Basic Information

Symbol
FARP2
RNA class
mRNA
Alias
FERM, ARH/RhoGEF And Pleckstrin Domain Protein 2 PLEKHC3 FIR KIAA0793 FRG FERM, ARHGEF And Pleckstrin Domain-Containing Protein 2 FERM, RhoGEF And Pleckstrin Domain-Containing Protein 2 Pleckstrin Homology Domain-Containing Family C Member 3 FERM, RhoGEF And Pleckstrin Domain Protein 2 PH Domain-Containing Family C Member 3 FERM Domain Including RhoGEF FERM Domain-Including RhoGEF FGD1-Related Cdc42-GEF
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_014808.4
Sequence length
4009.0 nt
GC content
0.5503

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1470.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1540.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 856.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((..(.(((((((....))).)))).)..)))))).)))))..(((((..((((..((((((((.((((((..(((.(........).)))..))))..((((((((...))))))))(((((.....((((((.((((.(((((((((((((...)))))))..((.(..((((((...((((((...))).))).))))))..).))((((((((......))))))))..((((.(........))))).(((..(((..((.((((((....((((((((......(((...(((((((.....(((...(((((((.(((((..(((....)))..))....)))))))))).(((.((....)))))..(((((.((((((......((((.((..........)).)))).....))))))))))).((((((((((((...(..((.....((.(((((((((.(((((........((((((...(((((....)))))......))))))...(((((...)))))((((...)))).....(((((..((((((....((((.........)))).......))))))..).)))).((((..((((((((..........))))))))...))))....)))))..))).)))))).))...))..)..))))))))))))(((.(((((.(((((((.((................((((((((.((((...(((....)))((((((((.((((((((.(..((((......)))).).))))))))...)))).))))......))))))))))))..((((((((.((..(((((....(((((...(((.((((((((.((((.(...(((((((((((.(((((.............(((((..(((((((((.((((...((....((((....(((.....)))...))))....)).)))).)))))))))))))).............))))).)))......((((((............(((((((((...(((((......))))).)))))))))(((((((.(........)))))))).......)))))).((((((.(((((((.(((............))).))(((.((......))))).((.....)).......(((((((.......)))))))......(((((((.((((.((((.....((..(((((((((((...((((..............(((..(((((.((((...)))).))))).)))((((((((...(((((((((...(((((((....(((((.(((....((((((((.((....))...))))))))....))).)).))).(((((.((.(((.(((((.((((((((((((((.(((..((((((..(((((((.(..((((.((..((((((((((..............(((((........)))))....)).)))))))))).))))))))))))...((((.((.....))))))........(((.((((.((..((((((..((.......)).)))))).)))))).))).)))))).((((((((((..........)))))))))).)))..))))).))).)))))).))..)))))).)))))))..........(((((((((((((.(((.(....(((((..((((...(((....(((........)))......)))...))))..))))).....)))).))....(((((.(((.(((((........)))))))))))))....(((((((..(((.(((......(((.(((...))).)))..((((.((((((((.(((..((........))..)))..))).)))))))))((((........))))......)))))))))))))......((((.....))))..))))..)))))))(((((..((((.(((..(((((........)).).))..))).)))).....))))).))))))).......))))).))))....))))))))))))...))))))))))).))....))))))))...))))).)).....))))).))))))(((((.((((...((((((((((.(((...(((.(((((((((....)))).............((((..((((.....((.....))))))..))))....((((.....(((((((...............))).)))).....))))((....))))))).)))...))))).))))))))...)))))))))...(((...)))