Basic Information

Symbol
CYSLTR2
RNA class
mRNA
Alias
Cysteinyl Leukotriene Receptor 2 CYSLT2R G-Protein Coupled Receptor GPCR21 G-Protein Coupled Receptor HG57 CysLT(2) HGPCR21 CYSLT2 HPN321 Cysteinyl Leukotriene CysLT2 Receptor PSEC0146 KPG_011 CysLTR2 GPCR21 HG57
Location (GRCh38)
13:48653709-48711227
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001308476.3
Sequence length
4763.0 nt
GC content
0.4126

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1328.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1421.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1120.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001308465.3 NCBI
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4892 nt 0.4137
NM_001308467.3 NCBI
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4869 nt 0.4134
NM_001308468.3 NCBI
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4690 nt 0.4134
NM_001308469.3 NCBI
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4667 nt 0.4131
NM_001308470.3 NCBI
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4600 nt 0.4135
NM_001308471.3 NCBI
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4499 nt 0.4119
NM_001308476.3 NCBI
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4763 nt 0.4126
NM_001387012.1 NCBI
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4639 nt 0.4106
NM_001387013.1 NCBI
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4673 nt 0.4126
NM_001387014.1 NCBI
GAAAUGAGCAACCUGAAUUACUCGGAGGAGAAAGGCAGGAGAGAUAGAG… 4796 nt 0.4143
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

The cysteinyl leukotrienes LTC4, LTD4, and LTE4 are important mediators of human bronchial asthma. Pharmacologic studies have determined that cysteinyl leukotrienes activate at least 2 receptors, the protein encoded by this gene and CYSLTR1. This encoded receptor is a member of the superfamily of G protein-coupled receptors. It seems to play a major role in endocrine and cardiovascular systems. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for CYSLTR2 Gene

Forensic Context

A study in rats demonstrated that ultraviolet-B irradiation induced transcriptional changes in the L4 and L5 dorsal root ganglia, where the CYSLTR2 was significantly up-regulated with a fold change of 1.8 [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].