Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_182681.1
Sequence Length
745 nt
GC Content
0.5262
AAAGGAUCAAGCAUCCCUGAGUUUCAAACAGAAACUUGCACUGAAUACAUUCAAAGAACCAUCAAGAAAUGGGGACCUGGAUUUUAUUUGCCUGCCUCCUGGGAGCAGCUUUUGCCAUGCCUGUGCUUACCCCUUUGAAGUGGUACCAGAGCAUAAGGCCACCGUACCCUUCCUAUGGUUACGAGCCCAUGGGUGGAUGGCUGCACCACCAAAUCAUCCCCGUGCUGUCCCAACAGCACCCCCCGACUCACACCCUGCAGCCUCAUCACCACAUCCCAGUGGUGCCAGCUCAGCAGCCCGUGAUCCCCCAGCAACCAAUGAUGCCCGUUCCUGGCCAACACUCCAUGACUCCAAUCCAACACCACCAGCCAAACCUCCCUCCGCCCGCCCAGCAGCCCUACCAGCCCCAGCCUGUUCAGCCACAGCCUCACCAGCCCAUGCAGCCCCAGCCACCUGUGCACCCCAUGCAGCCCCUGCCGCCACAGCCACCUCUGCCUCCGAUGUUCCCCAUGCAGCCCCUGCCUCCCAUGCUUCCUGAUCUGACUCUGGAAGCUUGGCCAUCAACAGACAAGACCAAGCGGGAGGAAGUGGAUUAAAAGAUCAGAAGAUGAGAGGGGAAUGAAUACUUCAGAUGCUUUCAGGAGUGACACAAGAACACAAUGAUUUUUGCUUAUAAUCACUUUACUUAGCAAAUUCUGUAACUAAAAAAGUACCAUUAGCAGACAAUAAAAUGCAUUAAAAAUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-177.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -194.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((.....))))..(((((((.....)))))))....((((....)))).....((((......)))).....((.((((((((.(.((((((((((((((((((....))...(((((((((((((.((....)).)))....)))))).))))...((((.((.......)).))))....(((((((((..(((((((................(((((((....))))))).....((.((((...(((((((.....((((((......))))))...)))..))))...)))))).....(((........))).......((((...........((......))...........))))...............((..(((((........((....)))))))..))....((.......))...)))))))....)))))))))........((((...)))).((....))....((((........(((((((.......((((.((((((....((((.((......)).))))((((((.(.((....))...).)))))))))))).)).)).........(((.....)))..)))))))........))))))))))))))))............(((..((..((((((..(((.....)))...)))))).))))).(((.....))).......)))).))))))))).))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((,,.....,|||,{(((((((.....)))))))....((({....}))).....{({{......})))}}},,|(.(((((({{{(.((((((((((((((((((....))...(((((((((((((.((....)).)))}...}))))),,)))...((((.((.......)).)))).|,.(((((((((..(((((({................(((((((....))))))).....{{.((((...(((((((.....((((((......))))))...)))..))))...))))}}.....({(.,......))}..|||.,{((,...........{,...................)}}}...........||..({..,||,{|.......{,....|,||||,..}}.,},},,......},...)))))))....)))))))))........((((...)))).{{....)}....((((.......,(((((((......,(,({.((((((..,{((((.((......)).))))||((((.,.{{....}}...).)))))})))))).}).))........|{(,...,,)},..)))))))|.......)))})))))))))))).................{,..((((((..,{{.....}},...)))))).}},||.{((.....))).......)))).))))))))).)}..........
Back