Basic Information

Symbol
EXTL2
RNA class
mRNA
Alias
Exostosin Like Glycosyltransferase 2 Glucuronyl-Galactosyl-Proteoglycan 4-Alpha-N-Acetylglucosaminyltransferase Alpha-1,4-N-Acetylhexosaminyltransferase EXTL2 Exostoses (Multiple)-Like 2 EXT-Related Protein 2 Alpha-GalNAcT EXTL2 Exostosin-Like 2 EXTR2 Alpha-1,4-N-Acteylhexosaminyltransferase Processed Exostosin-Like 2 EC 2.4.1.223
Location (GRCh38)
1:100872372-100896000
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001033025.3
Sequence length
2825.0 nt
GC content
0.3809

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-716.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -774.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 676.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001033025.3 NCBI
ACUCGGGGACUGUCCCUUGCUCCAGGCGCUCACUUUGCGGGCGGCACUU… 2825 nt 0.3809
NM_001261440.2 NCBI
ACUCGGGGACUGUCCCUUGCUCCAGGCGCUCACUUUGCGGGCGGCACUU… 2822 nt 0.3806
NM_001261441.2 NCBI
ACUCGGGGACUGUCCCUUGCUCCAGGCGCUCACUUUGCGGGCGGCACUU… 2849 nt 0.3819
NM_001261442.2 NCBI
ACUCGGGGACUGUCCCUUGCUCCAGGCGCUCACUUUGCGGGCGGCACUU… 2790 nt 0.3767
NM_001439.4 NCBI
ACUCGGGGACUGUCCCUUGCUCCAGGCGCUCACUUUGCGGGCGGCACUU… 2861 nt 0.3789
Summary

Enables alpha-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase activity and glucuronyl-galactosyl-proteoglycan 4-alpha-N-acetylglucosaminyltransferase activity. Involved in N-acetylglucosamine metabolic process and UDP-N-acetylgalactosamine metabolic process. Located in cytosol; endoplasmic reticulum; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans using combined proteomics and RNA sequencing on serum from sepsis patients and healthy controls identified the EXTL2 as a differentially expressed protein with no corresponding change in its mRNA, classifying it in quadrants 4 or 6 of a nine-quadrant analysis [Wang et al. DOI:10.2147/IDR.S380137].