Basic Information

Symbol
AURKA
RNA class
mRNA
Alias
Aurora Kinase A BTAK ARK1 AIK PPP1R47 STK15 AurA STK7 STK6 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 47 Serine/Threonine-Protein Kinase Aurora-A Serine/Threonine-Protein Kinase 6 Breast Tumor-Amplified Kinase Aurora/IPL1-Related Kinase 1 Aurora 2 Serine/Threonine-Protein Kinase Ayk1 Serine/Threonine Protein Kinase 15 Serine/Threonine-Protein Kinase 15 Ipl1- And Aurora-Related Kinase 1 Serine/Threonine Kinase 15 Serine/Threonine Kinase 6 Aurora/IPL1-Like Kinase Aurora-Related Kinase 1 Aurora-A Kinase EC 2.7.11.1 AIRK1 ARK-1 AURA AYK1 IAK1
Location (GRCh38)
20:56369382-56392566
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_198437.3
Sequence length
2033.0 nt
GC content
0.4442

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-575.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -613.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 710.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001323303.2 NCBI
GAAUUCUAACGGCUGAGCUCUUGGAAGACUUGGGUCCUUGGGUCGCAGG… 2368 nt 0.4704
NM_001323304.2 NCBI
GAAUUCUAACGGCUGAGCUCUUGGAAGACUUGGGUCCUUGGGUCGCAGG… 2131 nt 0.4486
NM_001323305.2 NCBI
GAAUUCUAACGGCUGAGCUCUUGGAAGACUUGGGUCCUUGGGUCGCAGG… 2241 nt 0.4552
NM_001424417.1 NCBI
GAAUUCUAACGGCUGAGCUCUUGGAAGACUUGGGUCCUUGGGUCGCAGG… 2410 nt 0.4697
NM_001424418.1 NCBI
GAAUUCUAACGGCUGAGCUCUUGGAAGACUUGGGUCCUUGGGUCGCAGG… 2616 nt 0.4652
NM_001424419.1 NCBI
GAAUUCUAACGGCUGAGCUCUUGGAAGACUUGGGUCCUUGGGUCGCAGG… 2630 nt 0.4669
NM_001424420.1 NCBI
GAAUUCUAACGGCUGAGCUCUUGGAAGACUUGGGUCCUUGGGUCGCAGG… 2841 nt 0.4801
NM_003600.4 NCBI
GAAUUCUAACGGCUGAGCUCUUGGAAGACUUGGGUCCUUGGGUCGCAGG… 2258 nt 0.4650
NM_198433.3 NCBI
GAAUUCUAACGGCUGAGCUCUUGGAAGACUUGGGUCCUUGGGUCGCAGG… 2466 nt 0.4732
NM_198434.3 NCBI
GAAUUCUAACGGCUGAGCUCUUGGAAGACUUGGGUCCUUGGGUCGCAGG… 2157 nt 0.4534
Showing 1 to 10 of 13 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a cell cycle-regulated kinase that appears to be involved in microtubule formation and/or stabilization at the spindle pole during chromosome segregation. The encoded protein is found at the centrosome in interphase cells and at the spindle poles in mitosis. This gene may play a role in tumor development and progression. A processed pseudogene of this gene has been found on chromosome 1, and an unprocessed pseudogene has been found on chromosome 10. Multiple transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for AURKA Gene

Forensic Context

A study in mice and human samples demonstrated that the AURKA is induced by NANOG as a mediator in its pathway to phosphorylate NUMB, promoting tumor-initiating stem-like cell genesis and hepatocellular carcinoma development [Machida et al. DOI:10.1016/J.Cbi.2020.109055].