..))).)))))..).)))).)))))))).)))))))).......((((........))))(((.(((((((((....)))))))))..))).....(((((.......))))).(((((.((........)).))))).)))))..))...)))))))).)))))))))))))).))).(((..((((.((((.((((......))))..))))))))..))).))))))))))....)))))))))))....))))))))..))).))).........(((((((.(((.......))))).)))))....((((....))))(((((.(((((((..((.(((((((.(((((((((((((...((.((((.((((....((.....))....))))(((((...(((....)))..)))))))))))...))).(((((((((.(.((.(((...(..((((((((.(((.((.......))))).)))).))))..).))))).).))))))).))..)))))))).(((((...((((...(((.(((.....)))..)))...))))....)))))...)))))))))..))...)))))))..)))))...)))))).)))))))))).....))))).((.....)).))))))))))..(((((((..((((((((...((.((.((..((((..(((.(((.....((..(((.......((((...(..((((((((((......................)))))).))))..)...)))).......)))..))..)))..))).)))))))))))))))))))))))))))))...(((...))).((((((((((..(((((((.(((((((((.((((((((.((((..((..(........)..))..)))).)).(((((.....................(((((((..((((...)))))))))))..(((((((...(((((((..(((((((((((.(((((((.((((((((.((((.....)))).)))))).............(((((.((((........)))).))))))).)))))).).)))).)))))))((((((((((((((....((((...(.((((((((......)))))))))))))..)))))))..((((((......((((((.((.(((((...((((((((((......((.(((...(((.((((.(((((((.(((......))))))))))...)))).)))..)))))..)))..)))))))......))))).)).........)))))).......)))))).............((((((((...))))))))......((((.(((....))).))))..))))))).(((((((...))))))).......(((((((.((((....)))).))))))).)))))....))...)))))))..)))))...))))))))).)))))))))))))))))))))))..........((((((...(((((......))))).....)))))).(((.((((((......................)))))))))..)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((((((..(.(((((((....))).)))).}..)))))).))))){,{{{(({,{{((..({((({((.{(((((..(((.(........).)))..)))),{((((((((...))))))))|,{((,,,{,({({{((((((.{((({{{((((({...})))))|.,{{{(((((({((,,.{{((((...}}}.|||.||}|||,,|,}}((((((((....,,})))))))..,||..{,,..,{,,||}|{,({(.,{{{...{,((((((....((((((((......(({...(((((((.....({({{{({((({,....|||.,((..{{|||{{||{{{{{..,}},}}}.|||}||{{{{|||||{.(((((.((((((......{{(((((....)))}}.}}..,,,.....))))))))))).{(((((((((((...(..((.....((.(((((((((.(((((.{{....{(((((,...(((((....))))).....,))))}},..{{{{(...}}))}{(((...)))}.....(((((..((((((,...((({,.......,}))).....,.))))))..}}}))).((((..((((((((..........))))))))...))))...,)))))..))),)))))).))...))..)..)))))))))))}(((.(((((.(((((((,(,.,..............((((((((.(((({,.(((....)))((((((((.((((((((.(..((((......)))).).))))))))...)))).))))....}.))))))))))))..((((((((.((..(((((....(((((...(((.((((((((.((((.(...(((((((((((.(((((.............(((((..(((((((((.,,,,...,,....(((({,..{,|,,}},,},.,,||||.....)})))).)))))))))))))).............))))).)))......((((((............(((((((((...(((((......))))).)))))))))(((((((.{........}))))))).......)))))).((((((.((((({{.(((............))).)},{(.,(,,,...}},},.|....,,)).......(((((((.......))))))).,|..{({{((((.(((,,((((.....{,,.(((((((((((...((((..............(((..(((((.((((...)))).))))).)))((((((((.,.(((((((((...(((((((.,..(((((.(((.,..((((((((.((....))...))))))))....))).}).}}|.((({,{((.(((,((({{.(({{{({{{((({{.{{{..{{{(((,.{{{{{({,{.,{(((.((..((((((((((...