Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_182810.3
Sequence Length
1419 nt
GC Content
0.5321
CAUUUCUACUUUGCCCGCCCACAGAUGUAGUUUUCUCUGCGCGUGUGCGUUUUCCCUCCUCCCCGCCCUCAGGGUCCACGGCCACCAUGGCGUAUUAGGGGCAGCAGUGCCUGCGGCAGCAUUGGCCUUUGCAGCGGCGGCAGCAGCACCAGGCUCUGCAGCGGCAACCCCCAGCGGCUUAAGCCAUGGCGCUUCUCACGGCAUUCAGCAGCAGCGUUGCUGUAACCGACAAAGACACCUUCGAAUUAAGCACAUUCCUCGAUUCCAGCAAAGCACCGCAACAUGACCGAAAUGAGCUUCCUGAGCAGCGAGGUGUUGGUGGGGGACUUGAUGUCCCCCUUCGACCAGUCGGGUUUGGGGGCUGAAGAAAGCCUAGGUCUCUUAGAUGAUUACCUGGAGGUGGCCAAGCACUUCAAACCUCAUGGGUUCUCCAGCGACAAGGCUAAGGCGGGCUCCUCCGAAUGGCUGGCUGUGGAUGGGUUGGUCAGUCCCUCCAACAACAGCAAGGAGGAUGCCUUCUCCGGGACAGAUUGGAUGUUGGAGAAAAUGGAUUUGAAGGAGUUCGACUUGGAUGCCCUGUUGGGUAUAGAUGACCUGGAAACCAUGCCAGAUGACCUUCUGACCACGUUGGAUGACACUUGUGAUCUCUUUGCCCCCCUAGUCCAGGAGACUAAUAAGCAGCCCCCCCAGACGGUGAACCCAAUUGGCCAUCUCCCAGAAAGUUUAACAAAACCCGACCAGGUUGCCCCCUUCACCUUCUUACAACCUCUUCCCCUUUCCCCAGGGGUCCUGUCCUCCACUCCAGAUCAUUCCUUUAGUUUAGAGCUGGGCAGUGAAGUGGAUAUCACUGAAGGAGAUAGGAAGCCAGACUACACUGCUUACGUUGCCAUGAUCCCUCAGUGCAUAAAGGAGGAAGACACCCCUUCAGAUAAUGAUAGUGGCAUCUGUAUGAGCCCAGAGUCCUAUCUGGGGUCUCCUCAGCACAGCCCCUCUACCAGGGGCUCUCCAAAUAGGAGCCUCCCAUCUCCAGGUGUUCUCUGUGGGUCUGCCCGUCCCAAACCUUACGAUCCUCCUGGAGAGAAGAUGGUAGCAGCAAAAGUAAAGGGUGAGAAACUGGAUAAGAAGCUGAAAAAAAUGGAGCAAAACAAGACAGCAGCCACUAGGUACCGCCAGAAGAAGAGGGCGGAGCAGGAGGCUCUUACUGGUGAGUGCAAAGAGCUGGAAAAGAAGAACGAGGCUCUAAAAGAGAGGGCGGAUUCCCUGGCCAAGGAGAUCCAGUACCUGAAAGAUUUGAUAGAAGAGGUCCGCAAGGCAAGGGGGAAGAAAAGGGUCCCCUAGUUGAGGAUAGUCAGGAGCGUCAAUGUGCUUGUACAUAGAGUGCUGUAGCUGUGUGUUCCAAUAAAUUAUUUUGUAGGGAAA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-495.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -519.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 259.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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