Basic Information

Symbol
ESR2
RNA class
mRNA
Alias
Estrogen Receptor 2 ER-Beta NR3A2 Nuclear Receptor Subfamily 3 Group A Member 2 Estrogen Receptor Beta Erb Oestrogen Receptor Beta ESTRB Estrogen Receptor 2 (ER Beta) Estrogen Receptor Beta 2 Estrogen Receptor Beta 4 ESR-BETA ER Beta ESRB ODG8
Location (GRCh38)
14:64084232-64338112
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001437.3
Sequence length
6842.0 nt
GC content
0.4722

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2384.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2506.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1839.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001040275.1 NCBI
CUCGGUCUUUAAAAGGAAGAAGGGGCUUAUCGUUAAGUCGCUUGUGAUC… 2470 nt 0.5146
NM_001214902.1 NCBI
CCAUUAUACUUGCCCACGAAUCUUUGAGAACAUUAUAAUGACCUUUGUG… 2407 nt 0.4848
NM_001271876.1 NCBI
CCAUUAUACUUGCCCACGAAUCUUUGAGAACAUUAUAAUGACCUUUGUG… 1724 nt 0.5035
NM_001271877.1 NCBI
CCAUUAUACUUGCCCACGAAUCUUUGAGAACAUUAUAAUGACCUUUGUG… 1518 nt 0.5382
NM_001291712.2 NCBI
GUUUCGCGGGUUCGGGCGGCGAGUCUCCCGGAUGCUCCUCAGCUCUGGG… 4105 nt 0.5138
NM_001291723.1 NCBI
GUGUGAGGGCGCCCGGCUUCCAGGCAGUAAUGGGCGGGUCCCUGCGCGG… 2745 nt 0.5268
NM_001437.3 NCBI
GCUUGUGAUCUUUUCAGUUUCUCCAGCUGCUGGCUUUUUGGACACCCAC… 6842 nt 0.4722
Summary

This gene encodes a member of the family of estrogen receptors and superfamily of nuclear receptor transcription factors. The gene product contains an N-terminal DNA binding domain and C-terminal ligand binding domain and is localized to the nucleus, cytoplasm, and mitochondria. Upon binding to 17beta-estradiol or related ligands, the encoded protein forms homo- or hetero-dimers that interact with specific DNA sequences to activate transcription. Some isoforms dominantly inhibit the activity of other estrogen receptor family members. Several alternatively spliced transcript variants of this gene have been described, but the full-length nature of some of these variants has not been fully characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for ESR2 Gene

Forensic Context

A study in C57BL/6J mice demonstrated that gastrulation-stage alcohol exposure induced craniofacial malformations at similar rates and severity in both sexes, though growth deficits were more prevalent in females [Boschen et al. DOI:10.1002/Bdr2.2292].