Basic Information

Symbol
ERG
RNA class
mRNA
Alias
ETS Transcription Factor ERG Erg-3 P55 Transcriptional Regulator ERG (Transforming Protein ERG) V-Ets Avian Erythroblastosis Virus E26 Oncogene Related V-Ets Avian Erythroblastosis Virus E26 Oncogene Homolog V-Ets Erythroblastosis Virus E26 Oncogene Like Transcriptional Regulator ERG V-Ets Erythroblastosis Virus E26 Oncogene Homolog TMPRSS2-ERG Prostate Cancer Specific ERG, ETS Transcription Factor Transforming Protein ERG FUS/ERG Fusion Protein TMPRSS2/ERG Fusion ETS-Related Gene Ets-Related LMPHM14
Location (GRCh38)
21:38380027-38661780
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_182918.4
Sequence length
4904.0 nt
GC content
0.4558

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1419.05 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1510.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1127.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001136154.1 NCBI
GUUUUCACUUGGUCGGAAUGGGGAGAGUGUGCAAGAGAUCGCUGCGGGA… 5114 nt 0.4630
NM_001136155.1 NCBI
UUCAUUUCCCAGACUUAGCACAAUCUCAUCCGCUCUAAACAACCUCAUC… 4727 nt 0.4504
NM_001243428.1 NCBI
GCUGAGCCCGUCGGCGCCGAGGGAGUUAGUGCGACCCGGCUCGGCGCGC… 5139 nt 0.4678
NM_001243429.1 NCBI
GUUAUUCCAGGAUCUUUGGAGACCCGAGGAAAGCCGUGUUGACCAAAAG… 4703 nt 0.4555
NM_001243432.2 NCBI
GUUUUCACUUGGUCGGAAUGGGGAGAGUGUGCAAGAGAUCGCUGCGGGA… 1606 nt 0.5087
NM_001291391.1 NCBI
GUUUUCACUUGGUCGGAAUGGGGAGAGUGUGCAAGAGAUCGCUGCGGGA… 1546 nt 0.4968
NM_001331025.2 NCBI
AUCCGCUCUAAACAACCUCAUCAAAACUACUUUCUGGUCAGAGAGAAGC… 4832 nt 0.4563
NM_004449.4 NCBI
GUUUUCACUUGGUCGGAAUGGGGAGAGUGUGCAAGAGAUCGCUGCGGGA… 5042 nt 0.4637
NM_182918.4 NCBI
AUCCGCUCUAAACAACCUCAUCAAAACUACUUUCUGGUCAGAGAGAAGC… 4904 nt 0.4558
Summary

This gene encodes a member of the erythroblast transformation-specific (ETS) family of transcriptions factors. All members of this family are key regulators of embryonic development, cell proliferation, differentiation, angiogenesis, inflammation, and apoptosis. The protein encoded by this gene is mainly expressed in the nucleus. It contains an ETS DNA-binding domain and a PNT (pointed) domain which is implicated in the self-association of chimeric oncoproteins. This protein is required for platelet adhesion to the subendothelium, inducing vascular cell remodeling. It also regulates hematopoesis, and the differentiation and maturation of megakaryocytic cells. This gene is involved in chromosomal translocations, resulting in different fusion gene products, such as TMPSSR2-ERG and NDRG1-ERG in prostate cancer, EWS-ERG in Ewing's sarcoma and FUS-ERG in acute myeloid leukemia. More than two dozens of transcript variants generated from combinatorial usage of three alternative promoters and multiple alternative splicing events have been reported, but the full-length nature of many of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Apr 2014] CIViC Summary for ERG Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.