Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_176875.4

Sequence Length

2019 nt

GC Content

0.5924

AGCCUGAGCCGGAAUCGCAGCGUGAGCAGGUGGAGCCGCGUUGGGAGCCCGCCGGGUCGAGCUGAGUAAGGCGGCGGGCUCGGCGGGGGCCAUGGAGCUGCUAAAGCUGAACCGGAGCGUGCAGGGAACCGGACCCGGGCCGGGGGCUUCCCUGUGCCGCCCGGGGGCGCCUCUCCUCAACAGCAGCAGUGUGGGCAACCUCAGCUGCGAGCCCCCUCGCAUUCGCGGAGCCGGGACACGAGAAUUGGAGCUGGCCAUUAGAAUCACUCUUUACGCAGUGAUCUUCCUGAUGAGCGUUGGAGGAAAUAUGCUCAUCAUCGUGGUCCUGGGACUGAGCCGCCGCCUGAGGACUGUCACCAAUGCCUUCCUCCUCUCACUGGCAGUCAGCGACCUCCUGCUGGCUGUGGCUUGCAUGCCCUUCACCCUCCUGCCCAAUCUCAUGGGCACAUUCAUCUUUGGCACCGUCAUCUGCAAGGCGGUUUCCUACCUCAUGGGGGUGUCUGUGAGUGUGUCCACGCUAAGCCUCGUGGCCAUCGCACUGGAGCGGUACAGCGCCAUCUGCCGACCACUGCAGGCACGAGUGUGGCAGACGCGCUCCCACGCGGCUCGCGUGAUUGUAGCCACGUGGCUGCUGUCCGGACUACUCAUGGUGCCCUACCCCGUGUACACUGUCGUGCAACCAGUGGGGCCUCGUGUGCUGCAGUGCGUGCAUCGCUGGCCCAGUGCGCGGGUCCGCCAGACCUGGUCCGUACUGCUGCUUCUGCUCUUGUUCUUCAUCCCGGGUGUGGUUAUGGCCGUGGCCUACGGGCUUAUCUCUCGCGAGCUCUACUUAGGGCUUCGCUUUGACGGCGACAGUGACAGCGACAGCCAAAGCAGGGUCCGAAACCAAGGCGGGCUGCCAGGGGCUGUUCACCAGAACGGGCGUUGCCGGCCUGAGACUGGCGCGGUUGGCGAAGACAGCGAUGGCUGCUACGUGCAACUUCCACGUUCCCGGCCUGCCCUGGAGCUGACGGCGCUGACGGCUCCUGGGCCGGGAUCCGGCUCCCGGCCCACCCAGGCCAAGCUGCUGGCUAAGAAGCGCGUGGUGCGAAUGUUGCUGGUGAUCGUUGUGCUUUUUUUUCUGUGUUGGUUGCCAGUUUAUAGUGCCAACACGUGGCGCGCCUUUGAUGGCCCGGGUGCACACCGAGCACUCUCGGGUGCUCCUAUCUCCUUCAUUCACUUGCUGAGCUACGCCUCGGCCUGUGUCAACCCCCUGGUCUACUGCUUCAUGCACCGUCGCUUUCGCCAGGCCUGCCUGGAAACUUGCGCUCGCUGCUGCCCCCGGCCUCCACGAGCUCGCCCCAGGGCUCUUCCCGAUGAGGACCCUCCCACUCCCUCCAUUGCUUCGCUGUCCAGGCUUAGCUACACCACCAUCAGCACACUGGGCCCUGGCUGAGGAGUAGAGGGGCCGUGGGGGUUGAGGCAGGGCAAAUGACAUGCACUGACCCUUCCAGACAUACGAAACACAAACCACAACUGACACAGGAAACCAACACCCAAAGCAUGGACUAACCCCAACGCACAGGAAAAGGUAGCUUACCUGACACAAGAGGAAUAAGAAUGGAGCAGUACAUGGGAAAGGAGGCAUGCCUCUGAUAUGGGACUGAGCCUGGCCCAUAGAAACAUGACACUGACCUUGGAGAGACACAGCGUCCCUAGCAGUGAACUAUUUCUACACAGUGGGAACUCUGACAAGGGCUGACCUGCCUCUCACACACAUAGAUUAAUGGCACUGAUUGUUUUAGAGACUAUGGAGCCUGGCACAGGACUGAUUCUGGGAUGCUCCUAGUUUGACCUCACAGUGACCCUUCCCAAUCAGCACUGAAAAUACCAUCAGGCCUAAUCUCAUACCUCUGACCAACAGGCUGUUCUGCACUGAAAAGGUUCUUCAUCCCUUUCCAGUUAAGGACCGUGGCCCUGCCCUCUCCUUCCUUACCCAAACUGUUCAAGAAAUAAUAAAUUGUUUGGCUUCCUCCUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-805.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -836.59

