Basic Information

Symbol
ATG12
RNA class
mRNA
Alias
Autophagy Related 12 APG12 APG12L Ubiquitin-Like Protein ATG12 APG12 Autophagy 12-Like ATG12 Autophagy Related 12 Homolog (S. Cerevisiae) Apg12 (Autophagy 12, S. Cerevisiae)-Like APG12 Autophagy 12-Like (S. Cerevisiae) ATG12 Autophagy Related 12 Homolog Apg12 (Autophagy, Yeast) Homolog Autophagy-Related Protein 12 APG12-Like HAPG12 FBR93
Location (GRCh38)
5:115828200-115841837
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004707.4
Sequence length
4040.0 nt
GC content
0.3609

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1083.62 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1159.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1089.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001277783.2 NCBI
GUCUCCAAGCAAGAUGGCGGAGGAGCCGCAGUCUGUGUUGCAGCUUCCU… 3903 nt 0.3590
NM_004707.4 NCBI
GUCUCCAAGCAAGAUGGCGGAGGAGCCGCAGUCUGUGUUGCAGCUUCCU… 4040 nt 0.3609
Summary

Autophagy is a process of bulk protein degradation in which cytoplasmic components, including organelles, are enclosed in double-membrane structures called autophagosomes and delivered to lysosomes or vacuoles for degradation. ATG12 is the human homolog of a yeast protein involved in autophagy (Mizushima et al., 1998 [PubMed 9852036]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulated the ATG12 in microglia, implicating it within the autophagy pathway as part of the profound transcriptomic changes contributing to glial cell dysfunction and neurotoxicity [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].