Basic Information

Symbol
CRADD
RNA class
mRNA
Alias
CARD And Death Domain Containing Adaptor Protein RAIDD CASP2 And RIPK1 Domain Containing Adaptor With Death Domain RIP-Associated ICH1/CED3-Homologous Protein With Death Domain Death Domain-Containing Protein CRADD RIP-Associated Protein With A Death Domain Caspase And RIP Adaptor With Death Domain Caspase And RIP Adapter With Death Domain Death Domain Containing Protein CRADD Death Adaptor Molecule RAIDD CRADD/LYZ Fusion MRT34
Location (GRCh38)
12:93677375-93894840
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003805.5
Sequence length
1189.0 nt
GC content
0.4794

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-403.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -426.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320099.2 NCBI
AUUUCCGAUCCGGGCCAAGGCUGGGUGGCUGCGGCAGUGCCGGAGGCCC… 1549 nt 0.5094
NM_001320100.2 NCBI
GCCAUUAACAAAGAUGGUGCUUAUGGGGCAGGUUCCCUAACAGUCAGGA… 1193 nt 0.5381
NM_001320101.3 NCBI
GCCAUUAACAAAGAUGGUGCUUAUGGGGCAGGUUCCCUAACAGUCAGGA… 635 nt 0.5150
NM_001330126.1 NCBI
GGAGAAAUGGAGGCCAGAGACAAACAAGUACUCCGCUCACUUCGCCUGG… 756 nt 0.5053
NM_003805.5 NCBI
GCCAUUAACAAAGAUGGUGCUUAUGGGGCAGGUUCCCUAACAGUCAGGA… 1189 nt 0.4794
Summary

This gene encodes a protein containing a death domain (DD) motif. This protein recruits caspase 2/ICH1 to the cell death signal transduction complex, which includes tumor necrosis factor receptor 1 (TNFR1A) and RIPK1/RIP kinase, and acts in promoting apoptosis. A mutation in this gene was associated with cognitive disability. A related pseudogene is found on chromosome 3. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

A study in human cadavers demonstrated that the CRADD was down-regulated (-17,328.3091 fold) in decaying liver tissues compared to a control, as part of the apoptotic thanatotranscriptome where mRNA remains stable for analysis up to 48 hours postmortem [Javan et al. DOI:10.1007/S12024-015-9704-6].