Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_201442.4
Sequence Length
2769 nt
GC Content
0.4868
AUCUUAUGAACAGAACCAGGACAGGGAGGCUGGCCGGAGGUUCCUGCAGAGGGAGCGUCAAGGCCCUGUGCUGCUGUCCCUGGGGGCCAGAGGGGUUGCCCAGCAUGCCCACUGGCAGGAGAGAGGGAACUGACCCACUUGCUCCUACCAGCUUCUGAAGGUGACACUGAGCCCCAGGUGACGCCGCACCACCAAAGAAGGUGCUUGUGUUUGUCAGACAAAUACAGCCAGGCCUGCCACCCCUUAGGCUCCAAAGUCCGGAGGUGCAGAAAGCCAGGACCAAGAGACAGGCAGCUCACCAGGGUGGACAAAUCGCCAGAGAUGUGGUGCAUUGUCCUGUUUUCACUUUUGGCAUGGGUUUAUGCUGAGCCUACCAUGUAUGGGGAGAUCCUGUCCCCUAACUAUCCUCAGGCAUAUCCCAGUGAGGUAGAGAAAUCUUGGGACAUAGAAGUUCCUGAAGGGUAUGGGAUUCACCUCUACUUCACCCAUCUGGACAUUGAGCUGUCAGAGAACUGUGCGUAUGACUCAGUGCAGAUAAUCUCAGGAGACACUGAAGAAGGGAGGCUCUGUGGACAGAGGAGCAGUAACAAUCCCCACUCUCCAAUUGUGGAAGAGUUCCAAGUCCCAUACAACAAACUCCAGGUGAUCUUUAAGUCAGACUUUUCCAAUGAAGAGCGUUUUACGGGGUUUGCUGCAUACUAUGUUGCCACAGACAUAAAUGAAUGCACAGAUUUUGUAGAUGUCCCUUGUAGCCACUUCUGCAACAAUUUCAUUGGUGGUUACUUCUGCUCCUGCCCCCCGGAAUAUUUCCUCCAUGAUGACAUGAAGAAUUGCGGAGUUAAUUGCAGUGGGGAUGUAUUCACUGCACUGAUUGGGGAGAUUGCAAGUCCCAAUUAUCCCAAACCAUAUCCAGAGAACUCAAGGUGUGAAUACCAGAUCCGGUUGGAGAAAGGGUUCCAAGUGGUGGUGACCUUGCGGAGAGAAGAUUUUGAUGUGGAAGCAGCUGACUCAGCGGGAAACUGCCUUGACAGUUUAGUUUUUGUUGCAGGAGAUCGGCAAUUUGGUCCUUACUGUGGUCAUGGAUUCCCUGGGCCUCUAAAUAUUGAAACCAAGAGUAAUGCUCUUGAUAUCAUCUUCCAAACUGAUCUAACAGGGCAAAAAAAGGGCUGGAAACUUCGCUAUCAUGGAGAUCCAAUGCCCUGCCCUAAGGAAGACACUCCCAAUUCUGUUUGGGAGCCUGCGAAGGCAAAAUAUGUCUUUAGAGAUGUGGUGCAGAUAACCUGUCUGGAUGGGUUUGAAGUUGUGGAGGGACGUGUUGGUGCAACAUCUUUCUAUUCGACUUGUCAAAGCAAUGGAAAGUGGAGUAAUUCCAAACUGAAAUGUCAACCUGUGGACUGUGGCAUUCCUGAAUCCAUUGAGAAUGGUAAAGUUGAAGACCCAGAGAGCACUUUGUUUGGUUCUGUCAUCCGCUACACUUGUGAGGAGCCAUAUUACUACAUGGAAAAUGGAGGAGGUGGGGAGUAUCACUGUGCUGGUAACGGGAGCUGGGUGAAUGAGGUGCUGGGCCCGGAGCUGCCGAAAUGUGUUCCAGUCUGUGGAGUCCCCAGAGAACCCUUUGAAGAAAAACAGAGGAUAAUUGGAGGAUCCGAUGCAGAUAUUAAAAACUUCCCCUGGCAAGUCUUCUUUGACAACCCAUGGGCUGGUGGAGCGCUCAUUAAUGAGUACUGGGUGCUGACGGCUGCUCAUGUUGUGGAGGGAAACAGGGAGCCAACAAUGUAUGUUGGGUCCACCUCAGUGCAGACCUCACGGCUGGCAAAAUCCAAGAUGCUCACUCCUGAGCAUGUGUUUAUUCAUCCGGGAUGGAAGCUGCUGGAAGUCCCAGAAGGACGAACCAAUUUUGAUAAUGACAUUGCACUGGUGCGGCUGAAAGACCCAGUGAAAAUGGGACCCACCGUCUCUCCCAUCUGCCUACCAGGCACCUCUUCCGACUACAACCUCAUGGAUGGGGACCUGGGACUGAUCUCAGGCUGGGGCCGAACAGAGAAGAGAGAUCGUGCUGUUCGCCUCAAGGCGGCAAGGUUACCUGUAGCUCCUUUAAGAAAAUGCAAAGAAGUGAAAGUGGAGAAACCCACAGCAGAUGCAGAGGCCUAUGUUUUCACUCCUAACAUGAUCUGUGCUGGAGGAGAGAAGGGCAUGGAUAGCUGUAAAGGGGACAGUGGUGGGGCCUUUGCUGUACAGGAUCCCAAUGACAAGACCAAAUUCUACGCAGCUGGCCUGGUGUCCUGGGGGCCCCAGUGUGGGACCUAUGGGCUCUACACACGGGUAAAGAACUAUGUUGACUGGAUAAUGAAGACUAUGCAGGAAAAUAGCACCCCCCGUGAGGACUAAUCCAGAUACAUCCCACCAGCCUCUCCAAGGGUGGUGACCAAUGCAUUACCUUCUGUUCCUUAUGAUAUUCUCAUUAUUUCAUCAUGACUGAAAGAAGACACGAGCGAAUGAUUUAAAUAGAACUUGAUUGUUGAGACGCCUUGCUAGAGGUAGAGUUUGAUCAUAGAAUUGUGCUGGUCAUACAUUUGUGGUCUGACUCCUUGGGGUCCUUUCCCCGGAGUACCUAUUGUAGAUAACACUAUGGGUGGGGCACUCCUUUCUUGCACUAUUCCACAGGGAUACCUUAAUUCUUUGUUUCCUCUUUACCUGUUCAAAAUUCCAUUUACUUGAUCAUUCUCAGUAUCCACUGUCUAUGUACAAUAAAGGAUGUUUAUAAGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-943.