Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_181468.2

Sequence Length

1269 nt

GC Content

0.5973

GUGUGAGGGGAACCUGGGAGGGUCAGCUCCGGUCCUGGGUCGGGAGGGGUGGGGGCCAGAGGAUUCAGGGCCGGAGGUUCUGGUGGGGGCCCAGUGGGCGGGACCCGAGGACGGAGGGGCCGGGAGGCCGAGAGGGGCGGGGUCGCGGCGGGGCCUGAGGGACGGAGGCCGGGAUACUUGGGAAAGGAUCCGCCGGCCUUGAACUCCCGCCUCCGCCGCCCCUAGGCCUCAUGGCGGUCCGAGCUUCGUUCGAGAACAACUGUGAGAUCGGCUGCUUUGCCAAGCUCACCAACACCUACUGUCUGGUAGCGAUCGGAGGCUCAGAGAACUUCUACAGUGUGUUCGAGGGCGAGCUCUCCGAUACCAUCCCCGUGGUGCACGCGUCUAUCGCCGGCUGCCGCAUCAUCGGGCGCAUGUGUGUGGGGAACAGGCACGGUCUCCUGGUACCCAACAAUACCACCGACCAGGAGCUGCAACACAUUCGCAACAGCCUCCCAGACACAGUGCAGAUUAGGCGGGUGGAGGAGCGGCUCUCAGCCUUGGGCAAUGUCACCACCUGCAAUGACUACGUGGCCUUGGUCCACCCAGACUUGGACAGGGAGACAGAAGAAAUUCUGGCAGAUGUGCUCAAGGUGGAAGUCUUCAGACAGACAGUGGCCGACCAGGUGCUAGUAGGAAGCUACUGUGUCUUCAGCAAUCAGGGAGGGCUGGUGCAUCCCAAGACUUCAAUUGAAGACCAGGAUGAGCUGUCCUCUCUUCUUCAAGUCCCCCUUGUGGCGGGGACUGUGAACCGAGGCAGUGAGGUGAUUGCUGCUGGGAUGGUGGUGAAUGACUGGUGUGCCUUCUGUGGCCUGGACACAACCAGCACAGAGCUGUCAGUGGUGGAGAGUGUCUUCAAGCUGAAUGAAGCCCAGCCUAGCACCAUUGCCACCAGCAUGCGGGAUUCCCUCAUUGACAGCCUCACCUGAGUCACCUUCCAAGUUGUUCCAUGGGCUCCUGGCUCUGGACUGUGGCCAACCUUCUCCACAUUCCGCCCAAUCUGUACCGGAUGCUGGCAGGGAGGUGGCAGAGAGCUCACUGGGACUGAGGGGCUGGGCACCCAACCCUUUUCCACCUGUGCUUAUCGCCUGGAUCUAUCAUUACUGCAAAAACCUGCUCUGUUGUGCUGGCUGGCAGGCCCUGUGGCUGCUGGCUGAGGGUUCUGCUGUCCUGUGCCACCCCAUUAAAGUGCAGUUCCCUCCGGGCCAUUCUGAAUGUGAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-535.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -558.50

Frequency: 0.0000

Diversity: 414.17

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((....)))((((((((..(((.((((((.((((((((((..(((((((((.((....))..))))((((((((.(((((((...(((((((.((((((((.....(..((((((((((((((....(((((((((..((((((((((....((((..((((((((((..(((....)))..))..))))))))....))))))).)))))))))))..)))))(((((((...(((((.(((((..(((((((((((.(((((((......)))..(((.(((((((.....))).)))))))))))((((..........)))))))))).)))))..)))))))))).)))...)))).((((((((((..(((((.......))).)).)))))).)))).....((((.((.....)).))))))))))))))).)))..)..((((((((.((((.(((.....(((.(((((....(((((..(((((((((((.......((((((((..((...((((........))))....)).)))))))).....((((.(((((((((((((((((..(((((.((.(....(((((....))))).....).)).))))).)))..((((......)))).))))...)))))).))))))))...)).))))))))).........(((((((((.(((.(((((.....((((....))))....))))).))))))))))))..(((((((((((((...)).))))))).))))..))))).))))))))...))).))))..)))))))).(((.((((((.((..((((((..((((......))))))))))))...((((((((.((..((.(((((.......)))))..))..))..)))))))).))))))))).)))).)))))))))))....))))))).))...))))))........)))))...)))))))))).)))))).)))..))))))))(((((((.((((.(((((...)))))((((((((((((((.((((.((((.((...(((..((((((.(((....))).)))))))))...)).))))(((.....))).........))))....)))).)))))))).)).(((((((((.((....)))))))))))(((((..((((......(((......)))......))))..))))).))))......)))))))...........

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,,,{(((,.(((,(((({{....(((((((((((((((....,{(((...,|))....))))))))))))))},{,{(((((((((({({{.}|||(({{{((,.{{{{{|.((((((({((((((,..,(((((((((..({((((((((....(({{..((((((((((,.(((....))).,))}.})))))))...,))))))).))})))))))).,))))).|||||||}}((((,,(((((..((((((((((({(,((,,{.{{{{{,,,..(((.(((((((.....))).)))))))..,,,|||}}.,...}}.}})}}))))).)))))..)))))))))),||}{{{||{{{{{(((({{{{..{{||{,...,,,|||.||,|||}}}.}|||,|.,||{||}|{,,,..}}.}}}))))||||||||.}}}.......,,.,,.)))))))}||{|....,...((((((((((({(({(.{{(.(((((((((.((((((((((((((.((((,.({((((((((({,((((.((((.,,........,.))))((((,{((((........)))))))))...(((((....))))).,.)))))))))))))|{{{{((({...,,.,}}|,,{(({,{{(({(({(((,({(({,.{|}}}})},}}},,}}}....{((((((((.{({.(((((...|.((((....)))).|..))))).})|))))))))}..{(({((((((({,...,}.))))))).})))..|||{((((((((.(({({(((((((,.((((((((...{.((((.({,,,,(({{{({,,{(({{{{..|||,|||,||,...||,||}.|||,,,}}})))}}}.)))}}..}.,)))))).}...)))))))),),)))))).)))}.},)}))))))),...)))))))))).))).}}}}}},......{(((.(((({...)))))))))))).))))...)))))))))...))))).))))))))).,,.}})))}.,))}||||(((.{{((((.((..,(((..((((({.(((....))).)))))))))...)).)))).}})))..,......,......(((......))).)))))))).||{{{{|||||||,}}})))}))))))},,)))))))))},,}))},))).)))))),.....,,.,..))))))})))}.|}}...................