Basic Information

Symbol
ADGRE3
RNA class
mRNA
Alias
Adhesion G Protein-Coupled Receptor E3 EMR3 Egf-Like Module Containing, Mucin-Like, Hormone Receptor-Like 3 EGF-Like Module-Containing Mucin-Like Hormone Receptor-Like 3 EGF-Like Module Receptor 3 Egf-Like Module-Containing Mucin-Like Receptor 3
Location (GRCh38)
19:14599080-14690027
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032571.5
Sequence length
2349.0 nt
GC content
0.4717

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-709.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -754.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 606.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001289158.2 NCBI
AGGAAAGGUGGUUGGCUUACGGCACAGUAGAGAGCUUCCAGGGCUGGCU… 2193 nt 0.4774
NM_001289159.2 NCBI
AGGAAAGGUGGUUGGCUUACGGCACAGUAGAGAGCUUCCAGGGCUGGCU… 1971 nt 0.4825
NM_032571.5 NCBI
AGGAAAGGUGGUUGGCUUACGGCACAGUAGAGAGCUUCCAGGGCUGGCU… 2349 nt 0.4717
Summary

This gene encodes a member of the class B seven-span transmembrane (TM7) receptor family expressed predominantly by cells of the immune system. Family members are characterized by an extended extracellular region with a variable number of N-terminal epidermal growth factor (EGF)-like domains coupled to a TM7 domain via a mucin-like spacer domain. This gene is closely linked to the gene encoding egf-like molecule containing mucin-like hormone receptor 2 on chromosome 19. This protein may play a role in myeloid-myeloid interactions during immune and inflammatory responses. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jan 2014]

Forensic Context

A study in humans analyzing leukocyte gene expression profiles from severe burn patients identified the ADGRE3 as a top sustained increasing gene (SIG) with expression rising from the healthy state through the late recovery phase (>400 hours post-injury), classifying it as a biomarker for burn recovery [Xu et al. DOI:10.1159/000493451]. A separate human study on sepsis, utilizing transcriptome profiling of peripheral blood mononuclear cells, mentioned the ADGRE3 as a predictor of septic patients identified in previous research, though it was not directly studied in that experimental cohort [Wu et al. DOI:10.7150/ijms.46910].