Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_201446.3
Sequence Length
1306 nt
GC Content
0.6784
GCGGGCUCGGGCGGCAGUGGCGGCGGCGCGUGCGCGCCCCGGAUCCGGCGGCCACCCAGAGGAGAAGGCCACCCCGCCUGGAGGCACAGGCCAUGAGGGGCUCUCAGGAGGUGCUGCUGAUGUGGCUUCUGGUGUUGGCAGUGGGCGGCACAGAGCACGCCUACCGGCCCGGCCGUAGGGUGUGUGCUGUCCGGGCUCACGGGGACCCUGUCUCCGAGUCGUUCGUGCAGCGUGUGUACCAGCCCUUCCUCACCACCUGCGACGGGCACCGGGCCUGCAGCACCUACCGAACCAUCUAUAGGACCGCCUACCGCCGCAGCCCUGGGCUGGCCCCUGCCAGGCCUCGCUACGCGUGCUGCCCCGGCUGGAAGAGGACCAGCGGGCUUCCUGGGGCCUGUGGAGCAGCAAUAUGCCAGCCGCCAUGCCGGAACGGAGGGAGCUGUGUCCAGCCUGGCCGCUGCCGCUGCCCUGCAGGAUGGCGGGGUGACACUUGCCAGUCAGAUGUGGAUGAAUGCAGUGCUAGGAGGGGCGGCUGUCCCCAGCGCUGCGUCAACACCGCCGGCAGUUACUGGUGCCAGUGUUGGGAGGGGCACAGCCUGUCUGCAGACGGUACACUCUGUGUGCCCAAGGGAGGGCCCCCCAGGGUGGCCCCCAACCCGACAGGAGUGGACAGUGCAAUGAAGGAAGAAGUGCAGAGGCUGCAGUCCAGGGUGGACCUGCUGGAGGAGAAGCUGCAGCUGGUGCUGGCCCCACUGCACAGCCUGGCCUCGCAGGCACUGGAGCAUGGGCUCCCGGACCCCGGCAGCCUCCUGGUGCACUCCUUCCAGCAGCUCGGCCGCAUCGACUCCCUGAGCGAGCAGAUUUCCUUCCUGGAGGAGCAGCUGGGGUCCUGCUCCUGCAAGAAAGACUCGUGACUGCCCAGCGCCCCAGGCUGGACUGAGCCCCUCACGCCGCCCUGCAGCCCCCAUGCCCCUGCCCAACAUGCUGGGGGUCCAGAAACCACCUCGGGGUGACUGAGCGGAAGGCCAGGCAGGGCCUUCCUCCUCUUCCUCCUCCCCUUCCUCGGGAGGCUCCCCAGACCCUGGCAUGGGAUGGGCUGGGAUCUUCUCUGUGAAUCCACCCCUGGCUACCCCCACCCUGGCUACCCCAACGGCAUCCCAAGGCCAGGUGGGCCCUCAGCUGAGGGAAGGUACGAGCUCCCUGCUGGAGCCUGGGACCCAUGGCACAGGCCAGGCAGCCCGGAGGCUGGGUGGGGCCUCAGUGGGGGCUGCUGCCUGACCCCCAGCACAAUAAAAAUGAAACGUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-642.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -662.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 459.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..((((.((((.(((((((((((....)))))((((....((((((.........((((..(((.(((.(((((......)))))...).))))))))).(((((((((((......(((..((((((((.(..((((((((.((((.((((((((..((((...))))..)))))))).)))))))(((((..((((((...)))))))))))(((.(((((.....))))).)))............)))))..).))))))))))).))))))))).))......((((((((.((.((....((((((((...((.(((((....))))).))..)))..))).)).((((..(((((.......))))))))).....))))))))))))(((......)))..))))))...))))....(((((.(((..(((((((((((.(((((...((((...))))(((((((((......))))))).))....((((.(((.(((((((((..(.(((((....))))))))))))))))))...)))).(((((((((.(((((((((((((((((((((((.((((((((((....(((((((...)))))))....((.(((((((....)).)))))))...((....)).)))))))).))................((((((((((.((((.(((.(.(((.((((.((......)).)))).))).).(((((..((.((..(((((......)))))..)).))...))))))))))))....))))))).))))))).).)))))))))).)).))).((.(((.(((...))))))))........(((.((.((((((((........)))))))).)).)))..))).))))))))))))))..)))))))))))..))))))))..)))))))))).))))....))))..))......((((((((((((((..(((.(....))))..)))...((((((((......))))))))..........((((((.......))))))...((((...((((((.(((((((((.((((.((........)).)))).)))((((((.........))))))((.....)).))))))..))))))))))(((((....))))).(((((..(((.(((((((((.((((...((((.((((....))))...((((....)))))))).)))).))))))))))))..))))))))))))))))...................
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(((,{{(((({((((.(((((((((((....)))))((({.,.,(((((({.{(({,.{(,{..{(({.(({.(((((......)))))...}.))))}}|||,((((({{((((,|.,,|||{,{{(((({,,(((,((((((((,{{,..(((({(((,.((((...)))),,))))))))||||},|{(((((.(((((((...))))))),||,((((((((((.(((|(|...,|......,.,))))))))).}))))),,.}))))})))))}|||,,,{,....,}..||)}.,}})))},.)}||||||}}}|||{{{||,,,,}}}})||},{||...)}},||||||(,.{{{{{..,....}))))))))}}}}})))))))}}}}.|||,,....})),.)))))),,})))),.,|(((((.(((..(((((((((((.(((((...({((,..}}}){,{{{|||(..,...}}}))),,))....((((.((,{(((((((((.,(.(((((....))))))))))))))))))...)))).(((((((((.(((((({{(((((((,(((((,{,{(((((({{{..,,(({{(((...)))))))...,((.{{{{{{{..,,)),))))))}..}||}}},||,||}||},|.||..{{..((({{.{{((((((((((((.((((.(((.(.(((.((((.((......)).)))).))).).(((((..{(|(,,,(((((......)))))..)).}),..))))}))}))))....))))))))...,)))})),))))),})),,}.,))}||.||,,|||,,,)}))}}}).,...,|,(((.((.((((((((........)))))))).)).))}.}))).))))))))))))))..)))))))))))..)))))))).,)))))))))|{||||{{{{||||{.{{{{,.,,,(((((((((({{,..,,{.{,..{|||}|...(((.((((((((......))))))))..))).....((((((.......))))))...{{{{,.,(({{{{.{{{{{{|||,{(((.{{........)).}}))}))}{{({{,..,{{{,,,|||||..,,....}},}}}}}}.,)))))))))){||||..,.))))).{({{,..{((|||||{{{||.(((({{,.{{{.{({(...,)))}}},,{||,,,.))))))))}))))..,,)))))))))}})))))))})))},)),...................
Back