Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_182528.4
Sequence Length
1905 nt
GC Content
0.6824
AGAGCGCGCCGCGGAGCCGGGGCGCCCUCACUGCGCUAGGAGCCCCACUAAACCCAGCGGAGCGGAGCCUGGCGGGAGGCAGCGCCGCGGAGCCAGCGCCGGACGCCGCAAGCAGACUCCCCGGCCAGCGCAAGCACUCCCUGGCCGGCGCCGGACCCUCGGGGCGCCGGAUUCGUCUUGUGUGCCCCACGUCAUGCGCGCGGGCGUCCGCGGCUCUCCCGACCAGCCCCAGCGCGGUGGGCCCAGGCUCAGAGGUCCCGGCGCCUCUCGCUGAAGUAGUUGGGUAGCCGGGGCUGGGGGUCGCCACGUCGGGGGCGCGGCCAGGACCCGCGGAGCCGGUCCCCGAGCGCGGGGAGCGGGGCCGCCCGCGCCGCCCCACCAUUACCUCCCCGGGCGGCAAGGAGGAGCUGGUGGCGGUCGCCUCCCGGCUGUGGCAGCGGCGGCGGCGUGCCUGCCUGGCGGCCGUCGGCGUACUCUUGGCCAUGGCGCUCGGGCUGCUCAUCGCCGUGCCGCUGCUGCUGCAGGCGGCGCCCCGAGGCGCCGCGCACUAUGAGAUGAUGGGCACCUGCCGCAUGAUCUGCGACCCUUACACUGCCGCGCCCGGCGGGGAGCCCCCGGGUGCAAAGGCGCAGCCACCCGGACCCAGCACCGCCGCCCUGGAAGUCAUGCAGGACCUCAGCGCCAACCCUCCUCCUCCUUUCAUCCAGGGACCCAAGGGCGACCCGGGGCGACCGGGCAAGCCAGGGCCGCGGGGGCCCCCUGGAGAGCCGGGCCCGCCUGGACCCAGGGGCCCUCCGGGAGAGAAGGGCGACUCGGGGCGGCCCGGGCUGCCAGGGCUGCAACUGACGGCGGGCACGGCCAGCGGCGUCGGGGUGGUGGGCGGCGGGGCCGGGGUAGGUGGCGAUUCCGAGGGUGAAGUGACCAGUGCGCUGAGCGCCACCUUCAGCGGCCCCAAGAUCGCCUUCUAUGUGGGUCUCAAGAGCCCCCACGAAGGCUAUGAGGUGCUGAAGUUCGAUGACGUGGUCACCAACCUCGGCAAUCACUAUGACCCCACCACGGGCAAGUUCAGCUGCCAGGUACGCGGCAUCUACUUCUUCACCUACCACAUCCUCAUGCGCGGCGGCGACGGCACCAGCAUGUGGGCGGACCUCUGCAAGAACGGGCAGGUCCGGGCCAGCGCCAUUGCACAGGACGCCGACCAGAACUACGACUACGCCAGUAACAGCGUGGUGCUGCACUUGGAUUCAGGGGACGAAGUGUAUGUGAAGCUGGAUGGCGGGAAGGCUCACGGAGGCAAUAAUAACAAGUACAGCACGUUCUCGGGCUUUCUUCUGUACCCGGAUUAGGGGCGCGGGGGGUGCGAGGCGGGGUGGCUGCAGGCCGCCCGGUCUCCGCCCGGGCGCGGCUCCUUGGCAAAGGCCACUCUCGAUUCAUAACACUUCCUGACAUCUCCUUUGGAAAAGACAAAUCCCUGCGUCCUCCCUGCCCCGCUCCUGGCCUCAGUGCGUCUGCGACCCACCACGCUCAGGGCUGUGCUCCUGGUCUCCAUCCCCAUCCCGGCAAGGGAGGAAGGGACGCCCGAGCCCUUGAGGCGGCGGCACAGACUUUGCAAACCUGAUUAGACUGGACAGGCAGGGCCGGGAGCCUGCCCUCCUCAGACAGCCUCCUCCCAGUGCCUAGAAGCGGAGGGCUCCGGGCCCUGGCCAGGGAGGUAGGCCAGAGGGAGCGCGGGCUUCCUGGGGCGUCCUUCUUUGUGACCCGAAAUACUUGUGCAGAUUUCCCUGUCCAUCAGCCAAAACCCCACCCACAGCAGAAUUCCAGCAAACAGAAAAUUCACCUCUCCACACCGCAUUCCCUCCUGACUCAGACUCACCGCGAUGCAUUAAAUUAUGUUUUUAGACUAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-915.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -950.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 431.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((.(((((((((.((((....((((((((((....((.((.((......)).)).))((.((.((((((((((....(((((((((((.(((((((((((((((((..((.(((..((((((.(........).))))))((((((..........))))))))).))..)))))).)).....))).)).)))).))).))))))))))))))).))))).)))))))))))))))).)))))((((((((((((((((...((((...)))).)))).))))))(((((((((((((.(.((((((((.(((.(.(((((...((((((((.(((.((((((.(((((((((((((((((((((((((...............)))))))........(((((((.(.((((((..(((.((((((((((((((((((((((...((((((((.((((.(((.........)))))))))).)))))....)).))))..)))))))))))))))).))).(((....)))((((((((...((((..(((((((.((((((((.....((((.(((((.((.((((.((((((((.(((...)))))))))))...(((...)))....((.((..((.((((((.((((.(.....).)))).(((.((((((....(((.((((((((......)))))(((...(((..(((((.....)))))...))).)))...((((((.(((((((....(((((....)))))..))))))).))))))))))))...)))).)).)))