(,.......,,(((((.,......))))}....)).)))))))))).)))}||||||||...{{{(,({.,.,,||||||{,..,,..(({,((((.((..{((({{.,,{.{{,,.||,.|}}})).))}}}}.))).)))))},((((((((((..........)))))))))).})),,))))).))).))))))})},|}}}})).)}))})).,,,......((((((((((({(,{((.{|...(((((..((((...(((.,..(((........)))..,...)))...))))..))))).....}),),}}||..(((((.(((.(((((........)))))))))))))....{(((({||{(((,||{......{{{.{{{..,}}}.,}).,{{((.{{{{((((|{{(||,{......}.)),}))),,))},)))))))))((((........))))......,})))}))))))}..,...|||{|,..,)))),,})))..)}))))|(((((..((((.(((..((,,{.,,,....)).,.))..))).)))).....))))))))))))).......))))).)))).,..))))))))))))...))))))))))).)}.,..))))))))...)))))}),.....))))).))))))(((((.((((.,.((((((((((.(((...(((.(((({((((....))))......{{{{{..((((..((((.....{{.....))))))..)))),|...,...,,,..,,{(({.......,.,....,,.,...,,.....))))).......,)))).)))...))))).))))))))...)))))))))...(((...)))..))).)))))..).)))).)))))))).)))))))).......((((........))))(((.(((((((((....)))))))))..))).....(((((.......))))).(((((.((........)).))))),)))))..))...))))))))})})))))))))))).))).,,,..{{,,.,,||}||||}}..,}))))}}))),}}})}}))}.,}})))))))....})}))))))))....)))))}{{{{|||.|,|....,{,,{((((((,.(((..,,,,,|}}||.,}}}}.}},((({....))))(((((.(((((((..((.(((((({{(((((((((((((...((.(((({((((..,,{,...,.))...,))}}(((((...(((....)))..)))))))))})...))},(((((((((.(.((.(((...(..((((((((.((,,{{.......)}))).)))).))))..|.))))).).))))))).))..)))))))).(((((...((((...(((.(((,...,)))..)))...))))....)))))...)))))))))..))...)))))))..)))))...,}}}}},|||}}}}}}),,...)}}},.,{,..,.,,.},}})))|||,,(((((((..(((({({{...|{.{{.||..{{{{.|(({,{{{...,,(({.{{{.......||||,.,|..{|{{{|||||,..,,,..,,,,,,,,,,,,,,}))))),)}))..}...}}}),,,....))).,))..))),.})),))))))})))}})))))}})))})))))),,,|||.,.})).((((((((((..(((((((.((((((,((.(((((((({({{({{(,.,(,{......,.}))..)))}})}.{{{{((....}},,,...........((((({,,(((((...)))))))))))..(((((((..(((((((((.(((((((((((.{((((((.{{((((((.((((.....)))).)))))).............(((((.((((........)))).))))))}.)))))).,.)))},))))))}{{(((({(((((((....((((.,.,.((((((((......)))))))))))))..)))))))))||((((......((((((.((.(((((...((((((({{{.,,...((.(({..,(((.((((.(((((({{(((......))))))))))...)))).))).,)))))..))),.)))))))......))))).)).........)))))).......)))))}......,,,}...((((((((...))))))))....))))))))){{{,.{{.{(.((((((((...)))}}))))}},.,))))}}.....{((((((.((((....)))).))))))).,,,.}}.,,}|...)))))))....,}}...}))))))),.)))))))))))))))))))))))..........{(((((...(((((......}))))}....)))))}.|{(,({((({,.......,,|,........,.}})))},}),})))))}).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUUGGGAGCAGGCGACGCCGACGCGAGUCUGGCGGCUGCUGCUUGCGA… 2590 nt 0.5243
AGUUGGGAGCAGGCGACGCCGACGCGAGUCUGGCGGCUGCUGCUUGCGA… 2376 nt 0.5244
AGUUGGGAGCAGGCGACGCCGACGCGAGUCUGGCGGCUGCUGCUUGCGA… 4009 nt 0.5503
Summary

Enables guanyl-nucleotide exchange factor activity. Acts upstream of or within Rac protein signal transduction and neuron remodeling. Located in cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly upregulated the FARP2 in cortical astrocytes, identifying it as a key component of the altered adherens junction pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].