Basic Information

Symbol
CAP1
RNA class
mRNA
Alias
Cyclase Associated Actin Cytoskeleton Regulatory Protein 1 CAP Adenylate Cyclase Associated Protein 1 Adenylyl Cyclase-Associated Protein 1 CAP, Adenylate Cyclase-Associated Protein 1 (Yeast) Testis Secretory Sperm-Binding Protein Li 218p CAP, Adenylate Cyclase-Associated Protein 1 CAP1-PEN CAP 1
Location (GRCh38)
1:40039735-40072767
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006367.4
Sequence length
2626.0 nt
GC content
0.4692

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-798.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -847.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 772.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001350483.2 NCBI
GAGAUUGCUGGGCGGUUCUUGCCGGAAGCGGAGAGCGGCUGAUCGCAGU… 2608 nt 0.4682
NM_001350484.2 NCBI
GAGAUUGCUGGGCGGUUCUUGCCGGAAGCGGAGAGCGGCUGAUCGCAGU… 2688 nt 0.4699
NM_001350485.2 NCBI
GAGAUUGCUGGGCGGUUCUUGCCGGAAGCGGAGAGCGGCUGAUCGCAGU… 2605 nt 0.4679
NM_006367.4 NCBI
GAGAUUGCUGGGCGGUUCUUGCCGGAAGCGGAGAGCGGCUGAUCGCAGU… 2626 nt 0.4692
Showing 11 to 14 of 14 entries
Summary

The protein encoded by this gene is related to the S. cerevisiae CAP protein, which is involved in the cyclic AMP pathway. The human protein is able to interact with other molecules of the same protein, as well as with CAP2 and actin. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Aug 2016]

Forensic Context

A study in human patients and mouse models demonstrated that the CAP1 is a potential diagnostic marker for sepsis, with its expression on monocytes significantly upregulated in sepsis patients and validated in LPS-induced mouse models via flow cytometry [Li et al. DOI:10.1016/j.intimp.2024.111938].