Basic Information

Symbol
CSF3
RNA class
mRNA
Alias
Colony Stimulating Factor 3 Pluripoietin Lenograstim Filgrastim C17orf33 GCSF Granulocyte Colony-Stimulating Factor MGC45931 G-CSF Colony Stimulating Factor 3 (Granulocyte) Granulocyte Colony Stimulating Factor Granulocyte-Colony Stimulating Factor Chromosome 17 Open Reading Frame 33 CSF3OS
Location (GRCh38)
17:40015361-40017816
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_172219.3
Sequence length
1504.0 nt
GC content
0.5944

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-623.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -646.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 363.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000759.4 NCBI
AGCCCGGAGCCUGCAGCCCAGCCCCACCCAGACCCAUGGCUGGACCUGC… 1513 nt 0.5942
NM_001178147.2 NCBI
AGCCCGGAGCCUGCAGCCCAGCCCCACCCAGACCCAUGGCUGGACCUGC… 1396 nt 0.5874
NM_172219.3 NCBI
AGCCCGGAGCCUGCAGCCCAGCCCCACCCAGACCCAUGGCUGGACCUGC… 1504 nt 0.5944
NM_172220.3 NCBI
AGCCCGGAGCCUGCAGCCCAGCCCCACCCAGACCCAUGGCUGGACCUGC… 1405 nt 0.5872
Summary

This gene encodes a member of the IL-6 superfamily of cytokines. The encoded cytokine controls the production, differentiation, and function of granulocytes. Granulocytes are a type of white blood cell that are part of the innate immune response. A modified form of this protein is commonly administered to manage chemotherapy-induced neutropenia. Alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, May 2020]

Forensic Context

A study in Sprague-Dawley rats demonstrated that the CSF3 gene, identified as a differentially expressed mRNA in skeletal muscle contusion, was included in multiple index gene sets (A, C, and D) for wound age estimation [Ren et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2022.102722]. In human skin, research on thermal injuries found the CSF3 gene was significantly up-regulated in burned tissue compared to normal skin, as part of an extensive inflammatory and immune response during wound repair [Greco et al. DOI:10.1016/j.burns.2009.06.211]. A study in human burn patients demonstrated that circulating concentrations of the CSF3 were significantly increased immediately (0-3 days) postburn compared to controls, then subsequently dropped [Knuth et al. DOI:10.1097/SLA.0000000000005880].