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -994.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 558.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((...(((((((((.(..((.((((.((.((((((.....)))))).))..))))..))..).)))).)))))..(((((.(((..(((...)))..))).)))))((((((((((((((((.(((.....(((((.(((((......((......))((((..(((((((((((((..((((......)))).((((((((((...))))))))))...((((((........))))))....((((.((((((((.....(((((((....(((((((((((..(((((...(((........)))......)))))..))).))))))))...))))))).((((..(((((((((..((....((..(((((.......)))))..))))..)))).))))).))))(((((((((((.(((((((((((......)))))..........))))))...)))))))))))((.((((..(((.(((((.((......((((((..........))))))....((((((......))).)))..)).))))).)))..)))))).(((((.....(((((((((((((....(((((...))))).(((((.((((((.((((((..((((((((((.((((..((((((....))))))...(((((((((((((.(((((.(((((((......))))))...).))))))))))))))))))........(((((((((.................)))))))))....((....)).....(((........)))....)))).))))).)))))))))))...(((((((((......))))))))).(((((((((..........)))))))))...((((((.((((((((.(.(.((((((.....(((((...(((.((((((......)))))).)))))))))))))).)....(((((((....(((.((.((((.(..((....))..).)))).)).)))....))))))).((((((((((((((...(((((........(.((((..((....))..)))).).......(((...(((((((...)))))))...)))....))))))))))))...((((((......((((((((..(((((......))))).))))..))))))))))..........(((((((......))))))))))))))..(((..((((.((....)).))))..)))........).))))))))))))))..))))))..)))))((((((...))))))(((((((((.(.(((....)))))))))))))((((.....))))...(((....))).((((((((.((((((..((((....(((((...)))))......((((((.(((((.((....)).))))).))).)))..(((.......))))))))))))).).))))).))....)))))..)))))))).....))))).((((((..((.((.((((.((..((.(.(.((((((((((((...........))))).(((((((((.(((((((.....((((((........))))))....)))).))))))...)))))).......(((.(((.(((...(((......)))...))).)))..))).....(((((....)))))(((((((.((..(((((((((((((.(((((((.......(((.((((((.....)))))).))).))))...((((.((((.(((.(((..((((...(.(((((((....))))))).)))))..))).))).)).))...))))(((..((((.....))))...))).............))).))).))).)))))))..)))))))))......))).)))))).)))).)))).)).))))))))))))))))...))))....(((((....))))).(((((((....))))))).((((((.((((((....((....))...))))))))))))..)))))...))))))))..)))).....(((..(((...((.(((((((((((......)))).(((...((....))...)))))))))).))..)))..)))..))))))))))....)))))(((((((.(((((.(((((.....(((.(((....))).)))((((((((((.((..((((((((((((((....(((((..((((((..((((((((..(((((((.((....)).)))))))..))).......((((.((..(((.(((........))).)))..))))))..)))))(((((((((.......(((.(((..(((((.(((.....))).)))))....))).))).......).)))))))).((((...(((((((..((.((.((......)).)).))..)))))))...)))).(((......)))..))))))..)))))..))))))))))..((((((..((((.....))))..))))))))))...)).)))))))))).)))))(((((.((((((.(((......)))..))))))..)))))....)))))))).)))).(((....))).........))))))))))).))).........