Basic Information

Symbol
ECSIT
RNA class
mRNA
Alias
ECSIT Signaling Integrator SITPEC Evolutionarily Conserved Signaling Intermediate In Toll Pathway, Mitochondrial ECSIT Signalling Integrator Likely Ortholog Of Mouse Signaling Intermediate In Toll Pathway Evolutionarily Conserved Signaling Intermediate In Toll Pathway Evolutionarily Conserved Ortholog (Mouse) ECSIT Homolog (Drosophila) Protein SITPEC ECSIT Homolog
Location (GRCh38)
19:11505927-11530564
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016581.5
Sequence length
1647.0 nt
GC content
0.6187

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-695.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -723.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 395.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142464.3 NCBI
CUCUGGGCCAAUAUGGCAGCGCCCAGCAACAAGACAGAGCUGGCCUGGA… 1498 nt 0.6182
NM_001142465.3 NCBI
CUCUGGGCCAAUAUGGCAGCGCCCAGCAACAAGACAGAGCUGGCCUGGA… 1005 nt 0.6219
NM_001243204.2 NCBI
UUUUGCAGAUGACCUCGCGAGAGGUCACGCCGCAAGUCGGCAACCGGGC… 1574 nt 0.6137
NM_016581.5 NCBI
CUCUGGGCCAAUAUGGCAGCGCCCAGCAACAAGACAGAGCUGGCCUGGA… 1647 nt 0.6187
Summary

Enables molecular adaptor activity. Involved in regulation of oxidoreductase activity; regulation of protein complex stability; and toll-like receptor 4 signaling pathway. Located in cytosol; mitochondrion; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ECSIT was down-regulated at 3 days post-injury in skeletal muscle following a local hind limb burn, but its expression was not altered in response to a distant dorsum burn [Padfield et al. DOI:10.01.ta.0000230567.56797.6c].