Basic Information

Symbol
BIN2
RNA class
mRNA
Alias
Bridging Integrator 2 BRAP-1 Breast Cancer-Associated Protein 1 Breast Cancer Associated Protein BRAP1 BRAP1
Location (GRCh38)
12:51281038-51324668
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016293.4
Sequence length
2231.0 nt
GC content
0.5025

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-700.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -742.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 577.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001290007.2 NCBI
CUGUUUCUCUCUUUCAAGCCCGGCUCGGGUGUCCUGCCUGCUUUCUGCA… 2234 nt 0.4906
NM_001290008.2 NCBI
ACUUCCUCCUCGGGGGCCUCAGAAAACCACAGGGCGCGGGGCCAGGGCG… 2135 nt 0.5054
NM_001290009.2 NCBI
ACUUCCUCCUCGGGGGCCUCAGAAAACCACAGGGCGCGGGGCCAGGGCG… 2801 nt 0.4863
NM_001364779.1 NCBI
ACUUCCUCCUCGGGGGCCUCAGAAAACCACAGGGCGCGGGGCCAGGGCG… 2228 nt 0.5022
NM_001364780.1 NCBI
ACUUCCUCCUCGGGGGCCUCAGAAAACCACAGGGCGCGGGGCCAGGGCG… 2150 nt 0.5042
NM_001364781.1 NCBI
ACUUCCUCCUCGGGGGCCUCAGAAAACCACAGGGCGCGGGGCCAGGGCG… 2069 nt 0.5070
NM_016293.4 NCBI
ACUUCCUCCUCGGGGGCCUCAGAAAACCACAGGGCGCGGGGCCAGGGCG… 2231 nt 0.5025
Summary

Enables phospholipid binding activity. Involved in several processes, including phagocytosis, engulfment; plasma membrane tubulation; and podosome assembly. Located in phagocytic cup and podosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.