(((((((((....)).)))))))......))))))))..)))).)))).)).))))).)))))))))))))))..(((((((((.((((((((((.((..(((((((((((((...))))...((((((((.((.((.....((((((...(((((...........)))))))))))..)).)))))))))).......)).))))))))).)))))).))))(((.((.(((......))))))))...(((((.......)))))..........))))))))).)))))))))))))))))))))).))))))))..))))))).....((((........))))(((((((((.(.((....)).).)).(((((.((((...(((.(((((((........)))))))..(((((((.(.(((...)))).))))))).)))...)))).)))))(((((((((..((((((................)).).)))..)))))))))......)))))))..(((((((((((((((.(((((.((((((((...)))))))).)))))))))((((.(.(((..(((....)))))).).))))...........((((.............)))).........)))))))))))....))))))))))).))....(((.(((...))).)))...)))).)))))).))))).)))))...((((..((((.....))))....)))).).))).)))))))).).)))))).(((...........)))....((.(((((((((((((((.(((((((.((((.((.((...((((......)).)))))).)).)).))))))).)))))))((.(((((((.(.(((..(((((((....)))))))..))).)))))))).)).....(((((.((.....))))))))))))))))).............))).)))).(((((.............))))))))))).................(((...)))......)))).)))........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{{.(((,(((((((((.{((|,|.|||((((((((.((.((.((.((......)).)).)}{{.(,(((((((((((....(((((((((((.(((((((((({{((({(,,((.(((.,((((((.(........,.))))))((((((.,.....,.,))))))))).}},,)))))),))....,))).)).)))).))).))))))))))))))).)))))})}}))))))))))))).))))}((((({((((((((((,..((({...}))).)))).))))))((((((((({{{...,((((((((((((((.(((((.((....(((.((((((....)))))).))|(((((((((((((((((...............)))))))........(((((((.(.((((((..(((.(((((((((((((((((((({(...(((((((,{((((.(((.........)))))))))).))))).}..}}.))))..)))))))))))))))).))).(((....)))((((((({...((((..(((((((.((((((((.....((((.(((((.,,.,,(({((((((((.(((...)))))))))))...|}}((((({....((...((((.(((((((((((,,.(((...|.,},|.|},{{{{{..,{(({((({(((({......})))}(((...(((..(((((.....)))))...))).)))|{{,(((((((((((((....(((((....))))).,))))))))))))))))))}).,,))}),))))))))))}.,)))))))).}))))))...,{{|{,(||||...))).,)),}))}))))).)))))))))))))))..(((((((((.((((((((((.{(..(((((((((((((...)))),,,((((((({,((.((.....((((((..,({(((,{,....}},,))))}))))))..)).))))))))))........,.))))))))}.)))))).)))).||.{{.(((......)))}||||..,({(((,......})))),...,,,...})))))))).)))))))))))))))))))))),})))))))..)))))))).)).{{{,.....})})).))))).)))).)))))..,|{{{((((((((,..(((.{(((((.{(((....))}...})))))).))).....((((.(((((,..(((((((.((((((.{.(((((((,{((((((((..(((({(............,...||.|,}}},,))))))))}|{||,.{{|,,...,|||(((({..(((((.(((((.((((((((...)))))))).))))))))))..})))}|))))}|}||....)))).))).}.)))))))))))))........,,,.,,|},.....,,..,))))).)))).(((((((,,{.({(,(,,.((((((((((((.(.,({.((.(.((((((((({.(((({{.,(((((.,.{({.,,,,}}...,)))))..)))).)).,,)))))}})))).)).))).)))))...)))...))))...}.,,))},.)))))))((((((((((((.((((({.....((((((((((.(.(((......,..({{{{|,.,)))))))))).)))))).))))..}}))))).))))))}}))))))))))))}....,)}),)))}}......||,|{|{.,....}})}.},.,,}........,..}}}.)})).{{{{|,},,,.....|..,,,}}}}}))}..............,,.|||,..}})..,,.,)))).}}}.,......,,|,............
Back