Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_213720.3
Sequence Length
700 nt
GC Content
0.6700
CUUUUUUGCGCCGGCUGUGACAAGCGCUGCGGCAUUUGUCCCCGCGACAGCACCGCUGCCGCCGUCUCUAAGGUCGCCCGGGUCCCACCGCCGCCACCAUGCCUCGGGGAAGCCGCAGCGCGGCCUCCCGGCCAGCCAGCCGCCCAGCCGCGCCCUCUGCCCACCCGCCCGCGCACCCACCGCCCUCGGCAGCCGCCCCAGCCCCCGCCCCUUCGGGCCAGCCGGGGCUCAUGGCUCAGAUGGCGACCACGGCCGCAGGGGUAGCCGUGGGCUCGGCUGUGGGACACGUCAUGGGCAGCGCCCUGACCGGAGCCUUCAGCGGGGGGAGCUCGGAGCCCUCCCAGCCUGCUGUCCAGCAGGCCCCCACCCCCGCUGCCCCCCAGCCCCUGCAGAUGGGGCCCUGCGCCUACGAGAUCAGGCAGUUCCUGGACUGUUCCACCACUCAGAGUGACCUGUCCCUGUGUGAGGGCUUCAGCGAGGCCCUGAAGCAGUGCAAGUACUACCAUGGUCUGAGCUCCCUGCCCUGAAGAGGUCGGUGCAGACUCGGGGGCCAGUCCUGCACCCACCUCUACCCCUCGCCGACAGCCAGACCACAACACCAGAUUGUACCCAGAUAGCUGGGAUUGGAAGUGAGGAGGUUUCUCACCCCACAGAUAACCCAAGACACAAAUGUGCAAUUAAAAGUUUAUUUUAGACCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-295.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -306.75
Frequency: 0.0000
Diversity: 147.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((......((((((((((.....((((((((.((((...)))).))).........(((.((.(((......)))..)).))).......))))).))))))))))((((....))))...))))))..((((((.((((.(.((..((((...((.((......((((.((.(.(((((((((.((....((((....))))..)).)))))....))))).)).))))......))))...)))).)).).)))).)))))).((((((.((((.((((...)))))))).(((((...(((((((((......(((....)))..(((((((....))))))).....))))))))).......(((((.......))))).....((((........)))).)))))((((....)))).((((...))))...))))))(((.(.((((((((...)))))))).).)))((((((.........(((((((.(((..(.((.....((((((.((((((((((.((...))))).))))))).)))))).......)).)..))))))))))..........))))))((((....))))...(((..(((((((...))))))).))).....................))))))..)))))................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{(,,((((((((((((.{....((((((((((.....((((((((.((((...)))).))).........(((.((.(((......)))..)).))).......))))).))))))))))((((....))))..,))))))..((((((.((((.(.((..{(((...{(,({......((((.((.{.(((((((((.((.,,.((((....)))}..)).)))))....))))}.)).)))).....,)}))}.,)))).)).).)))).)))))).((({{{.((((.((((,,,|}}}}}}}.{{,({...{{||((((((.({{.,,|}},})))}.(((((((....))))))).....},}})))))}}}....(((((.......)))))...,.((({........)))),}},,,{(({..,.}))}.{{{,...,)))}}.}}))}|(((.{.((((((((...)))))))).,.)))}{|||,.........(((((((.(((..(.((...{.((((((.((((((((((.((...)))))},)))))).)))))).......)).)..))))))))))..,.......}))),(((((....)))))..(((..(((((({...})))))).))}.....................))))))..}}}}|,,,....,,,,,....
Back