUGCGCACACUGGUGCUGGGCCUGGUGAACUCGACAUUGACGAUCGAGGAGUUUCAUUCCAAGCUUCAGGAGGCCACCAACUUCCCUCUGCGGCCGUUUGUCAUUCCCUUCCUGAAGGCAAACCUGCCCUUGCUGCAGCGGGAGCUCCUGCACUGUGCACGCCUGGCCAAGCAGACGCCCGCCCAGUACUUGGCCCAGCAUGAGCAGCUCCUGCUGGACGCCAGCGCCUCCUCCCCCAUCGACUCCUCAGAGCUGCUACUGGAAGUCAACGAGAACGGCAAGAGGAGGACGCCCGACAGGACCAAAGAGAACGGGUCAGACCGCGACCCGCUGCACCCCGAGCACCUCAGCAAACGGCCAUGCACCCUGAACCCUGCCCAGCGCUACAGCCCCAGCAACGGGCCACCGCAGCCCACACCGCCGCCGCACUACCGCCUGGAGGACAUAGCCAUGGCCCACCACUUCCGAGAUGCCUACCGCCACCCAGACCCCCGGGAGCUACGAGAGCGCCAUCGGCCGCUUGUGGUGCCUGGGUCCCGGCAGGAAGAAGUGAUCGACCACAAGCUCACAGAGCGUGAGUGGGCAGAAGAGUGGAAGCACCUCAACAACCUCCUGAACUGCAUCAUGGACAUGGUGGAGAAGACGCGGCGCUCGCUCACGGUGCUGCGCAGGUGCCAGGAGGCCGACCGCGAGGAGCUCAACCACUGGGCGCGGCGCUACAGCGACGCCGAGGACACAAAGAAGGGCCCCGCUCCCGCCGCGGCCCGGCCCCGCAGCAGCUCCGCCGGUCCCGAAGGGCCUCAGCUAGACGUGCCUCGCGAGUUCCUGCCGAGGACCCUCACCGGCUACGUGCCUGAGGACAUCUGGAGGAAGGCUGAAGAGGCCGUGAAUGAGGUGAAGCGGCAGGCCAUGUCGGAGCUGCAGAAAGCCGUGUCGGACGCGGAGCGCAAAGCGCACGAGCUCAUCACCACGGAGCGUGCCAAGAUGGAGCGGGCCCUGGCCGAGGCGAAGCGGCAGGCCUCCGAGGACGCCCUGACGGUCAUCAACCAGCAGGAGGACUCCAGCGAGAGCUGCUGGAACUGCGGGCGGAAAGCCAGUGAGACGUGCAGCGGCUGCAACGCGGCACGCUACUGCGGGUCCUUCUGCCAGCAUCGGGACUGGGAGAAGCAUCACCACGUGUGUGGCCAGAGCCUGCAGGGCCCCACAGCCGUGGUGGCCGACCCGGUGCCUGGACCGCCCGAAGCCGCCCACAGCCUGGGCCCCUCCCUGCCUGUGGGUGCUGCCAGCCCCAGCGAAGCCGGCUCUGCGGGGCCUUCUCGCCCCGGCUCCCCCAGCCCACCUGGCCCACUGGACACCGUGCCCCGCUGACCCCACUGGCCCCUGGCCUGCCGGACACAGCACCGUGCCAACCCCACCCAGCUCCAGGCCCACCGGAUGCUGUGCCUGGCCUCCGAUGCCUGGCCUGCCAGACACUGCGCCCCGCCUGACCUGGGGGAGCCGACCAAUUAGUCACUGCUGCUACUGCCCCUCUCCGAAAGAAGACACAGAACCAACAAAACCGCAUUCAGUGCACCUGCCUCAGCUACCUAAUGAUUCCGCGCGGAGACCUCCUGACAACGUCUCUUCAAGCAUCCUCAGAAGCCUCGACUGAGCUUUAGACAGCAGAGCAGAUGCCGCAGGCGCGGCGGCUCUGCCCACCUCUCUUUUCCUCUCUGUCUGUCUCUCCCCCUCUGUCUUCUCUAUCCUCUCUCUCUCUAUGACUAUCACACACUUUCUCUUCAAUGAAAAAAUCGAAUUGGUGGCUUAUAUUUUCAGCAAAGAAUUUUGGGGGGUUUUGUGUGUUGGCAAAAGAGCUACUCAGAAAUGGACAAAGAAAACGGGGGGGUUCUCCCCCUCCUGAUUAAAAAGGGAGAAAGAAAACUGCGAUUUUAUAGCUGGAGAUCUGAACCCAGCUGUGCCCCUCCCCCAGGGGCGUGAGGCUGAUCAGCGAAGACGGGAGGAAAGAUUUCGAUUUCUGACUCAAGAUGCAUUUUUGGUUUCAGAUUUUUUUUUCCUGUAAUGUUAAACUCUUUGGCUUUAAGUAAAAAUCCAAAAAGUUUUUUUAAAAAAGCAAAGGAAGCAUACUUGUGAACUACCUUGCUAGCUAGCCAGCCAAGGAUACCGGACACACCUCUGCUCCAAAGGAAAUCCAAAAAAGCAAACACAAGAAAUCAAAAUCCAAAAUUUGUUUGUCACUGCCAAAGUAUUUUUUUCACUGUUUCACUUGCUCUUGGGUUUGUUUGGAUGUGGGUCUUUUUCUCUUCUGUUCUGAUUUUGUUUGUGGGUGUCGGGAUAUUUGGGUGCAGAGGGUUUGUGCCCAGUUAGAAGCGACUUUUGUUCUCUUCUGCGUAGGCGUUGGUGCGUCCGCCGCGUGUGCGUGGUCCGUGUGCCGUUGCUCCGGCCUGCGUCUCCAUAUGUGUAGGAAAGGACACGCCGUCUGUCCUCACGCCCCCUGUGACUUUUCAUAUUUCCGUUUUCCACUUGUGGAAAAAAAGUGCUAAAGUUUUCUUCCCAGAGAGAGCAUAAUUCCGAAACAAAACUGUGACAAUCUUUUGGGUUGAUUCUCGACUGCUUUUCGAGCAUGCGGAGCCAGCAGGCCUCCCUGAAACACUGCUUCUCGGCCAGCCCGUCCUCCUCUACCUCUCUCCUCUCCGCGCCCUCCGACCUCUCUCGGCCCCCUCACCCCAGCUCCGACCUCUCUCAGCCCCAUCGCCCCAACUCCAACCUCUCGGCCCCAUCGCCCCACCGCAGCUACUCCCCUUUCUUCCAAACUUUUGCAGAAAAAACAAAAAAACUACAAACAAAAGCAGCCCUCUGCCUCCUCCCCAGGGAAGACCCUGACCGUGUACAUAGCCCUGGUGCUCCUGCCCAGCCACCCCUCAGAUGCGUUCGCCUCUGGCCCUGGGGUGUGUCUCGGUGACGUUUUCUAUCAGACGUGCUCCCUCCCAUCCUCCAGCCCUGCCCACCCUCCCUCCACUCCUCUCAACUGCCUCAGCGAUUUCAAGAAGGAAAUAAAGGGAUAAAGAAAUUCAUGCUUGCACCGAGUACAAGGACAGACAGCAGGCACGGCCCGCAGCCUGGCAUCUGUGCGUGUGGCGUGGCCCGUGGCUUGGCAUCUGUGUGCGUGGUGUGGCCCGUGGCCUGGCAUCUGUGUGCGUGGCGUGGCCCGUGGCCUGGCAUCUGUGUGUGUGGCGUGGCCCGUGGCCUGGCAUCUGUGCGCGUGGCGUGGCCCGUGGCCUGGCAUCUGUGUGCGUGGCUAUCAGGAGUUCUAGGAACUCAGUGCAAUACGGGAGUGACCCAGCUACUGAACCAGCCACGAACAGCCCGCCAGAGGCCUGAAGCUGAGCGUGUACGUUAAUGUGAAUGUAUAUAGUCUUUGCAGAGGUCCAAAUGAUAUUCAUGAUGGUAAUAAACGAGAUGUUUGCCAAAUAAAAAACAGAAACCGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1626.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1698.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 961.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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