Basic Information

Symbol
AGTR1
RNA class
mRNA
Alias
Angiotensin II Receptor Type 1 AT2R1 AGTR1A AT2R1B AGTR1B HAT1R AG2S AT1B ATR1 AT1 Type-1 Angiotensin II Receptor AT1 Receptor AT2R1A AT1AR AT1BR Type-1B Angiotensin II Receptor Angiotensin II Type 1 Receptor Angiotensin II Type-1 Receptor Angiotensin Receptor 1B AT1R
Location (GRCh38)
3:148697784-148743045
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000685.5
Sequence length
2324.0 nt
GC content
0.4127

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-630.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -678.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 531.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000685.5 NCBI
AUUCCAGCGCCUGACAGCCAGGACCCCAGGCAGCAGCGAGUGACAGGAC… 2324 nt 0.4127
NM_001382736.1 NCBI
AUUCCAGCGCCUGACAGCCAGGACCCCAGGCAGCAGCGAGUGACAGGAC… 2262 nt 0.4169
NM_001382737.1 NCBI
AUUCCAGCGCCUGACAGCCAGGACCCCAGGCAGCAGCGAGUGACAGGAC… 2346 nt 0.4160
NM_004835.5 NCBI
AUUCCAGCGCCUGACAGCCAGGACCCCAGGCAGCAGCGAGUGACAGGAC… 2298 nt 0.4143
NM_009585.4 NCBI
AUUCCAGCGCCUGACAGCCAGGACCCCAGGCAGCAGCGAGUGACAGGAC… 2240 nt 0.4134
NM_031850.4 NCBI
AUUCCAGCGCCUGACAGCCAGGACCCCAGGCAGCAGCGAGUGACAGGAC… 2382 nt 0.4135
NM_032049.4 NCBI
AUUCCAGCGCCUGACAGCCAGGACCCCAGGCAGCAGCGAGUGACAGGAC… 2455 nt 0.4240
Summary

Angiotensin II is a potent vasopressor hormone and a primary regulator of aldosterone secretion. It is an important effector controlling blood pressure and volume in the cardiovascular system. It acts through at least two types of receptors. This gene encodes the type 1 receptor which is thought to mediate the major cardiovascular effects of angiotensin II. This gene may play a role in the generation of reperfusion arrhythmias following restoration of blood flow to ischemic or infarcted myocardium. It was previously thought that a related gene, denoted as AGTR1B , existed; however, it is now believed that there is only one type 1 receptor gene in humans. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2020]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that perinatal glyphosate exposure (PGE) induced differential expression of 1759 lncRNAs and 759 mRNAs in the hippocampus, with the mRNA Agtr1b identified as a differentially expressed transcript involved in cellular response to hormone stimulus and neuroactive ligand-receptor interaction pathways [Fan et al. DOI:10.1002/jdn.10102].