Basic Information

Symbol
ACADM
RNA class
mRNA
Alias
Acyl-CoA Dehydrogenase Medium Chain MCADH MCAD ACAD1 Medium-Chain Specific Acyl-CoA Dehydrogenase, Mitochondrial Acyl-Coenzyme A Dehydrogenase, C-4 To C-12 Straight Chain Medium-Chain Acyl-CoA Dehydrogenase Acyl-CoA Dehydrogenase, C-4 To C-12 Straight Chain Medium Chain Acyl-CoA Dehydrogenase Testicular Tissue Protein Li 7 EC 1.3.99.3 EC 1.3.8.7 EC 1.3.99
Location (GRCh38)
1:75724431-75787575
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000016.6
Sequence length
2261.0 nt
GC content
0.3591

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-556.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -605.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 628.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000016.6 NCBI
AGAGGAGUCCCGCGUUCGGGGAGUAUGUCAAGGCCGUGACCCGUGUAUU… 2261 nt 0.3591
NM_001127328.3 NCBI
AGAGGAGUCCCGCGUUCGGGGAGUAUGUCAAGGCCGUGACCCGUGUAUU… 2273 nt 0.3590
NM_001286042.2 NCBI
AGAGGAGUCCCGCGUUCGGGGAGUAUGUCAAGGCCGUGACCCGUGUAUU… 2173 nt 0.3576
NM_001286043.2 NCBI
AGAGGAGUCCCGCGUUCGGGGAGUAUGUCAAGGCCGUGACCCGUGUAUU… 2360 nt 0.3619
NM_001286044.2 NCBI
AGAGGAGUCCCGCGUUCGGGGAGUAUGUCAAGGCCGUGACCCGUGUAUU… 1991 nt 0.3546
Summary

This gene encodes the medium-chain specific (C4 to C12 straight chain) acyl-Coenzyme A dehydrogenase. The homotetramer enzyme catalyzes the initial step of the mitochondrial fatty acid beta-oxidation pathway. Defects in this gene cause medium-chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency, a disease characterized by hepatic dysfunction, fasting hypoglycemia, and encephalopathy, which can result in infantile death. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ACADM was under-expressed in liver tissue following internal exposure to α-particles from boron neutron capture irradiation of Kupffer cells, endothelial cells, and also following neutron and γ-ray exposures [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].