(((.((((.(((..(((...((((....))))...)))..))))))))))))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((((((......((((((({{((..((((.((.((((((.....)))))).))..))))..((((.((.(((((((((((((((.{((,,(((...))).}))).)))))(((((,(((((......})).)),.))))).{(({{.{,...,},,},..,,,..))))))).))))).))))((((......)))).,(((((((((...)))))))))}((.((((((,,(((((...((((....)))).)).)))))))...))).))...........((((((((((((({{{((,,,,..,((((,,...,|||}|,,,}},}}}}}..}}}},}})))).((((..(((((((((..,,....((..(((((.,...,.)))))..)),,..))))}})))).))))(((((((((((.(((((((((((......)))))..........))))))...)))))))))))}},}))))....))))))))).((((.((((((..........))))))....))))((((((((..(((.,((({...(((((((((.{((((((((((.,...(((((((((((({....(((({...|||||.(((((.((((((.((((((..((((((((((.((((..((((((....)))))){{,(((((((((((((.(((((.{((((((......))))))...}.))))))))))))))))))}}......(((((((((..{{.{,....,,))..)))))))))....((....)).....(((,....}}},,,....)))).)))))},))))))))))...(((((((((......))))))))).(((((((((..........)))))))))...((((((.((((((((.....,.,((({,...(((((.((((((((((((,,((((..(((((((.((((..(({{((({...(((((((....(((.((.((((.(..({....))..,.)))).)).)))....))))))).}))))))..)))).),}))))),))))...{.((((..((....))..)))).}.......{({...(((((((...)))))))...))}}}})))}}}))).,|{...(((((,.....,((((((((..(((({......})))).))))..))))))))))..,{((((({,((((((......))))))|{((....}})),.....)))))))...))).)))))...,,.)))),))))))))))))))..))))))..)))))((((((...))))))(((((((((.(.(((....)))))))))))))|||||...}))))...{{{....)}}.(((((((,.((((((..((((....(((({...,}}}|,...{.((((((.(((((.({....}).))))).))).))).}{||,,.....))))))))))))).,.))))).))....}))))},}))))))).....}))|{{((((((..((.((.((((.({..(({(,(.((((((((((((.,{......||))))).(((((((({.(((((((.....((((((........))))))....)))).))))))...)))))).......{((.{((,(((...(((......)))...))).)))..}}},,}}}{((({....})))|(((((((.((..(((((((,{,,{{{{{.,,,,...})},(((.((((((.....)))))).))).,.,{{((((((.{{{{.{{{{{((,...,,,|.,.(((((((....))))))).}|,,..,{||||,,}))}}},.})}}}||{..{({(.....))))...))}..,.,,.........}}))))))).)))))))..))))))))),.....))).))))}).)))).)))).)).))))))))})))||||{{{{.,,....{{{{,.}}.,)))).(((((((....))))))).((((({,((((((....((....))...)))))))))))),}|}|||,,|)}}})},,..)))))))}.......{(({{{((({.....((((......)))).{{{...{(({{{((((.,.,,{{{.(((({.(((..,{{|||{{{,,,,,,,.,..,))))))})}.,,)))..}||||,....,||,}}}))}}})))})..((((((((((.((..((((((((((((((....(((((..((((((,.((((((((..(((((((.((....)).)))))))..))).......((((.{(..(((.(((........))).)))..)}))))..}))))|{{{,(((....,}}.,,,.{,,..(((((.(((.....))).)))))....}}|.,||..,{{{{,{{|,|||||{{.......,,,,,{.}||}||,,,,,.}}})).}}.}},.}|}}}||...,,,,.||,.,,,,,))),.))))))..)))))..))))))))|(((((((......||.)))))).,.....,))))))...)).)))))))))).,}}}}(((((.((((((((((......)))),})))))..))))),))))))))....)))))))))...))))..)))..))))))))))),.))))))).....(((.((((.(((..(((...((((....))))...)))..))))))))))))))))))))....
Back