Basic Information

Symbol
BAG6
RNA class
mRNA
Alias
BAG Cochaperone 6 G3 D6S52E Scythe BAT3 BAG Family Molecular Chaperone Regulator 6 Large Proline-Rich Protein BAG6 HLA-B-Associated Transcript 3 BCL2 Associated Athanogene 6 Protein Scythe Protein G3 BAG-6 Large Proline-Rich Protein BAT3 HLA-B Associated Transcript 3 BCL2-Associated Athanogene 6
Location (GRCh38)
6:31638544-31652747
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001387994.1
Sequence length
3843.0 nt
GC content
0.6008

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1559.52 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1623.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1242.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001098534.2 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3641 nt 0.5952
NM_001199697.2 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3066 nt 0.5861
NM_001199698.2 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3588 nt 0.5953
NM_001387940.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3499 nt 0.5953
NM_001387942.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3531 nt 0.5961
NM_001387943.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3552 nt 0.5963
NM_001387944.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3558 nt 0.5964
NM_001387946.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3576 nt 0.5965
NM_001387949.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3588 nt 0.5973
NM_001387951.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3591 nt 0.5973
Showing 1 to 10 of 59 entries
Summary

This gene was first characterized as part of a cluster of genes located within the human major histocompatibility complex class III region. This gene encodes a nuclear protein that is cleaved by caspase 3 and is implicated in the control of apoptosis. In addition, the protein forms a complex with E1A binding protein p300 and is required for the acetylation of p53 in response to DNA damage. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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