Basic Information

Symbol
CCN5
RNA class
mRNA
Alias
Cellular Communication Network Factor 5 CTGF-L CT58 WISP-2 WISP2 Connective Tissue Growth Factor-Related Protein 58 Connective Tissue Growth Factor-Like Protein WNT1 Inducible Signaling Pathway Protein 2 CCN Family Member 5 WNT1-Inducible-Signaling Pathway Protein 2 CTGFL
Location (GRCh38)
20:44714270-44728509
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003881.4
Sequence length
1279.0 nt
GC content
0.6372

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-593.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -610.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 227.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001323369.2 NCBI
CAAAGCUGGCUCUGCAGGGGACAUGAGAGGCACACCGAAGACCCACCUC… 1032 nt 0.6221
NM_001323370.2 NCBI
AGAGUCAGGGCCACGGAGCUUAGGAGACCUUGGGUCAGCUCUGCAAAGG… 1583 nt 0.6273
NM_003881.4 NCBI
CAAAGCUGGCUCUGCAGGGGACAUGAGAGGCACACCGAAGACCCACCUC… 1279 nt 0.6372
Summary

This gene encodes a member of the WNT1 inducible signaling pathway (WISP) protein subfamily, which belongs to the connective tissue growth factor (CTGF) family. WNT1 is a member of a family of cysteine-rich, glycosylated signaling proteins that mediate diverse developmental processes. The CTGF family members are characterized by four conserved cysteine-rich domains: insulin-like growth factor-binding domain, von Willebrand factor type C module, thrombospondin domain and C-terminal cystine knot-like (CT) domain. The encoded protein lacks the CT domain which is implicated in dimerization and heparin binding. It is 72% identical to the mouse protein at the amino acid level. This gene may be downstream in the WNT1 signaling pathway that is relevant to malignant transformation. Its expression in colon tumors is reduced while the other two WISP members are overexpressed in colon tumors. It is expressed at high levels in bone tissue, and may play an important role in modulating bone turnover. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human and rat corpus cavernosum identified the CCN5 as a secreted protein whose expression was negatively correlated with the COMP+ fibroblast niche score [Yin et al. DOI:10.1016/j.celrep.2024.114760]. A study in humans demonstrated that the CCN5 shows a similar expression pattern and spatial localisation as PI16 in fibroblast subclusters FB3 and FB5 within the corpus cavernosum, as validated by immunohistochemical staining [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9].