Basic Information

Symbol
ELP6
RNA class
mRNA
Alias
Elongator Acetyltransferase Complex Subunit 6 C3orf75 TMEM103 Angiotonin-Transactivated Protein 1 Elongator Complex Protein 6 Transmembrane Protein 103 FLJ20211 Elongator Complex Protein 6 Homolog Chromosome 3 Open Reading Frame 75 UPF0405 Protein C3orf75 Protein TMEM103 ATP1
Location (GRCh38)
3:47495640-47513712
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001031703.3
Sequence length
1352.0 nt
GC content
0.5451

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-521.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -542.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 470.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001424229.1 NCBI
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGU… 1055 nt 0.5507
NM_001424230.1 NCBI
GUAGUCCGCAGAGGAUCGACCCGGGGAUUGGACUGGAGGCUUGGGCCCG… 1121 nt 0.5343
NM_001424231.1 NCBI
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGU… 1003 nt 0.5334
Showing 21 to 23 of 23 entries
Summary

Predicted to be involved in positive regulation of cell migration. Predicted to act upstream of or within several processes, including autophagosome maturation; gene expression; and homeostasis of number of retina cells. Located in cytosol and nucleus. Part of elongator holoenzyme complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ELP6 mRNA exhibited differential binding to the RNA-binding protein hnRNP H1 and changes in gene expression in the striatum in response to methamphetamine administration [Ruan et al. DOI:10.1016/J.Pnpbp.2025.111598].