Basic Information
Symbol
ETNPPL
RNA class
mRNA
Alias
Ethanolamine-Phosphate Phospho-Lyase
AGXT2L1
Alanine--Glyoxylate Aminotransferase 2-Like 1
Alanine-Glyoxylate Aminotransferase 2-Like 1
EC 2.6.1.11
EC 2.6.1.44
EC 4.2.3.2
EC 2.6.1
Location (GRCh38)
4:108741969-108763228
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
Cause of death analysis
MANE select
Transcript ID
NM_031279.4
Sequence length
2086.0 nt
GC content
0.4343
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-586.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-626.19 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
449.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| ACGCCACCGGUGACCUCCGACGCCCCGGGCAAGAGAACGCCAGGAGGGA… | 2068 nt | 0.4328 | |
| ACGCCACCGGUGACCUCCGACGCCCCGGGCAAGAGAACGCCAGGAGGGA… | 1989 nt | 0.4354 | |
| ACGCCACCGGUGACCUCCGACGCCCCGGGCAAGAGAACGCCAGGAGGGA… | 2736 nt | 0.4616 | |
| ACGCCACCGGUGACCUCCGACGCCCCGGGCAAGAGAACGCCAGGAGGGA… | 2108 nt | 0.4369 | |
| ACGCCACCGGUGACCUCCGACGCCCCGGGCAAGAGAACGCCAGGAGGGA… | 1967 nt | 0.4326 | |
| ACGCCACCGGUGACCUCCGACGCCCCGGGCAAGAGAACGCCAGGAGGGA… | 2086 nt | 0.4343 |
Summary
Enables ethanolamine-phosphate phospho-lyase activity. Predicted to act upstream of or within several processes, including cellular response to glucocorticoid stimulus; ceramide phosphoethanolamine catabolic process; and phospholipid transfer to membrane. Predicted to be located in mitochondrial matrix. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
A study in humans analyzing heart tissue samples from patients with various structural heart diseases identified the ETNPPL as a differentially expressed gene within a 62-gene signature, where it was significantly down-regulated in diseased samples compared to controls with a mean fold change of 0.5824 and an adjusted p-value of 5.0566 × 10^-12 [Fajarda et al. DOI:10.1186/s13040-020-00217-8]. This signature, derived from merged microarray datasets and selected via random forest classification, achieved a mean accuracy of approximately 94.92% in distinguishing diseased from non-diseased cardiac samples. A study in mice demonstrated that the ETNPPL mRNA was significantly upregulated in ante-mortem burned skin compared to control tissue [Liu et al. DOI:10.1007/s12024-022-00474-5].