Frequency: 0.0000

Diversity: 697.91

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((.((((..((.(((((((.((.......))))))))).)).....)))).))).))).....(((((((((.((((((.(((((((((.((((.....)))).....((.((((((((((((((...((((...)))))).))))))))).)))))((((((..............(((((..((.((....)).)))))))..))))))((((....)))).(((((..(.(((...))))..)))))....(((.(((((........))))))))...((((((((((..........)))))))))).))))))))).)..))))))))))))))(((((..((((.((((..(((..((((((.....((((((((((......))))))))))(.((((((((((...........((((((......))))))...........))))........)))))).)((((((((...((((((..(((((((((((((.((((((((..((((.(((((..(((((......)))))..(((((..(((((((..((((.........))))))))))).))))).))))).)))).))))(((.((((((....)))))).))).))))))))))))).(((((((....(((((......)))))....))))))).((((((((((((((((((((((.....((((((((((((((((.....))))))...)))))))(((((((.........((((((((..(((.((((....(((((.((((....))))........(((((((((....))))).))))......((((.((((((..((((...(((..(((((.(.(((((....(((((...((((((((..(((.(((((..(((((((.(((((((((.(((((((((((..((.((((((((((((.((((((((((((..((((((.((....((((((....(((((((.((....)).)))))))((((((((((......))))))))))..)))))).....)))))..)))..)))))))))((((...)))).))).)))))))).)))).))..)))))))))))..)))......((((((.....))))))(((......)))..(((.((((.(((((....))))))))).))).................)))).)).))))).))..))).)).)))))))))))....(((.....))))))))..)))))...).))))).)))....))))..)))))).))))..))))).))))((((((......))))))..)))))))))))..(((((((((((((.(((.(((.(((((((((.....(((...........)))...))))))...))).))).))).))))))..)))))))..))))))))))..))).))))))))).......))).))))))).))))...)))....)))...))))))))..........((.(((.......)))..)).((((..(((....))).)))).....))))))..)))....(((((((...((((.(((((((((.(((.(((((.((((((((.(((.(((((((((........(((((...((((.(.(((.....))))))))))))).....(((((((...)))))))(((((((((((((......)))).(((....(((......)))....))))))))..)))).)))))).))).))).))).(((((..((((((...))))))..).......))))......))))))))))..((((........))))((((....(((......))).....)))).(((((..((((.(((((.........))))).))))..)))))...)))..)))).......))))).)))).)))))))............))))..)))).))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

,(({(({(((((..,{.((((({({((,,,,,,,|}}|}|}||,||,,|||}||||},{{({{,.,,.{(({((((((((((({(((((((,,((((((.....)))}...{(((.(((((((((((({(...((((...)))))}.))))))))),})))))|(((||,..||}}......((((({{((.(({,,.}}.},}}|||{{|},},)||||,...||||.{((((((({{((.,..|((....||}}|..{(,{(((((,.....,.)))))))}...((((((((((..........)))))))))),)))||))))}},.}}}}}}}}}})))){({{{..{,{.....|)}|.}})}),||||...|((((((((({......))))))))))(((......))),.,,..({{(((,((((....,.{((((((((((({....((((((.((((..{..(((.,,...)))..)..)))).)))))).))))))))))))},{{,,{(((.{(((({{{,((((((((.((....(((((.....(((({..((((((({{((((((,(((||.{{{|,||,.{((((.({{{.|||,,..,}||}}).))})),,))}))).,},}}}}.,.,||.(((((((....(((((......)))))....)))))))}}))))},))))))))}).))).)))))))))))))))||||{{.||||}||||||,..|,{{{(({((,,,.|,{{{{({{{{{{...,,((({((((|,..,((((||(((....))))........(((((((((....}))))||)))....}}))).,.{{|.{{(((((..(({..|((((,((.((..{({...{((,((((((((.((((((((....))))|({{.,.)})(({{{{,|,.,(({{,{({{({.{|{{.((((....))))}}(((((.......))))))))))))))))}..(((((((.({....}).)))))))((((((((((......)))))))))).,}}}}}}.})}}.))))}...,.|}),)})))),}}.}}.))))}))).,)))))))}}}.....{{((((((((((((...{{,,...((((((.....))))))(((......)))..(((.((((.(((((....))))))))).)))............{{{..((((((......)))))),,||}{{{((({{{{||{{{.{{(({{{..||,.,,.,)),,|,|((((({{{||||||{.....||{|{||,||,,||{...))),,}}.))))),}|||,,..)))}}..,,||,||{||...,,,,,,...}))}}))))},,,)),,)))}))),,,||{..........,||}...,.)))|||)))),},))))))).,)))))),)))))}})}{|||||(({..,,...,}).|}}.}},}.}}.,.............,,,}..}}}))))}}))))}}})),,)})))...{{.{((.......))}..)).((((..{((,...}}).)))}......)))))}})))}..}|}||}}}},.||||..|||||}((((..(({,.,,((((.((,.....))))))))}}..)})).{,{{{....,{|||||,{.,,|,}})||,,||||||...,,{{(({,.,{{||||||,,.||{...{((({,,....||||.||,......,{{{..,,,(((.(((,({(,,(({{((.,(({((((({{{{,.(((,.{{{{{,,||{{{.|,||||,||.,......,|||,|,....})))}}}})),.))),........))))))},,.)),}}},.}}}))}.,,,))))|}|||||..((((.{((((.........))))).))))..||||}.|.|||,.,)))}.,}})}}}}}}.)))|.|)))),..,,|||||....,}}))))))}},,,,,,,,..